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Ion PGM次世代シーケンサーによる解析を承ります！
瑞輝科学生物株式会社では、次世代シーケンサーによる受託解析サービス を行っています。 シーケンシングから得られた配列データと公共データベースの検索結果を 基に、「クラスター解析・ヒートマッピング」「自己組織化マップ」 「積上げ横棒グラフによる細菌叢のプロファイリング」といったような 解析結果を作成します。 その他、PCRや定量リアルタイムPCRによる各種検査や、試験法の開発 支援なども行っております。 ご相談案件がございましたら、お気軽にお問い合わせください。 【受託内容】 ■細菌叢解析（16Sメタゲノム） ■環境生物叢解析（16S/18Sメタゲノム） ■アンプリコンシーケンス ■細菌／真菌 RNA-seq（遺伝子発現解析） ※詳しくはカタログをご覧頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で、有効な手段であることを見出しました！※解析事例集進呈中
京都大学生態学研究センターでは、カエデ属を利用するハマキホソガの 多様化や種同士での共存に関わるプロセスを研究されております。 当社が一部解析を受注いたしましたのでご紹介します。 本解析ではハマキホソガ特異的なブロッキングプライマーを使うことで ホスト由来の遺伝子の増幅を抑えることを可能とし、ホストである ハマキホソガの同定及び体内の寄生者の網羅的な探索を効率的に実施。 ブロッキングプライマーを用いた解析手法が、外見から検出が困難な ホストと寄生者の関係を解明する上で有効な手段であることを見出しました。 【事例概要】 ■ブロッキングプライマー存在下/非存在下でPCRを実施 ■ハマキホソガ幼虫274検体についてCOIアンプリコン解析をMiseqにて実施 ■得られたリードから、ハマキホソガ10種と寄生蜂13種を同定し、 ホスト-寄生者の関係を解明 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
オプションサービスを多数ご用意！「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」としてデータを可視化します※解析事例集進呈中
『ターゲットアンプリコン解析』は、パッケージ化することによって リーズナブルにご利用できるサービスです。 解析対象領域は、16S V4／18S V9／ITS（gITS7-ITS4）／COI （mlCOIintF-HCO2198）／MiFish（12S V5）など。 解析対象領域を増幅ターゲットとしたサンプル調製用プライマーを 無償提供し、サンプルをお送りいただきます。 その後、当社でQIIME等を使用し、「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」 としてデータを可視化します。 【オプションサービス（抜粋）】 ■解析対象領域長の変更（400-500bp程度） ■Library Mix調製 ■レアファクションカーブと主座標分析（PCoA） ■OTUのBLAST解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
サンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archaea）の受け入れが可能！※解析事例集進呈中
『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』は、パッケージ化することによって リーズナブルにご利用できるサービスです。 受け入れサンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archaea）が可能。 オプションサービスとして、Prokkaを用いたオートアノテーション、 コンティグのBLAST解析、Sequence Typeのタイピングをご用意しております。 ご用命の際は、お気軽にお問い合わせください。 【解析概要】 （1）お客様：抽出したゲノムDNAを当社にご送付 （2）当社：受領サンプルのQC作業を行う （3）当社：MiSeq解析用のアダプターライブラリを調製 （4）当社：MiSeqで2×300 bpランを行う （5）当社：取得データのアセンブルおよびコンティグを作成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
