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解析×株式会社モルシス - メーカー・企業と製品の一覧

解析の製品一覧

1～15 件を表示 ／ 全 15 件

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『MOE』タンパク質変異体解析

『MOE』タンパク質変異体解析

バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を搭載

「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析（疎水性/電荷） ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア（ミドル・ドライバ・セキュリティ等）

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『MOE-AutoGPA』による3D-QSAR解析

『MOE-AutoGPA』による3D-QSAR解析

MOEにCoMFA法/CoMSIA法による3D-QSAR解析を追加。化合物構造の3次元構造に用いた合理的な分子設計が可能。

『MOE（Molecular Operating Environment）』は、カナダCCG社が独自に開発したSVL（Scientific Vector Language）を搭載する統合計算化学 システムです。 使いやすいインターフェイス、ソースコード公開の豊富なアプリケーション、目的に応じて使い分けできる複数の使用モード、柔軟なライセンス形態により幅広い分野の研究者のニーズに答えることのできるソフトウェアです。 CoMFAに基づき自動的に3D-QSARモデルの構築を行うMOEのアドオンプログラム「AutoGPA」では、三次元記述子として、新たに水素結合のドナー／アクセプターや芳香環のファーマコフォア、部分電荷、LogP、モル屈折などの幅広い特性を用いたCoMSIA法をサポートします。 【特長（AutoGPAのCoMSIA法）】 ■多様な物理化学的特性を3D-QSAR式に含める ■3D-QSAR 式の各特性の係数の大きさと位置から、物理化学的な特性を予測 ■CoMFA法と比較して、より具体的な特性の予測が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【Flow技術情報】ChIP-seqデータ解析

【Flow技術情報】ChIP-seqデータ解析

ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！

「Flow」は、次世代シーケンサー（以下、NGS）から出力されたリード配列を 読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。 リード配列の参照ゲノム配列へのアラインメント、アラインメント前後の QA/QC、ピーク検出、検出したピークのアノテーション、転写開始点からの 距離でのプロットなど、ChIP-seqのデータ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【ChIP-seqとは】 ■ChIPとNGSを組み合わせてゲノムワイドにエピゲノム情報を 　取得する手法 ■様々な生物で転写制御メカニズムの理解に大きく貢献 ■プローブ設計に依存した制限がない、ダイナミックレンジが広い ■ChIP on chipと比べてバイアスのない精確な解析が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア（ミドル・ドライバ・セキュリティ等）
  • その他組込み系（ソフト＆ハード）

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【技術情報】Flow：DNA-seqデータ解析

【技術情報】Flow：DNA-seqデータ解析

DNA-seqやSNVおよびIndelの検出など！Flowを用いたデータ解析についてご紹介！

当資料では、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア「Flow」を用いた DNA-seqデータ解析について紹介します。 「Partek Flow(Flow)」は、次世代シーケンサー（NGS）から出力された リード配列を読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータを解析することが可能です。 検出した変異のアノテーションや絞り込みや染色体ビューアーでの変異の表示など、 データ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【掲載内容】 ■DNA-seqとは ■SNVおよびIndelの検出 ■融合遺伝子の検出 ■コピー数変異の検出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他情報システム

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【技術情報】Single Cell RNA-seqデータ解析

【技術情報】Single Cell RNA-seqデータ解析

Single Cell RNA-seqのデータ解析を行う為の豊富な機能を搭載

『Partek Flow（以下Flow）』は次世代シーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 リード配列からバーコードやUMIのトリミング、参照ゲノム配列への アラインメント、UMIのデデュプリケーション、バーコードの絞り込みなど、 Single Cell RNA-seqの前処理に必要な機能を搭載しています。 当資料ではFlowを用いたSingle Cell RNA-seqデータ解析について ご紹介しています。 【掲載内容】 ■Single Cell RNA-seqとは ■バーコードやUMIの除去 ■UMIデデュプリケーション ■バーコードの絞り込み ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他解析

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【技術情報】MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析

【技術情報】MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析

環状ペプチドにフォーカスした解析事例を掲載！

「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品の モデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。 広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの 配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。 当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を 紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■環状ペプチドの概要 ■環状ペプチドのモデリング ■環状ペプチドの配座解析 ■環状ペプチドの安定性予測 ■環状ペプチドの膜透過性予測 ■環状ペプチドの相互作用解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他情報システム

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【技術情報】空間的遺伝子発現データ解析

【技術情報】空間的遺伝子発現データ解析

同時に複数のデータを解析することが可能！4週間無償トライアルにてご評価いただけます

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインター フェース（GUI）上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで 幅広くご利用いただけます。 当資料では、「Single Cell RNAseqtoolkit」を用いた組織切片の空間的遺伝子 発現データ解析についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■空間的遺伝子発現解析とは ■組織切片の画像データの取得 ■遺伝子発現データと組織切片画像の重ね合わせ ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他
  • その他解析

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【技術情報】RNA-seq データ解析

【技術情報】RNA-seq データ解析

エンリッチメント解析やパスウェイマップの表示が可能！RNA-seqデータ解析をFlowだけで完結することができます

Partek Flowは、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq等のデータを解析することが可能。 Flowはリード配列の参照ゲノム配列へのアライメント前後の品質保証/ 品質管理（QA/QC）、発現遺伝子量の推定、正規化、発現変動遺伝子の検出など、 RNA-seq データ解析に必要な機能を多数搭載しています。 当資料では、RNA-seq データ解析について紹介します。 【掲載内容】 ■RNA-seq データ解析とは ■参照ゲノム配列へのアライメント ■発現遺伝子の推定と正規化 ■発現遺伝子リストの作成と生物学的解釈 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア（ミドル・ドライバ・セキュリティ等）

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【新製品情報】Single Cell ATAC-Seqデータ解析

【新製品情報】Single Cell ATAC-Seqデータ解析

ATAC-SeqやSingle Cell ATAC-Seqデータ解析の活用例をご紹介！

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサーから出力されたリード配列データを読み込んで、遺伝子の 発現量やDNAの変異などを解析することが可能です。 当製品では、Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencingや Single Cell ATAC-Seqデータの解析が可能です。 当資料では、ATAC-SeqやSingle Cell ATAC-Seqデータ解析の活用例を紹介します。 【掲載内容】 ■ATAC-Seq ■Single Cell ATAC-Seq ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • 細胞解析ソフトウェア

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【新製品情報】シングルセルレパトア解析

【新製品情報】シングルセルレパトア解析

シングルセルレパトア解析の事例を紹介！様々なOSのマシンで「Flow」を利用できます！

『Partek Flow』（以下、Flow）は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列データを読み込んで、 遺伝子の発現量やDNAの変異などを解析することができ、T細胞やB細胞に 発現しているT細胞受容体（TCR）やB細胞受容体（BCR）の遺伝子配列を 調べるレパトア解析が可能。 また1細胞レベルでレパトア解析を行うことで、異なる特異性を持ったTCRや BCRを発現したリンパ球の多様性を調べることができます。 【掲載内容】 ■製品概要 ■シングルセルレパトア解析とは 　・シングルレパトア解析データの取込 　・クロノタイプ解析 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ネットワーク関連機器・ソフト

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『MOE』結合部位における溶媒解析

『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析

MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、 分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を支援します。 【Solvent Analysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド、受容体の各分子系を同時に処理 ■計算には水分子の相関を考慮 ■水分子だけでなく、イオンや疎水性原子の存在確率も可視化 ■長時間のシミュレーションが不要 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOE』ペプチド解析

『MOE』ペプチド解析

ペプチドの解析、改変、構築を支援する多彩な機能で研究をサポートします

「MOE」はペプチド解析のための機能を多数搭載しております。 変異体解析として自動的な変異体モデルの構築と、各種物性値の推算などが可能です。 相互作用解析では、ドッキング計算によるペプチド-受容体複合体の構造 予測などが行えます。表面解析機能により分子表面の特徴づけも行えます。 配列を指定しペプチドを構築することも可能です。ペプチドの解析、 改変、構築を行える多彩な機能により研究をサポートします。 【特長】 ■ペプチド構築 ■変異体解析 ■相互作用解析 ■表面解析 ■構造解析 ■非天然アミノ酸（特殊アミノ酸）の構築/変異もサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】MOEsaicによるMMP解析とR-group解析

【技術情報】MOEsaicによるMMP解析とR-group解析

MOEsaicを用いて重要な置換基の検出、キー化合物の発見などが可能に！

『MOEsaic』は、Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group解析などの SAR解析、分子設計、文書作成が行える「MOE 2016.08」のウェブアプリケーションです。 当アプリケーションを用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 指定した部分構造だけが異なる分子ペアの検索をはじめ、指定した構造変換に 対応する分子ペアを検索し、構造変換による特性値の変化確認や、母核と 置換基へのフラグメント化などを行うことが可能です。 【特長】 ■MMP検索 ■MMPプロファイル ■R-group分解 ■R-groupプロファイル ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】MedeA Phononによる振動特性解析

【技術情報】MedeA Phononによる振動特性解析

熱力学諸量やIR/Ramanの解析機能強化！フォノン計算の結果を利用しやすくなりました

『MedeA Phonon』は、直接法によって固体の振動特性を計算する ソフトウェアです。 固体の振動特性を計算することで、熱振動に起因する熱力学諸量や IR/Ramanスペクトルを算出することができます。 当資料では、MedeA3.4から実装されたMedeA Phononの 新しい解析機能を中心に紹介しておりますので、是非ご覧ください。 【掲載内容】 ■MedeA Phonon概要 ■フォノン分散図および状態密度図 ■熱力学諸量 ■Ramanスペクトル ■IRスペクトル ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの遺伝子発現解析の結果を統合してPCSK9遺伝子の機能を解析

Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生物種での発現変動の特性を明らかにしました。また、PCSK9遺伝子と共発現する遺伝子を同定しています。 『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 このケーススタディの概要は以下の通りです。 ■遺伝子の機能解析と適応症の研究 ■モデル生物の選択 ■遺伝子のネットワーク解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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