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ATAC-SeqやSingle Cell ATAC-Seqデータ解析の活用例をご紹介！
『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサーから出力されたリード配列データを読み込んで、遺伝子の 発現量やDNAの変異などを解析することが可能です。 当製品では、Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencingや Single Cell ATAC-Seqデータの解析が可能です。 当資料では、ATAC-SeqやSingle Cell ATAC-Seqデータ解析の活用例を紹介します。 【掲載内容】 ■ATAC-Seq ■Single Cell ATAC-Seq ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
エンリッチメント解析やパスウェイマップの表示が可能！RNA-seqデータ解析をFlowだけで完結することができます
Partek Flowは、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー（NGS）から出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq等のデータを解析することが可能。 Flowはリード配列の参照ゲノム配列へのアライメント前後の品質保証/ 品質管理（QA/QC）、発現遺伝子量の推定、正規化、発現変動遺伝子の検出など、 RNA-seq データ解析に必要な機能を多数搭載しています。 当資料では、RNA-seq データ解析について紹介します。 【掲載内容】 ■RNA-seq データ解析とは ■参照ゲノム配列へのアライメント ■発現遺伝子の推定と正規化 ■発現遺伝子リストの作成と生物学的解釈 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ゲノムワイドにエピゲノム情報を取得！バイアスのない精確な解析が可能！
「Flow」は、次世代シーケンサー（以下、NGS）から出力されたリード配列を 読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。 リード配列の参照ゲノム配列へのアラインメント、アラインメント前後の QA/QC、ピーク検出、検出したピークのアノテーション、転写開始点からの 距離でのプロットなど、ChIP-seqのデータ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【ChIP-seqとは】 ■ChIPとNGSを組み合わせてゲノムワイドにエピゲノム情報を 取得する手法 ■様々な生物で転写制御メカニズムの理解に大きく貢献 ■プローブ設計に依存した制限がない、ダイナミックレンジが広い ■ChIP on chipと比べてバイアスのない精確な解析が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Single Cell RNA-seqのデータ解析を行う為の豊富な機能を搭載
『Partek Flow（以下Flow）』は次世代シーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 リード配列からバーコードやUMIのトリミング、参照ゲノム配列への アラインメント、UMIのデデュプリケーション、バーコードの絞り込みなど、 Single Cell RNA-seqの前処理に必要な機能を搭載しています。 当資料ではFlowを用いたSingle Cell RNA-seqデータ解析について ご紹介しています。 【掲載内容】 ■Single Cell RNA-seqとは ■バーコードやUMIの除去 ■UMIデデュプリケーション ■バーコードの絞り込み ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
