ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！
「Flow」は、次世代シーケンサー（以下、NGS）から出力されたリード配列を 読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。 リード配列の参照ゲノム配列へのアラインメント、アラインメント前後の QA/QC、ピーク検出、検出したピークのアノテーション、転写開始点からの 距離でのプロットなど、ChIP-seqのデータ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【ChIP-seqとは】 ■ChIPとNGSを組み合わせてゲノムワイドにエピゲノム情報を 取得する手法 ■様々な生物で転写制御メカニズムの理解に大きく貢献 ■プローブ設計に依存した制限がない、ダイナミックレンジが広い ■ChIP on chipと比べてバイアスのない精確な解析が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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基本情報
【特長】 ■ピーク検出 ・FlowはChIP-seq のピーク検出を行うためにMACS2プログラムを搭載 ・MACS2はChIP-seqのピーク検出で最もよく使われているプログラム ・ゲノムサイズ、免疫沈降サンプル(chip)と対照サンプル(mock)のペアを 選択するだけで簡単にピーク検出を実行 ■アノテーション ・転写開始点から見たプロモーター領域の上限下限および遺伝子データ ベースを選択するだけで、 検出したピークに対して遺伝子との位置 関係のアノテーションを付加 ・ヒトやマウスなど代表的な生物種のRefSeqやEnsemblといった遺伝子 データベースを自動的にダウンロード ■TSSプロット ・TSSを中心にしたプロモーター領域にいくつのリードがアラインメント されているかをTSSプロットで表示 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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企業情報
株式会社モルシスは、計算化学および情報科学に基づくパッケージソフトウェアや研究データ管理システムの販売、導入支援、技術サポートを行っています。生命科学と材料科学の基礎研究分野で、ユニークなソリューションと多彩なサービスを提供し、お客様の研究開発に貢献しています。弊社スタッフは、優れた技術を持つ国内外の多数のビジネスパートナーと密接に連携し、お客様のニーズに応じて研究開発活動を支援するソリューションの導入支援および技術サポートを提供いたします。研究開発のDX推進による効率化とコスト削減をお考えの方は、ぜひ弊社までお気軽にお問い合わせください。