fastqファイルから菌叢を推定／論文掲載用のα、β多様性解析、統計解析、ヒートマップクラスター解析等／菌叢解析用データ解析受託
【概要】 解析方法については、2種類の解析ソフトウェア（Metagenome@KINおよびQIIME2）から選択可能です。 〇Metagenome@KINによる解析 ・細菌・アーキアの16S rDNAは、RDP（Ribosomal database project）と微生物同定データベースの2種類で解析 ・微生物同定データベースは、BLASTのcut-of f条件を相同率97％からご指定の値に変更可能 ・3検体以上の場合は、クラスター分析および主成分分析まで実施 〇QIIME2による解析 ・Amplicon Sequence Variant (ASV) 法により、相同率の高い近縁種同士の識別が可能 ・学術論文で求められる二次解析 (多様性解析や統計解析の機能) が充実 【受入可能なデータ】 次世代シーケンサーによるシーケンスデータ（fastqファイル） 腸内細菌叢、皮膚細菌叢、口腔内細菌叢、土壌、活性汚泥など、様々な検体から得られたシーケンスデータを解析できます。 その他統計分析ソフトRによるデータ解析やPICRUSt2による予測メタゲノム解析も受託します。
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基本情報
【仕 様】 〇Metagenome@KINによる解析 ・解析データベース RDP（細菌、菌類） テクノスルガ・ラボ「微生物同定データベース」（細菌のみ） ・推定可能な分類階級 RDP：界～属、微生物同定データベース：界～種 ・解析ソフトウェア Metagenome@KIN 〇QIIME2による解析 ・解析データベース 細菌・アーキア：Greengenes database、真菌：UNITE ・推定可能な分類階級 界～種 ・解析ソフトウェア QIIME2 【報告内容】 〇Metagenome@KINによる解析 ・ドーナツグラフ、検体間比較グラフ、クラスター分析、主成分分析 〇QIIME2による解析 一次解析 ・菌叢解析 (バーチャート) 二次解析 ・α多様性解析および統計解析、β多様性解析および統計解析、2D主座標プロット描画、ヒートマップ・クラスター分析 Ward法により、門～種レベルのヒートマップ・クラスタリングを行います。（形式 qzvファイル）
価格情報
（価格は税抜） 〇Metagenome@KIN ・RDP：1式30,000円。 ・微生物同定データベース：1式30,000円。 ・RDP＋微生物同定データベース：1式50,000円 〇QIIME2 ・一次解析：1式30,000円。 ・二次解析：1式30,000円。 ・一次解析～二次解析：1式60,000円。
価格帯
1万円 ~ 10万円
納期
※数量によって納期が変動しますので、お気軽にお問い合わせください。
用途／実績例
・腸内細菌叢解析 ・真菌叢解析 ・機能性食品摂取前後の腸内細菌叢の群間比較 ・特定疾患における腸内細菌叢の群間比較 ・土壌中の微生物叢の解析
カタログ（1）
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企業情報
当社では、微生物に関する受託分析サービスを提供しています。 微生物同定、微生物群集構造解析、腸内環境分析など、幅広いサービスでお客様の試験・分析・研究をサポートします。 学術研究、製品の研究・開発、衛生管理など、多様なニーズにお応えします。