代謝物の質量分析データを用いたメタボロミクス向けソフトウェアツール
ピーク検出、ピークピッキングおよび保持時間のアライメントなど、LC-MSデータのプロセシングが行えます。この処理を行うことによって、バッチモードでMSおよびMS/MSデータを使用して代謝物を同定することができます。同定した代謝産物の定量分析に加えて、生物試料に対して代謝産物の差異分析を容易に行えます。
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基本情報
[サポートプラットフォーム] Windows: Vista/Windows7/Windows8/Windows10 [推奨システム要件] CPU: Intel Core i5 / i7 RAM: 16GB 以上 HDD空き容量: 500GB 以上 スクリーン解像度: 1024 x 768 以上
価格情報
コマーシャルまたはアカデミックによって価格は変わりますので、お気軽にお問い合わせください。
納期
~ 1週間
用途/実績例
・ロバストなリレーショナル代謝物データベース ・複数のファイル形式サポート ・LC-MSおよびMS/MSデータプロセシング ・ハイスループットMSおよびMS/MSデータ解析 ・生物学的サンプルの代謝物の差分解析 ・定量的メタボロミクス ・同定された代謝物を用いたマススペクトルのアノテーション [発表ポスター] http://www.premierbiosoft.com/citations/simmet.html
詳細情報
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SimMetの典型的なグラフィカルユーザーインターフェース LC-MSピークリストを単一のワークベンチで閲覧できます。保持時間内で同定された脂質のリスト、選択された保持時間での脂質構造、サンプルのクロマトグラムを表示します。
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クロマトグラムのプロット MSおよびMS/MSレベルの両方について、TIC(トータルイオンクロマトグラム)、XIC(抽出イオンクロマトグラム)およびBPC(ベースピーククロマトグラム)を表示します。クロマトグラムのプロットを拡大して、重要なピークをハイライトすることができます。
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生物学的サンプルの代謝物差分解析 生物学的サンプルと代謝産物との関係を視覚的に表現します。主成分分析(PCA)では、2つの2次元プロット(スコアプロットとローディングプロット)を生成します。2次元プロットは、予想されるバイオマーカーを特定するために信頼楕円(correlation loadings and Hotelling's T2 ellipses)とともに表示されます。
カタログ(3)
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当社は2005年に設立し、バイオ、ケミカル関連ソフトウェア・データベースなどの販売、創薬インフォマティクスシステムの構築およびコンサルティング、バイオ関連事業のコンサルティング・データ受託解析などを行っている会社です。大学・官公庁研究機関でバイオ関連のご研究に携わっている研究者の方々を始めとして、製薬会社にて新薬開発に携わっている方々、さらには病院などで医療現場に携わっている先生方へ、ご研究に役立つ情報、技術、サービスをその求められる最適なタイミングにてご提供することをミッションとしています。