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解析(機構) - メーカー・企業と製品の一覧

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【次世代シーケンス解析事例】微生物ゲノムドラフト解析

取得した生リードをクオリティフィルタリング!ドラフトゲノム配列から遺伝子を予測※解析事例集進呈中

海洋研究開発機構 深海・地殻内生物圏研究分野の先生より、 新規海洋性プロテオバクテリアを提供いただき、解析した結果を ご紹介します。 次世代シーケンサー(MiSeq)を使用して、シーケンシング解析を行い、 paired-endリードを取得。 取得した生リードをクオリティフィルタリングした後、アセンブルを行い、 さらにドラフトゲノム配列から遺伝子を予測しました。 【事例概要】 ■生リード:7.3M paired-endリード(2x300bp) ■アノテーションデータ ・遺伝子数:2,417 ・rRNA:6 ・tRNA:49 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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