BLASTによるDNA塩基配列の検索、HMMERによるタンパク質のドメイン検索を目的とした構成例です
植物の育種研究に携わるお客様より、BLASTによるDNA塩基配列の検索や、HMMERによるタンパク質のドメイン検索を行うためのマシン構成です。 複数のユーザーが有線LAN経由でマシンにアクセスする使い方を想定しています。 また、BLASTでのクエリ配列は数百から数千程度で、データベース配列は10万程度。HMMERによるドメイン検索は、10万程度のクエリ配列を想定しています。 de novo解析の実行も可能な構成ですが、優先度の高い要件として考慮する場合には、仕様上の最大メモリ容量となる128GBを搭載するのが良いと思われます。 また、ネットワークアクセスで利用し、研究室内で小規模な簡易サーバーとして利用するのみでしたら、本事例の構成でもコスト重視の選択として成立します。ただし、多くの人数で利用する想定の場合は、明らかにスペックが不足します。重要度・運用方法によっては、本格的なサーバー構成をおすすめします。 本事例の構成は、お客様から頂戴した条件を元に検討した内容です。 掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。
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基本情報
CPU：AMD Ryzen9 7950X (4.50Hz 16コア) メモリ：64GB ストレージ1：1TB SSD S-ATA ストレージ2：8TB HDD S-ATA ビデオ：NVIDIA Geforce GT1030 ネットワーク：on board (2.5G x1 10/100/1000Base-T x1) Wi-Fi x1 筐体+電源：ミドルタワー筐体 + 850W OS：Rocky Linux 8
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用途／実績例
バイオインフォマティクス BLASTによるDNA塩基配列の検索、HMMERによるタンパク質のドメイン検索
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企業情報
テガラ株式会社は、全国の研究開発者様に向けた専門的な製品の調達販売や 情報提供、サポートなどのサービスを統合した研究開発プラットフォームを 形成しています。 スピードが価値を持つ研究開発の分野で、お客様の研究開発の スピードアップのためのお手伝いをし、ひいては日本および世界の 研究・開発の推進をお手伝いすることがテガラの考える使命です。 研究開発者様にとっての心強いパートナーであり続けるために、当社は日々 新しい技術を磨き続け、サポート体制の強化を行っております。
