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ソフト×株式会社モルシス - メーカー・企業と製品の一覧

ソフトの製品一覧

1~15 件を表示 / 全 111 件

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卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分けできる使用モード ■低分子・フラグメント・標的タンパク質データベース ■新機能開発やカスタマイズ ■サードパーティ製品との連携 ■Windows/Mac/Linuxに対応 ■計算化学者、実験研究者が広く利用 ■医薬、農薬、食品、材料設計などの様々な分野に対応 【搭載アプリケーション】 ■分子モデリング ■配座解析・分子動力学計算・量子化学計算 ■ドッキングシミュレーション ■構造活性相関・ケモインフォマティクス ■タンパク質・抗体モデリング ■変異体構築・タンパク質/ペプチドデザイン ■核酸モデリング ■ファーマコフォア解析 ■フラグメント構造に基づく分子設計

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量子化学計算ソフトウェア『ADF』

豊富なプロパティ計算機能!様々な系に適用可能な密度汎関数法ソフトウェア

『ADF』は、密度汎関数法に基づく量子化学計算ソフトウェアです。 均一系・不均一系触媒から無機化学、重元素科学、生化学、各種分光学まで幅広い分野の研究に利用されています。遷移金属を含んだ系でもSCF計算の収束がよく、重元素系で重要な相対論の効果を含めることができます。さらに、周期表の全元素に対応した全電子計算用の基底関数(Slater型)を完備していることは当製品の大きな特長です。

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材料設計支援統合システム『MedeA』

第一原理バンド計算による「材料設計」!

『MedeA』は、材料設計のための統合的な計算環境です。 第一原理バンド計算を基に、材料(金属・セラミックス・半導体など)に対する、各種物性(構造、光学物性、磁性、熱力学物性、弾性、振動、電子伝導性)を評価することができます。

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NGSデータ解析ソフトウェア『Partek Flow』

次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行!RNA-seqをはじめ様々なアプリケーションのデータ解析に対応!

『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析(RNA-seq, Single Cell RNA-seq) ■miRNA発現解析(miRNA-seq) ■ゲノムリシーケンス解析(DNA-seq) ■転写因子結合部位解析(ChIP-seq) ■メチル化部位解析(MeDIP-seq) ■メタゲノム解析 【対応機器】 ■イルミナ(HiSeq, NextSeq, MiSeq, MiniSeq) ■サーモフィッシャー(Ion S5, Ion Proton, Ion PGM) 『Partek Flow』は、ウェブブラウザーから操作するのでコマンド入力したりパラメーターを手入力する必要はありません。インストールしたサーバーに接続可能なネットワーク上のあらゆるマシンから利用できます。読み込んだデータの種類に対応した解析メニューを表示しますので、データ解析に慣れていないウェットの研究者でも簡単に操作できます。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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対話型 SBDD ツール『SeeSAR』

メディシナルケミストのための受容体ポケット中でのリード最適化ツール

『SeeSAR』は、滑らかで美しい 3D モデルにより、リガンド-受容体間の相互作用を理解し、リガンドの物性値やADMEプロパティを評価しながら、対話的に新規リガンドを設計できるソフトウェアです。 リガンド原子毎の結合自由エネルギー寄与を算出し色付け、ねじれ角の妥当性の検証、リガンドの物性値、ADMEプロパティ、ポケット中の原子の存在しない空間等を分子をマニュアルで編集しながらリアルタイムにモニタリングできます。 ドッキングシミュレーションによるリガンドの配置、フラグメント交換や付加によるリガンド候補の出力を組み合わせて、研究者にあらたなリガンド候補を提案をします。 【特長】 ■高速な結合自由エネルギー推算 ■容易な操作と理解しやすいインターフェース ■視覚的かつ即座にリガンド候補の優先順位を決定 ■ΔGや物性値の改善を支援 ■母核置換、フラグメント連結、フラグメント付加 ■ドッキングシミュレーション ■ADME予測機能 ■結晶構造を解析した二面角の妥当性チェック ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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量子化学計算ソフトウェア『TURBOMOLE』

励起状態の構造・プロパティを高速に算出!高速な量子化学計算ソフトウェア

『TURBOMOLE』は、非経験的量子化学計算ソフトウェアです。分子の光学スペクトルなどのプロパティ計算や触媒反応の解析などに用いられ、多くの成果をもたらしています。 時間依存密度汎関数法(TD-DFT)を用いて励起エネルギーの算出および励起状態の構造最適化を行うことが可能です。また、円二色性スペクトル(ECD)や励起状態構造の振動計算の機能も搭載されています。 当製品の高速なDFT計算機能により、比較的サイズの大きな分子の励起エネルギーや励起状態構造の最適化も取り扱うことができます。

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量子化学計算ソフトウェア『ADF2017』

TDDFT法による第二超分極率の計算が可能や二光子吸収の計算が可能に!

『ADF2017』は、30年以上の歴史を誇る密度汎関数法 (DFT) を用いた 量子化学計算ソフトウェア「ADF」の、2017年リリースバージョンです。 分子系では、通常の密度汎関数法(DFT)では記述の難しいd→dや、f→d遷移 の計算を可能にするLigand Field DFT法の搭載や、TDDFT法による第二超分 極率の計算、特に二光子吸収の計算ができるようになりました。 また、周期系では非平衡グリーン関数(NEGF)法を搭載により、二つの電極に はさまれた単一分子のバリスティック伝導の計算に対応しました。 【特長】 ■密度汎関数法 (DFT) を用いた量子化学計算ソフトウェア ■Ligand Field DFT法/非平衡グリーン関数(NEGF)法を搭載 ■TDDFT法による第二超分極率の計算が可能 ■二光子吸収の計算が可能 ■二つの電極にはさまれた単一分子のバリスティック伝導の計算に対応 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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対話型SBDDツール『SeeSAR 5.5』

リガンドの結合サイト予測機能で、結合親和性の評価まで一連の解析が可能に!

『SeeSAR 5.5』は、メディシナルケミストのために設計された、 独BioSolveIT社製リード化合物最適化ツールです。 当製品は、既知のリガンド結合部位内における原子や母核の置換による リガンド修飾や、リガンドの物性とADME特性の計算、受容体との結合親和性の 評価等を組み合わせてシームレスな分子設計を可能にします。 今回のバージョンアップでは、リガンドが結合する可能性のあるサイトの予測 が可能になったほか、リガンド構造とそのプロパティーを総合的に評価する ために、一覧表示が追加され、より迅速な解析が可能になりました。 【特長】 ■メディシナルケミストのために設計 ■シームレスな分子設計が可能 ■リガンドの結合サイト予測機能 ■受容体-リガンドの相互作用解析が可能 ■リガンドのタイル表示とプロパティーのレーダーチャートのサポート ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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熱力学物性推算ソフトウェア『COSMOtherm』

Ver. C30では推算精度と計算速度が向上!純物質の引火点予測などが可能に

『COSMOtherm』は、物性推算法COSMO-RS法を用いた熱力学物性推算ソフト ウェアです。任意の化合物や混合溶液の蒸気圧・分配係数など様々な平衡 物性を推算可能です。 使用するCOSMO-RS法は量子化学計算で得られる分子の表面電荷情報と 分子統計力学に基づき、溶液中の分子の化学ポテンシャルを算出し、得られた 化学ポテンシャルを用いて、様々な平衡熱力学物性を算出します。 オプションとして、種々の溶媒分子を含む4000種類以上の有機化合物の 電荷分布データを収めたデータベースCOSMObaseも用意されていますので、 量子化学計算の手間を省くことも可能です。 【特長(Ver. C30 Release 17.01)】 ■純物質および混合物の引火点予測 ■臨界定数予測、ならびに状態方程式(EOS)との連携機能 ■液液平衡(LLE)予測における熱的ゆらぎに対する理論的補正 ■既存機能の改善や改良が図られ、推算精度と計算速度が向上 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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量子化学計算ソフトウェア『Gaussian 16』

スペクトル計算における新機能や、計算速度向上を図る機能を追加!

「Gaussian」は、世界的に広く利用され、分子設計・構造解析・化学反応解析 などで、多大な成果をもたらしている量子化学計算ソフトウェアです。 メジャーバージョンアップ版『Gaussian16』では、励起状態の取り扱いや スペクトル計算における新機能や、計算速度向上を図る機能が追加されました。 時間依存密度汎関数法(TD-DFT)を用いた解析的振動計算により、IR・Raman スペクトル、遷移状態構造の最適化とIRC 計算が可能になったほか、 Hartree-FockおよびDFT計算におけるGPU計算へ対応しています。 【新機能】 ■時間依存密度汎関数法(TD-DFT)を用いた解析的振動計算 ■振動スペクトルの非調和項の考慮 ■分子振動準位を考慮した電子円偏光スペクトル、共鳴ラマンスペクトルの計算 ■EOM-CC法による構造最適化 ■新しいDFT汎関数(M08HX, MN15, MN15L) ■新しい半経験的手法(PM7) ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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量子化学計算ソフトウェア『TURBOMOLE』リリース

PBC計算機能が大幅に拡張!量子化学計算ソフトウェアTURBOMOLEの新バージョン7.2がリリース

量子化学計算ソフトウェアTURBOMOLEの新バージョン7.2がリリース。新バージョンに搭載された新機能や改善された機能について紹介します。 【バージョンアップ内容】 ■周期境界条件を用いた計算機能の拡張 ユニットセルの構造最適化が可能になったことで、セルサイズが不明なモデルが取り扱えるようになり、様々な計算対象に用いることが可能 ■Bethe-Salpeter方程式に基づく励起エネルギー GWとBSEを組み合わせた励起エネルギーの計算が可能 ■CC2法によるりん光寿命の計算 CC2法を用いることでDFTの問題点を回避すると共に計算コストを抑えたスピン軌道相互作用の考慮を実現 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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熱力学物性推算ソフト『COSMOtherm』※適用事例集進呈

化合物、混合溶液などの幅広い物性予測を実現。医薬品・製剤プロセス等の各種設計に

『COSMOtherm』は、気液・液液・固液平衡、酸解離定数、反応平衡定数、 イオン液体の各種プロパティ等の「熱力学物性」を予測するソフトウェアです。 COSMO-RS法により、分子の構造情報から直接、熱力学物性を推算し 特殊な仮定を用いず、有限希釈・無限希釈の両方を高精度に予測できます。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。 ★さらに、適用事例集をプレゼント中です★ (下記「ダウンロード」ボタンからご覧いただけます。) 【事例集の内容】 ■気液平衡推算 (蒸気圧推算、2成分系気液平衡、臨界点近傍の気液平衡推算) ■液液平衡推算 (2成分系・3成分系の液液平衡、3成分3相平衡推算) ■固液平衡推算 (相対溶解度による溶媒スクリーニング、2成分固液平衡推算) ※詳しくは資料をご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。

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力場計算支援ソフトウエア『Direct Force Field』

材料科学、生命科学向け力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により力場計算の問題を解決

「力場パラメータが足りなくて計算できない」、「化学的に誤った構造を結果として与える」、これらは、分子シミュレーションソフトウェアに付属する力場パラメータを利用して計算を行うと、しばしば直面する問題です。 Direct Force Fieldは、開発元の提供する高精度な力場パラメータを登録した力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により、力場パラメータの問題を解決します。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。

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MOE Extensions for KNIME Ver.2.4

MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解析処理を可視化・保管できます

KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。 ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。 プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。 MOEノードと、既存のデータマイニングやマシンラーニング(機械学習)などのノード、サードパーティ製品のノードも自由に組み合わせることができ柔軟なワークフローの設計が可能になります。

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【技術情報】CORINAClassic/Symphony製品紹介

配座発生/分子データセット管理とプロファイリング!製品の概要などを掲載!

当資料では、MN-AM社製「CORINA Classic」および「CORINA Symphony」 について掲載しています。 各製品の概要をはじめ、分子構造標準化などの機能をご紹介しております。 【掲載内容】 ■CORINA Classic 概要 ■CORINA Symphony 概要 ■分子構造標準化 ・フラグメントの除去 ・水素原子の付加 ・分子構造の中性化 ・重複分子の削除 他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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