糖鎖および糖ペプチドの質量分析データを用いたグライコミクス向けツール
主要メーカーの質量分析計から得られたMS/MSおよびMSnデータを自動で読み取り糖鎖構造を予測します。さらに、LC-MS/MSデータを用いた糖ペプチド分析を包括的にサポートします。SimGlycanは実験で得られたMS/MSデータを独自のデータベースと照合し、最終的に候補構造のリストをランク付きで生成します。
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基本情報
[サポートプラットフォーム] Windows: Vista/Windows7/Windows8/Windows10 [推奨システム要件] CPU: Intel Core i5 / i7 RAM: 12GB 以上 HDD空き容量: 500GB 以上 スクリーン解像度: 1024 x 768 以上
価格情報
コマーシャルまたはアカデミック、およびラインナップによって価格は変わりますので、お気軽にお問い合わせください。
納期
~ 1週間
用途／実績例
[特徴] ・糖鎖および糖ペプチドに関するロバストデータベース ・MALDI MS/MSおよびLC-MS/MSワークフローのサポート ・主要メーカーのデータ入力ファイル形式に対応 ・正確なランキングメカニズム ・正確な結果を得るためのフィルタ搭載 ・総合的な結果分析 ・LC-MSおよびLC-MS/MSデータ処理 ・ハイスループット解析 ・データベースをカスタマイズできる「SimGlycan Enterprise Edition」も提供可能 [実績例] 抗体医薬や血液製剤などのバイオ医薬品を開発・研究する製薬企業、研究組織にて多く導入されています。 [採用論文] http://www.premierbiosoft.com/citations/glycomics-posters-technical-application-notes.html
詳細情報
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LC検出化合物の同定された糖鎖構造を示すインターフェース 独自のデータベース検索アルゴリズムで、同定した糖鎖構造をランキング形式で分かりやすく表示します。
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スペクトルプロット例（ピーク間フラグメントロス表示） MS/MSスペクトルに糖鎖および糖ペプチドのフラグメントアノテーションを行うことができます。シンボル表示、Domon-Costello名表示、ピーク間フラグメントロス表示など、見やすい形式で出力することができます。
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糖鎖構造描画機能 糖鎖や糖ペプチドの構造を描画、編集することができます。描画した糖鎖構造の論理フラグメントを実験データと比較することによって、未知構造の解明に役立ちます。
ラインアップ（2）
| 型番 | 概要 |
|---|---|
| SimGlycan | PREMIER Biosoft社がキュレーションしたマスターデータベースが1つのプログラムにビルトインされています。 |
| SimGlycan Enterprise Edition | 企業内でプライベートカスタムデータベースを使用している場合、または独自のデータを使用している場合、SimGlycan Enterprise Editionは新規糖鎖および糖ペプチドを解決するための安全なツールとしてご利用できます。また、データベースをカスタマイズして、検索範囲を絞り込むためのサブデータベースを作成することができます。 |
カタログ（3）
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企業情報
当社は2005年に設立し、バイオ、ケミカル関連ソフトウェア・データベースなどの販売、創薬インフォマティクスシステムの構築およびコンサルティング、バイオ関連事業のコンサルティング・データ受託解析などを行っている会社です。大学・官公庁研究機関でバイオ関連のご研究に携わっている研究者の方々を始めとして、製薬会社にて新薬開発に携わっている方々、さらには病院などで医療現場に携わっている先生方へ、ご研究に役立つ情報、技術、サービスをその求められる最適なタイミングにてご提供することをミッションとしています。