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環状ペプチドにフォーカスした解析事例を掲載！
「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品の モデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。 広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの 配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。 当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を 紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■環状ペプチドの概要 ■環状ペプチドのモデリング ■環状ペプチドの配座解析 ■環状ペプチドの安定性予測 ■環状ペプチドの膜透過性予測 ■環状ペプチドの相互作用解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を搭載
「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析（疎水性/電荷） ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MOEにCoMFA法/CoMSIA法による3D-QSAR解析を追加。化合物構造の3次元構造に用いた合理的な分子設計が可能。
『MOE（Molecular Operating Environment）』は、カナダCCG社が独自に開発したSVL（Scientific Vector Language）を搭載する統合計算化学 システムです。 使いやすいインターフェイス、ソースコード公開の豊富なアプリケーション、目的に応じて使い分けできる複数の使用モード、柔軟なライセンス形態により幅広い分野の研究者のニーズに答えることのできるソフトウェアです。 CoMFAに基づき自動的に3D-QSARモデルの構築を行うMOEのアドオンプログラム「AutoGPA」では、三次元記述子として、新たに水素結合のドナー／アクセプターや芳香環のファーマコフォア、部分電荷、LogP、モル屈折などの幅広い特性を用いたCoMSIA法をサポートします。 【特長（AutoGPAのCoMSIA法）】 ■多様な物理化学的特性を3D-QSAR式に含める ■3D-QSAR 式の各特性の係数の大きさと位置から、物理化学的な特性を予測 ■CoMFA法と比較して、より具体的な特性の予測が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析
MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、 分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を支援します。 【Solvent Analysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド、受容体の各分子系を同時に処理 ■計算には水分子の相関を考慮 ■水分子だけでなく、イオンや疎水性原子の存在確率も可視化 ■長時間のシミュレーションが不要 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ペプチドの解析、改変、構築を支援する多彩な機能で研究をサポートします
「MOE」はペプチド解析のための機能を多数搭載しております。 変異体解析として自動的な変異体モデルの構築と、各種物性値の推算などが可能です。 相互作用解析では、ドッキング計算によるペプチド-受容体複合体の構造 予測などが行えます。表面解析機能により分子表面の特徴づけも行えます。 配列を指定しペプチドを構築することも可能です。ペプチドの解析、 改変、構築を行える多彩な機能により研究をサポートします。 【特長】 ■ペプチド構築 ■変異体解析 ■相互作用解析 ■表面解析 ■構造解析 ■非天然アミノ酸（特殊アミノ酸）の構築/変異もサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
