配列解析ソフト - メーカー・企業と製品の一覧

DNA配列解析ソフトウェア『CodonCode Aligner』

DNA 配列のアセンブリとアラインメント

DNA バーコーディング、シーケンスのアセンブリやコンティグの編集、 突然変異の検出に役立つ Windows および macOS 用プログラムです。 親しみやすく分かり易いユーザーインターフェースを備えながら、 Phred-Phrap と互換性のあるシーケンスのクオリティスコアをフル サポートする能力も備えています。 CodonCode Aligner を使ってできること ・テキストファイルからのシーケンスの読込み ・ABI ファイル、SCF ファイル、FASTQ ファイルからのシーケンスの読み込み ・End Clip 機能 (低品質のシーケンス末端を切り取る機能) ・ベクターのトリミング ・コンティグのアセンブル ・参照シーケンスへの整列 ・サンプル名に基づくグループ単位のアセンブルや整列 ・Aligner プロジェクトから直接 Phred および Phrap を実行 ・シーケンスと特徴 (features) の出力 ・差分表とタンパク質翻訳を参照 ・対立遺伝子を分離 ・ギブソンアセンブリを用いたバーチャルマルチフラグメントクローニング など