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CONFLEX DOCKは、基質となるタンパク質に対して、指定したペプチド鎖がどこに配位し複合体を形成するかを予測するドッキングシミュレーションプログラムです。 タンパク質とペプチドをアミノ酸残基ごとに粗視化し、4体ポテンシャルによりタンパク質-ペプチド間の親和性を評価します。 基質となるタンパク質を、アミノ酸残基のCα原子を代表点として粗視化し、その表面に探索点を置きます。 探索点上に、ペプチドの配列にしたがってアミノ酸を配置して、4体ポテンシャルでスコアを評価します。
ChemDrawは、化学構造式を含む文書を書くためのソフトウェアとして今では世界中で事実上の標準ツールとして使用されています。 日本でも特に化学系の論文、報告書に広く利用されるようになりました。 ChemDrawを使用することで、化学構造式を簡単に美しく描くことが出来ます。 ChemDrawシリーズには、以下の3つの製品があります。 ・Signals ChemDraw (年間ライセンス) ・ChemDraw Professional (年間ライセンス) ・ChemDraw Prime (年間ライセンス) 各製品に含まれる機能は以下をご参照ください。 https://www.conflex.co.jp/product_chemdraw_functions.php
コンフレックスの『技術サポート/講習会』についてご紹介します。 計算化学ソフトウェアを効率よく活用するためには、専門的な知識や経験が不可欠です。 当社の「技術サポート」は、長年に渡る豊富なサポート実績により多種多様な分野のご質問に対応可能です。 また、初心者向けの内容から、応用編、ご研究のテーマに合わせてカスタマイズした「講習会」も承っております。 1人1台のPCを使いながら実習形式で行ったり講義形式でも対応しております。 【技術サポート:対応ソフトウェア】 ■CONFLEX & Interface ■Gaussian & GaussView ■Amber & AmberTools ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせください。
CONFLEX、Gaussian、Amberなどにおいて、 ・導入前の評価を行いたい ・計算を始めるにあたり目的に合う手法を知りたい ・計算資源が不足している ・人的・時間的に余裕がない ・入力データの作成方法に不明点がある ・計算結果を整理する手順が分からない などといった場合にご利用いただけます。 ご依頼の際には、 ・計算実行に必要な事前準備の作業量 ・全ての計算を実施し終わるまでに要する期間 ・計算結果の解析 ・終了後にお渡しするデータの詳細 などについて事前に打ち合わせを行い、実施内容・費用をご承諾いただいた上で作業を開始いたします。 作業終了後、計算に使用した入力データと得られた出力データを作業報告書とともにお渡しした場合、 報告書にある作業内容とデータを照らし合わせることで、全ての計算をお手元の環境で再現し応用することが可能になります。
フレキシブルな有機化合物の配座異性体を効率よく網羅し、最安定構造を見出します。 実践的に意味のある安定な配座異性体を優先的に創出することにより、効率的な配座空間探索を実現します。 また、エネルギー極小にある分子性結晶構造を、分子構造と空間群を元に探し出し、安定な結晶構造を求めることが出来ます。 <主な機能> ・配座空間探索 ・基準振動解析 ・分子性結晶&結晶構造探索 ・結晶表面解析 ・溶媒効果 ・Gaussian連携機能 ・Dynamic Reaction Coordinate (DRC) ・ホストーリガンド配位探索 ・その場配向探索 ・CD/UV/Visスペクトル解析 ・NMR結合定数解析 ・パラメーター設定 ・アミノ酸残基置換機能
Gaussianは、量子化学の基本原理に基づき、分子系のエネルギー、分子構造、振動数など、さまざまな分子特性を予測する電子状態計算ソフトウェアです。 安定分子はもちろん、短寿命中間体や遷移状態構造など、実験的な観測が困難な化学種についても解析可能であり、幅広い条件下における反応機構や分子特性の研究に活用されています。 また、高精度な ab initio 分子軌道計算をはじめ、電子相関を考慮した高度な電子状態計算、計算効率に優れた半経験的分子軌道計算、さらには分子力場計算まで、多様な計算手法に対応しています。 https://www.conflex.co.jp/product_gaussian.php Gaussian&GaussViewの講習会や技術サポートも対応しております。 初めて導入される方でも安心してご利用いただける環境を提供しております。 オンライン、もしくは貴社に訪問の上、詳細説明やデモも可能です。お気軽にお問い合わせください。 https://www.conflex.co.jp/conflex_contact.php
『Amber』は、生体分子のために開発された、モデリングおよび分子力学と動力学計算シミュレーションのパッケージです。 モデリングでは、核酸やアミノ酸のデータを用い構造を構築したり、溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュールが多数用意されています。NMRリファインメントを実行したり、解析ツールを用いて動力学計算のトラジェクトリー解析を行ったりできます。 https://www.conflex.co.jp/product_amber.php Amberの講習会や技術サポートも提供しております。 初めての方でも安心してお使いいただける環境を提供しております。 https://www.conflex.co.jp/product_seminar.php