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DNA抽出から解析までの全工程をお引受けします。
顔を含む皮膚の細菌叢について、お客様ご自身で採取いただいたサンプルをお送りいただいたのち、微生物のゲノムDNAを抽出し、自社で所有している次世代シーケンサー（MiSeq illmina社）により大量配列解析を行います。得られた配列から、相同性検索および系統分類解析を実施し、データベース内の配列と高い相同性を示す配列が存在する場合は、種レベルまで微生物叢の特定が可能です。1キットより抽出されたDNAから3タイプのメタゲノム解析が可能です。お客様のご要望に応じた解析をお引き受けいたします。
取得した生リードをクオリティフィルタリング！ドラフトゲノム配列から遺伝子を予測※解析事例集進呈中
海洋研究開発機構 深海・地殻内生物圏研究分野の先生より、 新規海洋性プロテオバクテリアを提供いただき、解析した結果を ご紹介します。 次世代シーケンサー(MiSeq)を使用して、シーケンシング解析を行い、 paired-endリードを取得。 取得した生リードをクオリティフィルタリングした後、アセンブルを行い、 さらにドラフトゲノム配列から遺伝子を予測しました。 【事例概要】 ■生リード：7.3M paired-endリード(2x300bp) ■アノテーションデータ ・遺伝子数：2,417 ・rRNA：6 ・tRNA：49 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
