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MedeAユーザー会がフランスで開催されました！日本ではJFCCにて開催
「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に 各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 開発元であるMaterials Design社では、ユーザー会を例年開催しており 昨年は9月にフランスで開催しました。 また、日本では11月にJFCC（ファインセラミックスセンター）にて セミナーを開催し、新開発動向や適用事例を紹介しました。 【概要】 ■MedeA ユーザー会 ・世界中から50名程のユーザーが参加 ・「ハンズオントレーニングセッション」では、モデリングや解析方法を演習 ・「サイエンティフィックプログラム」と称し、ユーザーからの研究報告や 開発元からの新動向が発表 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
分子膜透過性予測ソフトウェアCOSMOpermリリース！予測精度などをご紹介
当資料では、「COSMOperm」の予測方法と予測精度について掲載しています。 COSMOlogic社新製品として、低分子の分子膜透過性を予測する ソフトウェアがリリースされます。 本製品は、既存の分子膜・ミセル内分子分布シミュレーター「COSMOmic」で 算出される分子膜中の分配係数と新たに考案されたCOSMO－RS法に基づく 拡散係数予測式を用いて膜透過性を予測します。 【掲載内容】 ■COSMOpermの予測方法と予測精度 ■予測精度の検証事例 ・約40種の低分子の膜透過性が検討された ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MedeAの新版としてバージョン2.22がリリース！材料設計支援統合システム
当資料では、MedeAの新版としてリリースされたバージョン2.22について 掲載しています。 「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に 各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 新版では、VASP等の計算プログラムがアップデートされ、 新しい計算機能を使用できるようになりました。 【掲載内容】 ■MedeA 2.22アップデート内容 ・MedeA-VASP ・MedeA-GIBBS ・MedeA-LAMMPS ・MedeA-MOPAC ・MedeA-Gaussian 他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
統合計算化学システムMOE-QFSSの新バージョンについてご紹介！
当資料では、QFSSの概要と新機能、構造検索事例について掲載しています。 「MOE-QFSS」は、複数の巨大な化合物データベースに対して高速かつ 横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 新バージョンでは、公共データベースへのアクセスと MOE/web SOAPサーバーでの検索に対応しました。 さらに、QFSSのMOE/webアプリケーションを提供。それによって目的や 計算資源に応じたQFSSの実行環境を構築できます。 【掲載内容】 ■QFSS概要 ■QFSSによる検索 ■バージョンアップ内容 ■QFSSを用いた応用事例 ■QFSSの入手方法 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
化合物の物理化学的特性間などの実験値との関係を可視化して解析することが可能！
当資料では、ニューラルネットワーク手法に基づくデータ解析が可能な SONNIAについて掲載しています。 MN-AM社製「SONNIA」は、自己組織化ニューラルネットワーク手法に 基づいて低分子化合物のクラスター解析とQSA(P)R解析を行います。 データの入出力、計算の設定、結果の表示に対話的かつグラフィカルな インターフェースを提供し、化合物の物理化学的特性間あるいはそれらと 生物活性等の実験値との関係を可視化して解析することができます。 【掲載内容】 ■SONNIA 概要 ■SONNIAの主な機能 ■応用事例紹介 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MIのためのハイスループット計算ツール！材料設計支援統合システムをご紹介！
『MedeA-HT』は、信頼性の高い計算データの大量生成・解析のための ツールとして開発された材料設計支援統合システムです。 また、当システムは、原子・分子スケールのシミュレーション技術を 基に各種の物性評価を行うための統合支援環境「MedeA」に搭載されており、 マテリアルズインフォマティクスに不可欠なシミュレーションによる 大量データ生成を簡便に行うことが出来ます。 そして、固体の電子状態については「MedeAVASP」、分子が対象で あれば「Gaussian」や「MOPAC」、力場計算であれば「MedeA-LAMMPS」 や「MedeA-GIBBS」を選択することができます。 当資料では、機能と特長、事例も含めご紹介します。 【掲載内容】 ■マテリアルズインフォマティクス ■MedeA-HT LaunchpadとStructure list ■MedeA-HT Descriptors ■適用事例：融点の推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
セミナーで紹介された3つの応用事例やSciMAPS 4.2リリース情報を掲載！
「SciMAPS」は、、外部プログラムとの連携を前提とした、拡張性の高い 設計思想を持つ材料設計支援プラットフォームです。 使いやすいモデル構築機能、データ解析機能が標準装備され、大学や研究機関で 開発された世界的に定評のある先進の計算プログラムを統一された操作で利用できます。 最新版リリースに先立ち、開発元の研究者を招聘して6月末に開催された MOLSIS特別セミナーの報告とSciMAPS最新版の4.2の概要についてご紹介します。 【掲載内容】 ■MOLSIS特別セミナー ■SciMAPS 4.2リリース情報 ・粗視化モデルのサポート強化 ・LAMMPSの物性計算と解析機能の追加 ・Crosslinkerの改良 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MedeA-HTを用いたSlater-Pauling 曲線の作成例をご紹介
MedeAは原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を 行うための統合支援環境です。 第一原理計算が比較的容易に行える現在において、データ生成を目的とし 異なるモデル構造に対して、同じ計算を繰り返し実行する場面が増えています。 「MedeA-HT 機能」を活用することで、そうした大量の繰り返し計算を 簡単に自動化することができます。 当資料では『MedeA-HT』を用いたSlater-Pauling曲線の作成例を示します。 Slater-Pauling曲線とは、合金中の組成の違いによる磁気モーメントの変化を プロットした図のことです。 【掲載内容】 ■本稿の概要 ■フローチャートを用いた計算の設定 ■計算結果 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「infiniSee」の概要や探索アルゴリズムなどについて詳しく解説！
独BioSolveIT社から、膨大なバーチャル化合物群の中よりクエリーと類似する 構造を高速に探索するソフトウェア「infiniSee」がリリースされました。 通常では閲覧が難しい数十億を超えるバーチャル化合物群の中より、 合成可能性の高い新規構造を数分という短い時間で提案できます。 当資料では、製品の概要や解析事例などをご紹介しています。 【掲載内容】 ■infiniSeeの概要 ■探索アルゴリズム ■操作の流れ ■infiniSeeとREAL Space Navigator ■解析事例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
自己組織化構造予測/分子膜透過性推算ソフトウェアの概要などを詳しく解説！
新製品「COSMOplex」「COSMOperm」が正式リリースされました。 両製品は、これまで分子膜・ミセル内分子分布シミュレーターとして 提供されていたCOSMOmicを改良・発展させた製品です 当資料では、両製品の概要と応用事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■COSMOmicとCOSMOplex ■COSMOperm ■応用事例：ミセル構造予測とミセル内の分布予測 ■応用事例：低分子の上皮透過性予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
熱力学物性推算ソフトウェアの新機能などを詳しく解説！
熱力学物性推算ソフトウェア「COSMOtherm」の新バージョン19が リリースされました。 当資料では、新バージョンに搭載された新機能や改良された機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■新バージョンのトピックス ■状態方程式(EoS)を用いた物性推算機能の追加 ■液液平衡探索と共晶点探索機能 ■BP-TZVPD-FINEレベルの物性推算精度の向上 ■活量係数モデルへのフィッティング機能の強化 ■COSMO-RS-DARE機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
創薬支援ツール等の新製品情報をはじめ、技術情報などを多数掲載！
独 BioSolveIT社から、膨大なバーチャル化合物群の中より類似構造を高速に 探索するソフトウェア「infiniSee」がリリースされました。 当資料では、熱力学物性推算ソフトウェアなどの新製品情報をはじめ、 医薬品安全性情報サービスなどの技術情報についてご紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■新製品情報 ・COSMOtherm バージョン19リリース ・COSMOplex・COSMOpermリリース ・バーチャルライブラリー高速探索ツール infiniSee ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「GENEVESTIGATOR」を用いた解析事例を掲載！ がん免疫療法の新規標的遺伝子の探索事例の紹介
「GENEVESTIGATOR」は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。 当資料では、マウスがん細胞の遺伝子発現データを使った がん免疫療法の新規標的遺伝子の探索事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■はじめに ■PD-1の遺伝子発現 ■PD-1と共発現する遺伝子 ■細胞ごとの発現パターン ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
データ解析の専門家からデータ解析が専門でない実験研究者まで幅広くご利用可能です
当資料では、『Partek Flow 8.0』の新機能を紹介しております。 『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータの解析から解析結果の 可視化までを行います。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインターフェース （GUI）上でパラメーターを選択しコマンドを実行。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析が専門でない実験研究者まで 幅広くご利用いただけます。 【掲載概要】 ■Partek Flowの製品概要 ■擬時間解析 ■UMAP プロットによる次元削減 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
類似の官能基を同じ色で表現することで、研究者によるヒット構造からの適切な選択を支援します
『infiniSee』は、既存の化合物ライブラリーあるいは、10^20個を超える バーチャル化合物群の中より類似構造を高速に探索するソフトウェアです。 新規構造、SAR展開、特許を回避した構造など、目的に応じた候補構造を 簡単な操作で発見できます。 創薬における加速化と低コスト化を実現します。 【特長】 ■超高速ケミカルスペースナビゲーション 分単位で10^20構造を探索 ■容易なスキャフォールドホッピング FTreesFSアルゴリズムを用いた構造構築 ■構造類似性の可視化 分かりやすい表示による候補構造の決定 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
