【解析概要】 ＜ゲノムドラフト解析＞ ■ゲノムDNA抽出(お客様にて実施) ■ライブラリー作製 ■シーケンス解析 ■アセンブル解析 ■オートアノテーション(オプション) ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【解析概要】 （1）当社：解析対象領域を増幅ターゲットとしたサンプル調製用プライマーを無償提供 （2）お客様：サンプル調製用プライマーを用いてPCRによるライブラリ調製を行っていただく （3）お客様：サンプル毎に精製・濃度測定し、等量混合したサンプルをお送りいただく （4）当社：受領サンプルのQC作業を行う （5）当社：QCをパスしたサンプルについて、MiSeqで2×250 bpランを行う （6）当社：QIIME等を使用し、「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」としてデータを可視化 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【ワークフロー】 ＜選択的膜透過性色素EMAを用いた群集構造解析＞ ■環境サンプル(熱処理、未処理)を用意 ■EMA処理 ■光照射 ■DNA抽出 ■EMA-PCRによるアダプターライブラリーの作成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【解析のワークフロー】 ■Sample Sequence Reads ■クオリティフィルタリング ■K-mer分布を用いた最近縁種の推定 ■近縁種へのマッピング ■MLST解析のための遺伝子領域の同定 ■MLSTデータベースを用いたMLST解析 ■K-mer 系統樹の作成 SNP系統樹 ※オプション解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【カスタムサービス(抜粋)】 ■ラン ・専有ラン(2×75bp) ・専有ラン(2×150bp) ・共有ラン(2×75bp) ■サンプル調製 ・RNA抽出 ・リボソーム除去 ・ライブラリ調製 ■データ解析 ・発現量算出(マッピング含む) ・発現比較解析 ・主成分解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他の事例概要】 ■サンプル調製はPCR産物の精製までで、クローニングは不要 ■得られた一つ一つのデータは解析対象であるPCR産物に含まれる1分子に由来 ■クローニング→サンガー法のシーケンス解析で得られた一つ一つのデータに相当 ■クローンライブラリー法とは比較にならないデータ量が得られる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【ワークフロー】 ■Sample Sequence Reads ■クオリティフィルタリング ■K-mer分布を用いた近縁種の推定 ■近縁種へのマッピング ■MLST解析のための遺伝子領域の同定 ■MLSTデータベースを用いたMLST解析 ■K-mer系統樹の作成　SNP系統樹　※オプション解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他の事例概要】 ■ドラフトゲノム配列 ・Contig：70 ・Scaffold：70 ・N50 [bp]：105,204 ・Longest [bp]：249,769 ・Total [bp]：2,500,556 ・GC％：48.7 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【サービス内容】 ■環境水からの受け入れ ■ステリベクスフィルターからの受け入れ ■ライブラリ調製-1stPCR4反復- ・8サンプルまで ・16サンプルまで ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【結果】 ■EMA処理をしていないサンプルに関してはライブラリーのDNA濃度及び群集構造、 　両方の結果に差異が見られなかった ■一方でEMA処理したサンプルについては熱処理をしたサンプルのライブラリー濃度は 　PCR増幅が阻害され濃度は低い ■群集構造解析では優占化した大腸菌が死滅したことによって熱処理したサンプルでは 　大腸菌はほとんど検出されなかった ■EMAによってDNAが不活性化されPCRの増幅が阻害されたことが予想される ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【事業内容詳細（抜粋）】 ■遺伝子検査事業部 ＜食品検査＞ 　・遺伝子組換え（GMO）検査 ＜食品検査用試薬・キット販売＞ 　・GMO分析試薬 ＜衛生管理対策＞ 　・JFS-A/B規格監査 ＜種苗検査・キット販売＞ 　・遺伝子組換え検査 ■バイオ研究支援事業部 　・DNA、RNA、PNA合成 　・人工遺伝子合成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

専有ラン、共有ランいずれも対応可能。 QC作業やライブラリ調整からも承っております。

～当社の中核事業～ ■食品分析事業 アレルゲン検査 遺伝子組み換え食品検査 バイオおよび食品検査関連試薬の提供 HACCPサポート・JFS監査 ■受託サービス事業 遺伝子解析・製造の委託業務 拡散合成の委託業務 ゲノム編集関連サービス