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【技術資料】医薬品開発に携わる研究者や部門においてご活用いただける趣旨を掲載！
トランスレーショナルリサーチでは、前臨床研究の成果を臨床研究に 効率的に橋渡しすることと同時に、市販後の安全性の監視で得られた 情報を新たな治療薬の開発にフィードバックすることが求められます。 当資料では、医薬品開発に携わる研究者やさまざまな部門において、 それぞれの目的に応じてご活用いただける趣旨を掲載しております。 【掲載内容】 ■生物学研究者および情報生物学研究者 ■メディシナルケミストおよび情報化学研究者 ■毒性学・安全性薬理学研究者 ■臨床開発研究者 ■レギュラトリーサイエンス ■ファーマコビジランス ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
熱活性化遅延蛍光(TADF)材料の計算結果を詳しくご紹介しております
量子化学計算ソフトウェアADFの『遅延蛍光材料の励起状態計算』 について当資料では詳しく解説しております。 有機ELに用いられるメタルフリーな発光材料として近年注目を 集めている、熱活性化遅延蛍光(TADF)材料の計算結果を詳しくご紹介。 「スピン軌道相互作用の行列要素の計算」や「Franck-Condonの重み付き 状態密度の計算」などを掲載しております。 【掲載内容】 ■はじめに ■逆項間交差(RISC)の速度定数の評価 ・スピン軌道相互作用の行列要素の計算 ・Franck-Condonの重み付き状態密度の計算 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
機械物性をシミュレーションするためのソフトウェア / 第一原理計算 MedeA-VASP / マテリアルズインフォマティクス
【技術資料】 材料設計支援統合システム『MedeA』は、原子スケールのシミュレーション技術により機械物性を推算することができるソフトウェアです。当ソフトウェアで推算可能な物性にビッカース硬さが新たに加わりました。材料の組成（およびその結晶構造）の情報のみを元にしてビッカース硬さを精度良く推算することができます。 当資料では、第一原理計算によってビッカース硬さを推算する方法とその適用事例を紹介します。さらなる展開として、マテリアルズインフォマティクスへの展開やそのための支援機能もあわせて紹介します。 【掲載内容（抜粋）】 ■材料設計支援統合システム【MedeA』 ■第一原理計算プログラム『VASP』 ■ビッカース硬さ / 弾性定数 / 機械物性 ■計算手法 ■計算結果 ■マテリアルズインフォマティクスへの展開 ■ハイスループット機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
統合計算化学システム「HLA-Modeler」「HLABAP」の概要と特長および解析例をご紹介
ヒト白血球型抗原（HLA）の立体構造は細胞性免疫の分子機構を解明する ために重要な分子です。 当社では、MOE上で動作するHLAに特化したホモロジーモデリングツール 「HLA-Modeler」とHLA 結合抗原性ペプチド予測ツール「HLABAP」を 開発しました。 「HLA-Modeler」は、構造未知のHLA の立体構造を既知のHLAの構造を参照し 予測。「HLABAP」はHLA に結合する任意のペプチドの結合強度を予測し、 親和性の高いペプチド配列を提案します。 当資料では、これらのツールの概要と特長および解析例について説明します。 【掲載内容】 ■HLA-Modeler の概要 ■HLA-Modeler の特長 ■HLABAP の概要 ■HLABAP の特長 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
データのキュレーションや製品概要、「Dimension Reduction Tool」についてご紹介！
『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析が可能。 また、当ツールは使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを 搭載しているため、研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を 行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを 簡単かつ正確に行うことができます。 当資料ではデータのキュレーションや製品概要、また新しく追加された 「DimensionReduction Tool」について紹介します。 【掲載内容】 ■遺伝子発現データのキュレーション ■GENEVESTIGATOR の製品概要 ■Dimension Reduction Tool ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
研究情報管理統合プラットフォーム「Scilligence」と連携で効率的な研究が可能！
米国Scilligence 社製『TouchMol4Office』は、Microsoft Office への プラグインです。 Microsoft Officeの各ソフトウェア内で化学的・生物学的機能を用いて 構造情報を含む研究データを整理することができ、研究データの解析や レポート作成を容易に行えます。 また、Scilligence ELN（電子実験ノート）などと連携して利用すること により研究を効率的に行えます。 当資料では、当製品の概要と機能についてご紹介します。 【掲載内容】 ■概要 ■機能 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご利用可能！
『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-Seqや DNA-Seq、ChIP-Seq、Single Cell RNA-Seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 また、搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザー インターフェース上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 当資料では、k-meansクラスタリングによる細胞の分類やマーカー遺伝子の 表示、UMAPによる次元削減、遺伝子リストの作成など、Single Cell RNA-seqデータ解析に有用な機能について紹介します。 【掲載内容】 ■クラスタリング ■次元削減による可視化 ■発現変動遺伝子リスト ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
創薬モダリティに興味のある方必見！ 3つのライフサイエンスソフトウェアを紹介！
《情報計算化学生物学会 2020 年大会で開催したモルシス企業セミナーの動画のリンクと資料をご提供します。》 創薬モダリティの多様化に伴い、創薬研究支援ソフトウェアにはモダリティに対応した機能が求められています。弊社取り扱い製品の中から「統合計算化学システム MOE」、「研究情報管理統合プラットフォーム Scilligence」、「医薬品安全性情報ポータル OFF-X」の３製品について創薬モダリティ関連の機能を紹介します。 ・MOE 低分子、ペプチド、タンパク質、抗体、核酸のデザインとシミュレーションに対応した統合計算化学プラットフォーム ・Scilligence 多様な創薬モダリティの研究データに対応した研究情報管理統合プラットフォーム ・OFF-X 規制機関、学術論文、学術会議、企業等の情報源から収集された前臨床試験の毒性情報と臨床試験および市販後の安全性情報を統合し、解析機能と組み合わせて情報提供する医薬品の安全性情報ポータル ※詳しくはPDFダウンロード、またはお問い合わせください。
MDシミュレーションのインターフェースが一新！メニューバーもさまざまな言語に変更可能！
当資料では、統合計算化学システム『MOE 2020.09』の主な新機能や機能強化を ご紹介しています。 日本語をはじめとする多言語がサポートされるようになり、大規模計算のための フレームワークなどが新機能として追加。 また、ドッキング、タンパク質の物性推算、抗体モデリング、MOEsaicの機能も 強化され、プロジェクトデータベースも更新されました。 【掲載内容】 ■日本語などの多言語のサポート ■ONIOM法によるQM/MM計算 ■MDシミュレーションインターフェースの 機能拡張と再生プレイヤーの追加 ■HPCフレームワークの強化 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
新たに2つの目的に対する力場が追加！5つの系統の陽イオンと12種類の陰イオンに対応！
「Direct Force Field」は、力場作成とAeon社の開発した力場を利用するための ソフトウェアです。 力場を作成するために必要な機能を簡単な手順で利用できるようになっており、 開発された力場を管理するデータベースが搭載されています。 当資料では、2020年12月にリリースされた新バージョン『Direct Force Field 7.2』 についてご紹介しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■Direct Force Field 概要 ■新機能の紹介 ■参照文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
創薬の高速化と低コスト化を実現する上で強力なツール！原理と適用事例についてご紹介
薬物様化合物のケミカルスペースは10^60構造存在するとも言われ、 従来のプログラムでは有効な時間内で検索することは不可能です。 BioSolveIT社『infiniSee』は、数百億を超える実際に合成可能かつ 購入可能な化合物ライブラリーから、ターゲット分子と化学的特長類似 化合物を高速に検索することができます。 当資料では、薬剤耐性菌が生産する「CTX-M β-lactamase」に対する 合成可能なリガンド類似化合物の検索を例に、『infiniSee』の原理と 適用事例についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■CTX-M β-lactamase 複合体の三次元構造 ■母核置換 ■infiniSee による合成可能な化合物ライブラリーの類似構造検索 ■SeeSAR によるドッキングとHYDE スコアリング ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
4つのウィンドウから構成！Expertモードによる入力ファイルの直接編集も可能！
「Molpro」は、配置問相互作用法、クラスタ展開法、多配置SCF法、 多配置参照摂動法など、電子相関の取り扱いに関する様々な計算機能を 搭載した量子化学計算ソフトウェアです。 当資料では、「Molpro」のグラフィカルユーザーインターフェース（GUI） 『gmolpro』についてご紹介しています。 是非、ダウンロードしてご覧ください。 【掲載内容】 ■gmolpro の構成と機能 ■稼働プラットフォーム ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能をご紹介！
「Reverse Fingerprint Modeling」は、MOEユーザーコミュニティーのための SVLコード交換サイトSVL Exchangeで公開されている統合計算化学システム MOEのアドオンプログラムです。 化合物のさまざまな分子フィンガープリントと活性値の情報を用いて、 活性化合物に共通の部分構造や活性/不活性に寄与する部分構造を特定したり、 ファーマコフォアモデルを構築/評価したりできます。 当資料では、「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■Reverse Fingerprint Modelingの概要 ■Motif Detection ■Virtual Pockets ■Fragment Placement ■Activity Scan ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
熱力学物性推算・高速量子化学計算ソフトウェア！2022年版のトピックスをご紹介
昨年12月にBIOVIA COSMOlogic製品の2022年版がリリースされました。 製品としては、BIOVIACOSMOtherm、BIOVIA COSMOconf、BIOVIA COSMObase、 BIOVIA COSMOplex&perm、ならびにBIOVIA TURBOMOLEの5製品です。 当資料では、2022年版の新機能や改善された機能について紹介します。 ぜひご一読ください。 【掲載内容】 ■2022年版のトピックス ■融点・融解熱予測のRandom Forestモデル ■複数CPUコアを使用したBIOVIACOSMOthermの並列計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
複数の手法によりPROTACを介した三元複合体構造の予測とモデリングを容易に行えます！
『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬の1つである PROTAC（Proteolysis Targeting Chimera）の開発を支援するためのMOEの カスタムアプリケーションです。 複数の手法によりPROTACを介した三元複合体（標的タンパク質-PROTAC-E3 リガーゼ）構造の予測とモデリングを容易に行えます。最近、三元複合体構造を モデリングするための新たな手法が追加されました。 当資料では、PROTAC Modeling Toolsに追加された手法の概要とその適用事例 について紹介します。 【掲載内容】 ■PROTAC Modeling Toolsの概要 ■PROTAC Modeling Toolsの追加手法 ■モデリング手法の精度 ■適用事例 ■アプリケーションの入手方法 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
