パトコアの製品・サービス一覧

当社は、pKa（酸塩基解離定数）等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa：高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies：特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point：等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

創薬プロジェクト全般にわたって、薬物動態と毒性パラメータの最適化は 重要な目標となります。 『ADMETグループ』は、機械学習の手法をキュレーションされた データセットに適用し、信頼性の高い予測モデルを作成。 トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測することにより、 候補化合物に対する心毒性リスクを評価できます。 【特長】 ■機械学習の手法をキュレーションされたデータセットに適用 ■信頼性の高い予測モデルを作成 ■トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測 ■候補化合物に対する心毒性リスクを評価できる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin：パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算 ■Conformation Plugin：コンフォマーの発生、重ね合わせ、MD計算 ■Geometry Plugin：分子の様々な幾何学的パラメータを計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異性体のエニュメレーションはドッキングや3Dサーチ、 3D-QSARなどのヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須となります。 【ラインアップ】 ■Stereoisomer Plugin：立体異性体を生成 ■Tautomer Plugin：互変異性体の計算 ■Resonance：共鳴構造の生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に重要な役割を果たしています。 『NMRグループ』は、有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します。 【特長】 ■NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に 　重要な役割を果たしている ■有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

パトコアは、分子量、化学式等の基礎項目に適した 『Elemental Analysisグループ』を取り扱っています。 分子の元素構成に関する値を計算・表示。 Marvinライセンスでご利用頂けます。 【計算・表示する値(抜粋)】 ■Mass：molecular mass ■Exact mass：molecular mass calculated from the most frequent 　natural isotopes of the elements ■Formula：chemical formula of the molecule 【ご利用形態】 ■Marvin Sketchのプラグインとして ■cxcalcコマンドラインツールとして ■Chemical Termsの機能として ■Java・.NET、Microserviceなど各種APIを利用して、独自アプリケーションで利用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。