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分子モデリングソフト(実験) - メーカー・企業と業務用製品 | イプロスものづくり

分子モデリングソフトの製品一覧

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【資料】X線結晶解析

【ホワイトペーパー進呈】X線実験から生成される複合体構造データの解釈を支援!

当資料では、「BIOVIA Discovery Studio」での X線結晶解析について詳しくご紹介しています。 「BIOVIA Discovery Studio」のモデリングツールは、X線実験から 生成される複合体構造データの解釈を支援するように設計されています。 「BIOVIA Discovery Studio」は、タンパク質-リガンド複合体の 構造モデルを構築して精密化することに加えて、電子密度マップを生成して 可視化したり、X線構造の精密化タスクを実行したり、リガンドを自動的に 有効な電子密度にフィッティングさせることができます。 【掲載内容(一部抜粋)】 ■ソリューション ・電子密度マップの生成 ・水分子の検出 ・リガンドの配置 ・連続的な精密化の実行 ・モデル分子の検証 など ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル(液滴、周期境界条件) ■スケッチャーツールからの分子のコピー&ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • 分子モデリングソフト

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