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6種類のプログラムを搭載！解析の目的やサンプルの状態に応じてプログラムを選択
当資料では、シーケンサーデータ解析ソフトウェアPartek Flowを 用いたDNA-Seqデータ解析について紹介しています。 DNA-Seqについての概要から始まり、変異や融合遺伝子の検出の プログラムについてご説明。 遺伝子のデータ解析ソフトウェアの選定の際にぜひご活用ください。 【掲載内容】 ■DNA-Seqとは ■変異の検出 ■融合遺伝子の検出 ■コピー数変異の検出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
セミナーで紹介された3つの応用事例やSciMAPS 4.2リリース情報を掲載！
「SciMAPS」は、、外部プログラムとの連携を前提とした、拡張性の高い 設計思想を持つ材料設計支援プラットフォームです。 使いやすいモデル構築機能、データ解析機能が標準装備され、大学や研究機関で 開発された世界的に定評のある先進の計算プログラムを統一された操作で利用できます。 最新版リリースに先立ち、開発元の研究者を招聘して6月末に開催された MOLSIS特別セミナーの報告とSciMAPS最新版の4.2の概要についてご紹介します。 【掲載内容】 ■MOLSIS特別セミナー ■SciMAPS 4.2リリース情報 ・粗視化モデルのサポート強化 ・LAMMPSの物性計算と解析機能の追加 ・Crosslinkerの改良 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
PESの自動探索機能の他、AMSの各計算エンジンなどについてご紹介！
『AMS』は、量子化学計算プログラムのADFをはじめとする計算化学統合 パッケージです。 AMSの新バージョン2021では、各計算エンジンに対して構造最適化やMDなどを 統一的に行うためのツール“AMS driver”に新たに反応経路自動探索機能が 追加されました。 当資料では、今回追加されたPESの自動探索機能の他、AMSの各計算エンジン （ADF・BAND・DFTB・ReaxFF・COSMO-RS）、その他ツールの主な新機能に ついて紹介しています。 【掲載内容】 ■AMS driverによる反応経路の自動探索 ■AMSの各計算エンジン・ツールの主な新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
簡単かつ柔軟なワークフロー作成！KNIMEで動作するMOEインターフェイス
『MOE-Extensions for KNIME』は、MOEをワークフローツール 「KNIME」上で使用するためのインターフェイスです。 当製品を利用することで、化合物や受容体構造の前処理、 ドッキング、FBDD、ファーマコフォア検索などのMOEによる 連続的な処理を容易に定義できます。 【特長】 ■誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 ■プログラミング不要で作業を自動化 ■処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 ■創薬研究のための多数のノードを提供 ■KNIMEの他ノードとの連携が容易（機械学習等） ■ユーザーオリジナルノードの作成が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
創薬の高速化と低コスト化を実現する上で強力なツール！原理と適用事例についてご紹介
薬物様化合物のケミカルスペースは10^60構造存在するとも言われ、 従来のプログラムでは有効な時間内で検索することは不可能です。 BioSolveIT社『infiniSee』は、数百億を超える実際に合成可能かつ 購入可能な化合物ライブラリーから、ターゲット分子と化学的特長類似 化合物を高速に検索することができます。 当資料では、薬剤耐性菌が生産する「CTX-M β-lactamase」に対する 合成可能なリガンド類似化合物の検索を例に、『infiniSee』の原理と 適用事例についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■CTX-M β-lactamase 複合体の三次元構造 ■母核置換 ■infiniSee による合成可能な化合物ライブラリーの類似構造検索 ■SeeSAR によるドッキングとHYDE スコアリング ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能をご紹介！
「Reverse Fingerprint Modeling」は、MOEユーザーコミュニティーのための SVLコード交換サイトSVL Exchangeで公開されている統合計算化学システム MOEのアドオンプログラムです。 化合物のさまざまな分子フィンガープリントと活性値の情報を用いて、 活性化合物に共通の部分構造や活性/不活性に寄与する部分構造を特定したり、 ファーマコフォアモデルを構築/評価したりできます。 当資料では、「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■Reverse Fingerprint Modelingの概要 ■Motif Detection ■Virtual Pockets ■Fragment Placement ■Activity Scan ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
創薬研究書籍の抜刷記事を配布中！
『MOE』は、創薬・生命科学研究のための分子モデリング、シミュレーションソフトウェアです。 直観的に操作できる多彩なアプリケーションと豊富なデータコンテンツで、 計算化学者から実験研究者まで、幅広いユーザーの研究をサポートします。 国内外で多くの導入実績があり、分子シミュレーション、ケモインフォマティクス、 タンパク質・抗体・ペプチドモデリング、立体構造に基づく分子設計、 ファーマコフォア解析など様々な機能を搭載。 現在『MOE』の特長・事例が紹介された書籍 『in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術(注1)』 の抜刷資料を進呈中。 「お問い合わせ」より「抜刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。 ※製品の詳細は『PDFダウンロード』よりカタログをご覧ください。
化合物、混合溶液などの幅広い物性予測を実現。医薬品・製剤プロセス等の各種設計に
『COSMOtherm』は、気液・液液・固液平衡、酸解離定数、反応平衡定数、 イオン液体の各種プロパティ等の「熱力学物性」を予測するソフトウェアです。 COSMO-RS法により、分子の構造情報から直接、熱力学物性を推算し 特殊な仮定を用いず、有限希釈・無限希釈の両方を高精度に予測できます。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。 ★さらに、適用事例集をプレゼント中です★ （下記「ダウンロード」ボタンからご覧いただけます。） 【事例集の内容】 ■気液平衡推算 （蒸気圧推算、2成分系気液平衡、臨界点近傍の気液平衡推算） ■液液平衡推算 （2成分系・3成分系の液液平衡、3成分3相平衡推算） ■固液平衡推算 （相対溶解度による溶媒スクリーニング、2成分固液平衡推算） ※詳しくは資料をご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。
MedeAユーザー会がフランスで開催されました！日本ではJFCCにて開催
「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に 各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 開発元であるMaterials Design社では、ユーザー会を例年開催しており 昨年は9月にフランスで開催しました。 また、日本では11月にJFCC（ファインセラミックスセンター）にて セミナーを開催し、新開発動向や適用事例を紹介しました。 【概要】 ■MedeA ユーザー会 ・世界中から50名程のユーザーが参加 ・「ハンズオントレーニングセッション」では、モデリングや解析方法を演習 ・「サイエンティフィックプログラム」と称し、ユーザーからの研究報告や 開発元からの新動向が発表 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
幅広い機能や最新の適用例を知るうえで有効なウェビナーについてご紹介
『MedeA』は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の 物性評価を行うための統合支援環境です。 開発元であるMaterials Design社では、当製品を紹介するためのウェビナーを 開催しており、幅広い機能や最新の適用例を知るうえで有効な機会です。 過去のウェビナーは、ウェビナーオンデマンドにて動画配信されています。 下記のリンク先からご覧いただけます。 ウェビナーオンデマンド：http://www.materialsdesign.com/webinars 【過去に開催されたウェビナー】 ■UNCLEの基本理論とその適用例 ■空間・時間スケールの大きな現象を取り扱う技術として、古典力場計算 ■化学や触媒分野に焦点を当て、古典力場計算の技術 ■Liイオン電池電極材の相安定性や構造劣化現象の解析に焦点を当てた事例 ■第一原理計算プログラムVASPなどを利用して、解析、物性評価した例 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解析処理を可視化・保管できます
KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。 ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。 プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。 MOEノードと、既存のデータマイニングやマシンラーニング（機械学習）などのノード、サードパーティ製品のノードも自由に組み合わせることができ柔軟なワークフローの設計が可能になります。
材料科学、生命科学向け力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により力場計算の問題を解決
「力場パラメータが足りなくて計算できない」、「化学的に誤った構造を結果として与える」、これらは、分子シミュレーションソフトウェアに付属する力場パラメータを利用して計算を行うと、しばしば直面する問題です。 Direct Force Fieldは、開発元の提供する高精度な力場パラメータを登録した力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により、力場パラメータの問題を解決します。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。
SVLプログラムの追加やカスタマイズによってMOEの機能をさらに強化できる！
当資料では、統合計算化学システム「MOE」の「GENESIS Interfaceと siRNA Builder」について掲載しております。 「siRNA Builder概要」や「MOEによるsiRNAの解析」をご紹介。 SVLにより開発された2つのアドオンプログラムについて解説。 図や表を用いて分かりやすく掲載されております。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■GENESIS Interface ■siRNA Builder：人工核酸モデリングツール ■MOEフォーラム2025 開催告知 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。
in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例としてCCG社の統合計算化学システム「MOE」の特長と事例を紹介
株式会社技術情報協会から2018年1月31日に「in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術」が発刊されました。 本書には、コンピュータの処理能力の速さを活かしつつ、計算コスト増大の課題をいかに克服するか？という課題についてin silico創薬を成功に導く計算科学やスパコン、データベース構築の重要技術が満載されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。 第4章「in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例」の第2節で「MOE」を用いた創薬研究の効率化について紹介されています。本節はMOEの特長とMOEを利用した創薬研究の効率化の事例について詳しく説明しています。特にMOEが持つ多彩な機能の中から特にバーチャル・スクリーニングに焦点を絞り、解析事例も交えながら、MOEの機能を紹介しています。 本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい！ 「PDFダウンロード」からはMOEのカタログをダウンロードできます。
