溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュールが多数!NMR構造の精細化も可能です
『Amber』は、生体分子のために開発された、モデリング および分子力学と動力学計算シミュレーションのパッケージです。 モデリングでは、核酸やアミノ酸のデータを用い構造を構築したり、 溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュールが多数用意 されています。 実験データを用い、NMR構造の精細化を行うこともできます。 【特長】 ■溶媒水分子の配置や系の中和などを行うためのモジュール多数 ■NMR構造の精細化が可能 ■動力学計算のトラジェクトリーを解析するツールあり ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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基本情報
【プログラム概要(抜粋)】 ■sander: 分子動力学計算を行うメインプログラム ■pmemd: sanderの計算速度を大幅に改良したもの ■NAB: 分子構造を操作する事に特化したプログラムを書くための言語環境 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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納期
用途/実績例
【利用例(抜粋)】 ■NMRリファインメント ■QM/MM/MD ■NEB法 ■脂質二重膜 ■アンブレラ・サンプリング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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配座探索・結晶構造探索ソフトウェアCONFLEXの開発・販売・サポートを行っております。 また、Gaussian社の販売代理店として、量子化学計算ソフトウェアGaussianおよびGaussViewの販売及びサポート、 UCSFの販売代理店として分子動力学計算ソフトAmberの販売・サポート、 Revvity社の販売代理店としてChemDrawの販売・サポートなども行っております。 講習会や受託計算、計算化学ハードウェアの提供やインストール作業も承っております。 豊富な納品実績により、確実に丁寧にサポートいたします。 ご要望の際は、お気軽にお問合せください。