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幅広くご利用可能！Flowを用いたCITE-seqデータ解析について紹介します
『Partek Flow』は次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq、ChIP-seq、Metagenomics等のデータ解析が可能。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインター フェース上で選択でき、複雑なコマンド入力が不要なので、データ解析の 専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご利用 いただけます。 【掲載概要】 ■CITE-seq とは ■細胞表面タンパク質の解析 ■ハッシュタグ・デマルチプレキシング ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
データ解析の専門家からデータ解析が専門でない実験研究者まで幅広くご利用可能です
当資料では、『Partek Flow 8.0』の新機能を紹介しております。 『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータの解析から解析結果の 可視化までを行います。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインターフェース （GUI）上でパラメーターを選択しコマンドを実行。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析が専門でない実験研究者まで 幅広くご利用いただけます。 【掲載概要】 ■Partek Flowの製品概要 ■擬時間解析 ■UMAP プロットによる次元削減 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行！RNA-seqをはじめ様々なアプリケーションのデータ解析に対応！
『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq, Single Cell RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケンス解析（DNA-seq） ■転写因子結合部位解析（ChIP-seq） ■メチル化部位解析（MeDIP-seq） ■メタゲノム解析 【対応機器】 ■イルミナ（HiSeq, NextSeq, MiSeq, MiniSeq） ■サーモフィッシャー（Ion S5, Ion Proton, Ion PGM） 『Partek Flow』は、ウェブブラウザーから操作するのでコマンド入力したりパラメーターを手入力する必要はありません。インストールしたサーバーに接続可能なネットワーク上のあらゆるマシンから利用できます。読み込んだデータの種類に対応した解析メニューを表示しますので、データ解析に慣れていないウェットの研究者でも簡単に操作できます。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご利用可能！
『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-Seqや DNA-Seq、ChIP-Seq、Single Cell RNA-Seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 また、搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザー インターフェース上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 当資料では、k-meansクラスタリングによる細胞の分類やマーカー遺伝子の 表示、UMAPによる次元削減、遺伝子リストの作成など、Single Cell RNA-seqデータ解析に有用な機能について紹介します。 【掲載内容】 ■クラスタリング ■次元削減による可視化 ■発現変動遺伝子リスト ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアの追加機能と活用例についてご紹介！
『Partek Flow（以下、Flow）』は次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア です。次世代シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列データを 読み込んで、Single Cell RNA-Seqや空間的遺伝子発現等のデータを解析 することが可能です。 Flowでは、Single Cell RNA-Seqデータの解析を行うCell Rangerと、 空間的遺伝子発現データの解析を行うSpace Rangerのパイプラインが追加 されました。パイプラインを使用することでリード配列データのアライメント からカウントマトリックスの出力までがより簡単に実行できるようになります。 当資料では、Cell RangerやSpace Rangerの機能と活用例を紹介します。 【掲載内容】 ■Cell Ranger ■Space Ranger ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
6種類のプログラムを搭載！解析の目的やサンプルの状態に応じてプログラムを選択
当資料では、シーケンサーデータ解析ソフトウェアPartek Flowを 用いたDNA-Seqデータ解析について紹介しています。 DNA-Seqについての概要から始まり、変異や融合遺伝子の検出の プログラムについてご説明。 遺伝子のデータ解析ソフトウェアの選定の際にぜひご活用ください。 【掲載内容】 ■DNA-Seqとは ■変異の検出 ■融合遺伝子の検出 ■コピー数変異の検出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
解析アプリケーションに合ったデータの取込みをナビゲートすることでデータ解析をサポート！
当資料では、「Partek Flow」の新バージョンでの主な新機能や 変更点についてご紹介しております。 「Flow」は、ウェブブラウザーを介して利用するNGSデータ解析 ソフトウェア。新バージョンではインターフェイスが改良され、 空間トランスクリプトーム解析機能が強化。 各項目ごとに詳しく解説しておりますので、是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■Partek Flowの製品概要 ■インターフェイス ■空間トランスクリプトーム解析 ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
コマンドによる操作は不要！Flowを用いたメタゲノム解析についてご紹介しております
『Partek Flow』は次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq、ChIP-seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインターフェース 上で選択できるので、コマンドによる操作を必要としません。 当資料では、Flowを用いたメタゲノム解析についてご紹介しております。 【掲載内容】 ■メタゲノム解析とは ■系統解析 ■α多様性解析・β多様性解析 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
新しい解析ツールであるSample Composition Toolsや新たに追加された遺伝子発現データについてご紹介
GENEVESTIGATORは遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサー（NGS） の膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。 当資料では新しい解析ツールであるSample Composition Toolsや 新たに追加された遺伝子発現データについて紹介します。 【掲載内容】 ■Sample Composition Tools ■遺伝子発現データの追加収載 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に！
当資料では、新しく追加されたTCGAの遺伝子発現データについて 掲載しています。 「GENEVESTIGATOR」は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、さまざまな研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析可能にします。 また、使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載し、研究者が 標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や 発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【掲載内容】 ■TCGAについて ■GENEVESTIGATORに収載されたTCGAデータ ■RNA-seqのデータ解析パイプライン ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
大量の実験結果を統合して解析可能！Cell Types toolの使用例やデータをご紹介
『GENEVESTIGATOR』は遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイやシーケンサーの膨大な遺伝子 発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された大量の 実験結果を統合して解析可能にします。 また、当製品は使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載している ため、探索や発現解析などを行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の 優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 当資料では、新しく追加されたCell Types toolの使用例や追加収載された データを紹介します。 【掲載内容】 ■Cell Types tool ■遺伝子発現データの追加収載 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
乳がん特異的な発現パターンと逆相関を示す化合物の解析
『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析可能にします。 「乳がん特異的な発現パターンと逆相関を示す化合物」の解析では、 隣接正常組織と比較して乳がん組織で発現が有意に変動している遺伝子を検索。 疾患特異的な発現変動と逆相関を示す医薬品候補化合物を検索することで、 解析対象の疾患に有効性を示す可能性がある化合物を見出すことができます。 【特長】 ■遺伝子発現データをキュレート ■大量の実験結果を統合して解析可能 ■解析対象の疾患に有効性を示す可能性がある化合物を見出すことが可能に ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
細胞集団の不均一性の解析や細胞系譜を推測する研究などに使用！解析事例についてご紹介
「GENEVESTIGATOR」は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載しているため、 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する 遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に 行うことができます。 当資料では、2020年の10月に追加された、Single Cell RNA-seqキュレーション データを使用した解析事例について紹介しています。 【掲載内容】 ■はじめに ■特定の遺伝子が発現する細胞種の解析 ■COVID-19 患者と健常者の発現遺伝子比較 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
化合物の物理化学的特性間などの実験値との関係を可視化して解析することが可能！
当資料では、ニューラルネットワーク手法に基づくデータ解析が可能な SONNIAについて掲載しています。 MN-AM社製「SONNIA」は、自己組織化ニューラルネットワーク手法に 基づいて低分子化合物のクラスター解析とQSA(P)R解析を行います。 データの入出力、計算の設定、結果の表示に対話的かつグラフィカルな インターフェースを提供し、化合物の物理化学的特性間あるいはそれらと 生物活性等の実験値との関係を可視化して解析することができます。 【掲載内容】 ■SONNIA 概要 ■SONNIAの主な機能 ■応用事例紹介 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解析処理を可視化・保管できます
KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。 ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。 プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。 MOEノードと、既存のデータマイニングやマシンラーニング（機械学習）などのノード、サードパーティ製品のノードも自由に組み合わせることができ柔軟なワークフローの設計が可能になります。
