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土壌など環境検体の菌叢解析「環境関連アンプリコンシーケンス解析」

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最終更新日:2025年11月07日

株式会社テクノスルガ・ラボ
株式会社テクノスルガ・ラボ
  • 公式サイト

土壌、活性汚泥、環境水、バイオフィルム、培養液、発酵食品など幅広い検体の菌叢解析/DNA抽出、PCR、データ解析等トータルで受託

〇検体中の細菌、アーキア、菌類の菌叢(マイクロバイオーム)解析を受託するサービス。 〇土壌、水、バイオフィルム、コンポストなど発酵槽内容物、活性汚泥、浄化槽内容物、発酵食品、プロバイオティクス、変敗食品等、様々な試料に対応。 〇次世代シーケンサー(MiSeq i100シリーズ, Illumina社)を用いたアンプリコンシーケンス解析。 〇DNA抽出作業から承りますので、ご依頼の際には検体そのものをを当社までご送付可能。 〇納品データはR&Dから学術論文まで幅広く利用可能。 〇サービスのポイント ・優れたコストパフォーマンス、11,500円~/検体 ・細菌/アーキアの微生物叢を一括解析 ・細菌の約430 bp、アーキアの約385 bp(ペアエンド)長の配列を解析 ・ITS領域により菌類叢を解析 ・約30,000リードを取得し占有率の低い分類群も検出 ・取得済み配列データから解析のみのご依頼にも対応 解析方法などお気軽にお問合せください。

    受託解析受託測定受託検査
03_MiSeq.png

土壌など環境検体の菌叢解析「環境関連アンプリコンシーケンス解析」

03_MiSeq.png
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  • 関連リンク - https://www.tecsrg.co.jp/services/amplicon-sequenc…

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基本情報

【解析の内容】 ○DNA抽出/精製 ○PCR増幅 ○PCR産物の定量 ○シーケンス配列決定 ○プライマー配列の除去 ○データ解析 【データ解析は2種類のソフトウェアから選択可能】 ○セット1:Metagenome@KIN  データベース(細菌・酵母):RDP+テクノスルガ・ラボ 微生物同定データベース  データベース(真菌):RDP ○セット2:QIIME2  データベース(細菌・酵母):Greengenes database  データベース(真菌):UNITE 【受け入れ可能検体】 土壌、水、バイオフィルム、食品等 【検体の送付方法】 冷凍や冷蔵など、極力菌叢が変化しない方法でご送付ください。 【その他】 α、β多様性解析、主成分分析、クラスター解析などの追加解析も承ります。

価格情報

価格については関連リンクをご参照ください。

価格帯

1万円 ~ 10万円

納期

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※選択コースによる

用途/実績例

・土壌中の細菌叢・菌類層解析 ・浄化槽中の細菌叢解析 ・堆肥中の細菌叢・菌類層解析 ・地下水中の細菌叢・菌類層解析 ・バイオフィルム中の細菌叢解析 ・発酵食品中の細菌叢・菌類層解析 ・発酵槽中の細菌叢・菌類層解析

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「アンプリコンシーケンス解析」細菌叢や菌類叢を解析、多様性解析や統計解析も

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