研究支援ソフト - メーカー・企業4社の業務用製品ランキング

中分子創薬研究を加速するBIOVIAのソリューション

新たなモダリティとして注目されている中分子創薬研究のBIOVIAのソリューションをWEBにて公開

公開ページ： http://accelrys.co.jp/solutions/collaborative-science/MIDDLE-MOLECULAR/ 近年、医薬品開発のターゲットとして、従来の有機低分子化合物、抗体などのタンパク質製剤に加えて、サイズ的にはこれらの中間にあたる、いわゆる中分子が新たなモダリティとして注目されています。ダッソー・システムズ・バイオビアは、低分子化合物、タンパク質製剤、双方に向けた様々な研究支援ソリューションを開発してきた長い歴史と、その間ユーザーの要求にこたえる形で常に発展させてきた確かな技術を保持しており、これらをベースとして近年では配列と構造をシームレスに扱う仕組みを開発、化合物登録/参照システムや電子実験ノート、描画ツールやワークフロー作成ツール等に組み込んでいます。これにより、研究者は配列と構造を行き来しながらストレスなく必要な情報を取得、解析することが可能で、中分子創薬を効率良く進めるうえでこの上ないアドバンテージになると考えられます。 WEBサイトにて、キーとなるいくつかの技術についてご紹介させて頂きます。

企業：ダッソー・システムズ株式会社
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【製品資料】SciMAPS 4.3 リリース

6月にリリースされました『SciMAPS 4.3』の概要について紹介します

材料設計支援プラットフォーム『SciMAPS』の各計算プログラムは、計算プログラム本体とそれに対するインターフェースから構成されるプラグインとして提供されます。基本環境である「Platform」に各プラグインを追加することにより研究に適した環境を取り揃えることができます。当資料では、6月にリリースされました4.3 の概要について紹介します。【掲載概要】 ■リリース概要 ■SAFT-γ Mie力場 ■MesoAtom converter ■Size distribution ■VOTCA Plug-in ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

企業：株式会社モルシス
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「PROTAC(タンパク質分解誘導薬)の設計支援」の資料進呈

In silico 手法を利用したPROTAC(タンパク質分解誘導薬)の設計支援の抜粋記事を配布中！

『PROTAC』は、細胞内のユビキチン-プロテアソーム系を利用して標的タンパク質を分解誘導する有機分子です。細胞内において標的タンパク質およびE3リガーゼと複合体(三元複合体)を形成することで両者を物理的に近接させ、標的タンパク質のユビキチン化を引き起こします。「PROTAC」が細胞内から消失した後も標的タンパク質の機能は生合成されるまで回復しないため、触媒的な作用と合わせると、低濃度かつ長時間にわたり作用することも大きな特長です。現在、「PROTAC(Proteolysis Targeting Chimera)」のin silico 手法を利用した設計支援について紹介した「PROTAC Modeling Tools - In silico 手法を利用したPROTAC(タンパク質分解誘導薬) の設計支援」の抜粋記事を配布中です。「お問い合わせ」より「抜刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。 ※詳しくは、お気軽にお問い合わせ下さい。

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その他タンパク質研究
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【技術情報】VUSの再分類とバイオマーカー探索

疾患の遺伝的要因や薬物反応に関する正確な情報を提供する「DISGENET」に関する情報を掲載！

DISGENETは、ヒトの疾患関連遺伝子&変異データベースです。ヒトの疾患に関連する遺伝子や変異のデータを専門家によりキュレートし統合することで、疾患の遺伝的要因や薬物反応に関する正確な情報を提供。またDISGENETには疾患、遺伝子、変異などの関係を視覚的にできるグラフ機能も備えています。本資料では、DISGENETを用いて臨床的意義が不明な変異を重要な変異として再分類する事例と全身性強皮症のバイオマーカーの探索事例を紹介します。【掲載内容】 ■Variants of Unknown Significance ■rs74653330変異の再分類 ■全身性強皮症のバイオマーカー ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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データベース
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【新製品情報】Beacon Neuroscience リリース

医薬品開発の意思決定支援ツールBeaconに、Neuroscienceモジュールがリリース！

Beaconの『Neuroscienceモジュール』は、神経変性疾患、脳卒中、および神経筋疾患などの領域における、7,500以上の薬剤および9,000以上の臨床試験データを網羅した業界随一のデータベースの探索システムです。 30以上の検索フィルター機能、マニュアルで厳選され日次更新される非臨床および臨床データ、そして今後予定されている企業・取引データへの拡張などにより、創薬研究から事業開発、臨床デザイン、競争インテリジェンスまで、神経科学研究の包括的な戦略支援を実現します。【以下のデータを網羅】 ■非臨床・臨床試験段階や開発中止された7,500以上の薬剤 ■非臨床試験情報(in vitro/in vivo双方の、PK・毒性などの結果) ■9,000以上の臨床試験情報(患者選択基準、投与戦略、エンドポイント、毒性結果など) ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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開発支援ツール（ICE・エミュレータ・デバッガ等）
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【新製品情報】抗体の取り扱い機能の追加とAI機能の強化

抗体・ADCの配列とアノテーションの情報の管理や、AIによるタンパク質–リガンド複合体の構造予測が、CDD Vaultで可能に！

『CDD Vault』は、創薬や生命科学研究における研究資材やアッセイ情報の管理・共有・可視化機能を中核とした、クラウド型の研究データ管理システムです。電子実験ノート、在庫管理、APIを介した他システムとの連携機能も備えており、幅広い分野の研究データを一元管理できます。リアルタイムな情報共有により、所属や所在地、専門分野の異なる研究者間のコラボレーションを促進し、研究業務の効率化を実現します。【抗体およびADCの取り扱い機能の追加】・通常の抗体の登録・アノテーション情報の付与・二重特異性抗体の登録・ADCの登録【AI機能の強化】・Boltz-2によるタンパク質–リガンド複合体の立体構造予測と結合親和性の評価 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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【創薬研究向け】Labstep

研究記録を効率化し、創薬研究を加速！

創薬研究において、実験データの正確な記録と管理は、研究の効率性と信頼性を高める上で不可欠です。特に、膨大な実験データと複雑なワークフローを扱う創薬研究では、記録の誤りや情報共有の遅れが、研究の遅延や成果の質の低下につながる可能性があります。Labstepは、直感的な操作で実験記録、試薬管理、実験ワークフロー作成をサポートし、研究活動を効率化します。【活用シーン】・創薬研究における実験データの記録・化合物ライブラリの管理・実験プロトコルの共有【導入の効果】・実験データの信頼性向上・研究効率の向上・情報共有の円滑化

企業：インフォコム株式会社ライフサイエンスグループ
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【ONE LAB】市場投入までの期間を短縮

ホワイトペーパー進呈！研究データ・リソース・プロセスの統合と標準化を実現

『ONE LAB』は、スタッフ・リソース・プロセス・データを統合し、効率性とコラボレーションを改善するインダストリー・ソリューション・エクスペリエンスです。データ主導型のプロセスにより、治療薬の設計・開発・規格決定・リリースが低コストかつ効率的に行えます。さらに、システムおよび治療薬候補との相互作用をナレッジとしてカタログ化し、すばやい意思決定とプロジェクトの着実な進展を実現。【特長】 ■研究室の所定のプロセスに特化したユーザーエクスペリエンス ■シームレスで効率的なワークフローを支える各種機能を提供 ■リリースが低コストかつ効率的に ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【セミナー情報】MOEフォーラム2017開催報告

MOEの最新技術の紹介と5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して講演

『MOEフォーラム2017』では、開発元からMOEの最新技術の講演、5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して講演いただきました。【開発元講演】 ■Prediction of Protein-Protein Binding Sites and Epitope Mapping ■Optimizing Protein Properties in the Cloud with MOE 【招待講演】 ■「創薬等研究推進に向けたタンパク質の大規模情報解析」 ■「Structure-based drug designの手法を活用した創薬シード創成」 ■「創薬研究におけるSupervised Molecular Dynamicsの有用性検証」 ■「タンパク質間相互作用を誘導する有機小分子とその相互作用の　解析法の開発」 ■「Integratedi n silico Strategy for Drug Discovery」当日の資料をご希望の方はご連絡ください。 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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ソフトウェア（ミドル・ドライバ・セキュリティ等）
その他組込み系（ソフト＆ハード）
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【新機能紹介】CDD Vault (2019.04)

新機能の追加や既存機能の強化は自動的に反映！クラウド型研究データ管理システムCDD Vaultの機能強化をご紹介

『CDD Vault』は、米国Collaborative Drug Discovery（CDD）社により開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。「CDD VaultとELNモジュールの連携強化」をはじめ、「ELN へのアッセイアノテーション付与」や「生物製剤情報の管理」、「数値計算時に不等号を適切に保持」等を2018年に実装。当資料では、特に重要な機能強化である最初の2点について紹介しています。【掲載内容】 ■CDD Vaultとは ■CDD VaultとELNモジュールの連携強化 ■ELNへのアッセイアノテーション付与 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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プロジェクト管理
文書・データ管理
企業情報ポータル・グループウェア
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【技術情報】Scilligence Inventory 製品紹介

「Scilligence Inventory」の特長などについて詳しく解説！

Scilligence社のライフサイエンス向けインフォマティクス・ソフトウェアは電子実験ノート、分子情報およびアッセイデータ登録システム、在庫管理システム、プロジェクト管理システム、実験データ管理システムなどの製品から構成されています。当資料では、在庫管理システムである「Scilligence Inventory」について紹介しています。【掲載内容】 ■Scilligence社製ソフトウェアの特長 ■Inventoryでの在庫管理 ■Scilligence社の他製品との連携 ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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MOE-Extensions for KNIME

簡単かつ柔軟なワークフロー作成！KNIMEで動作するMOEインターフェイス

『MOE-Extensions for KNIME』は、MOEをワークフローツール「KNIME」上で使用するためのインターフェイスです。当製品を利用することで、化合物や受容体構造の前処理、ドッキング、FBDD、ファーマコフォア検索などのMOEによる連続的な処理を容易に定義できます。【特長】 ■誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 ■プログラミング不要で作業を自動化 ■処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 ■創薬研究のための多数のノードを提供 ■KNIMEの他ノードとの連携が容易（機械学習等） ■ユーザーオリジナルノードの作成が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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その他ネットワークツール
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創薬モダリティの多様性に対応したソフトウェア《動画＆資料提供》

創薬モダリティに興味のある方必見！ 3つのライフサイエンスソフトウェアを紹介！

《情報計算化学生物学会 2020 年大会で開催したモルシス企業セミナーの動画のリンクと資料をご提供します。》創薬モダリティの多様化に伴い、創薬研究支援ソフトウェアにはモダリティに対応した機能が求められています。弊社取り扱い製品の中から「統合計算化学システム MOE」、「研究情報管理統合プラットフォーム Scilligence」、「医薬品安全性情報ポータル OFF-X」の３製品について創薬モダリティ関連の機能を紹介します。・MOE 低分子、ペプチド、タンパク質、抗体、核酸のデザインとシミュレーションに対応した統合計算化学プラットフォーム・Scilligence 多様な創薬モダリティの研究データに対応した研究情報管理統合プラットフォーム・OFF-X 規制機関、学術論文、学術会議、企業等の情報源から収集された前臨床試験の毒性情報と臨床試験および市販後の安全性情報を統合し、解析機能と組み合わせて情報提供する医薬品の安全性情報ポータル ※詳しくはPDFダウンロード、またはお問い合わせください。

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タンパク質構造表示ソフトウェア
計算化学
ファイル管理
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【新製品情報】PSILO 2022.02の新機能

創薬研究を支援！PSILO 2022.02で追加される新機能をご紹介

『PSILO』は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。公共データやインハウスデータを統合的に管理し、独自の検索機能や解析機能により創薬研究を支援します。 PSILO 2022.02では、データベースの連携機能が新たに追加されました。さらに、構造バリデーション機能やタンパク質ファミリーの管理機能が強化され、より便利に使いやすくなりました。当資料では、PSILO 2022.02で追加される新機能を紹介します。【掲載内容】 ■データベースの連携 ■AlphaFold ■構造バリデーション機能の強化 ■ファミリーの管理機能の強化 ■MOEとの連携 ■その他の新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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データマイニング
ネットワーク関連機器・ソフト
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【技術情報】DISGENET plus：TLR7標的疾患の探索

疾患の遺伝的要因や薬の副反応に関する新たな発見を支援します！

当資料では、Toll-like receptor(TLR)7に関連する疾患やTLR7標的薬に関連する疾患の探索事例をご紹介しております。「DISGENET plus」は、ヒトの疾患に関連する遺伝子データと変異データをさまざまなデータベースや科学文献から専門家がキュレーションして統合した発見プラットフォーム。各項目ごとに詳しく解説しておりますので、是非、ご一読ください。【掲載内容】 ■はじめに ■TLR7に関連する疾患 ■TLRファミリー間の比較 ■TLR7標的薬と疾患 ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】FMO計算に基づくPLIF解析法の開発

FMO-PIEDA法の計算値をPLIFに統合して相互作用を解析する新手法の開発

創薬において、標的タンパク質とリガンドの相互作用を精密に理解することは、薬効や選択性の向上において重要な鍵となります。量子化学計算手法であるFMO–PIEDA法によるエネルギー成分の分解は、単一のリガンドと受容体間の相互作用を分子軌道レベルで詳細に解析するのに有効です。一方、統合計算化学システムMOEに搭載されているPLIF法はアミノ酸残基– リガンド間の接触を相互作用タイプ別に符号化するため、複合体間の効率的なパターン比較が可能です。そこで当社では、PIEDA由来の相互作用エネルギーをPLIFに統合し、親和性や選択性に関与する主要な相互作用タイプを抽出することで、複数の複合体間の比較を可能にする新たな手法「PIEDA-based PLIF」を開発しました。【特長】 ■得られたフィンガープリントデータは、クラスタリングや類似性解析、　活性予測モデルの構築など、多彩なデータ解析に利用可能 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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その他ソフトウェア
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各業界の有力企業に選ばれる材料研究DXツール【資料進呈】

パナソニック、ブリヂストン、アッヴィ、サムスン、ロレアルなど、各業界の有力企業が採用。

シュレーディンガーの高度な物理ベースモデリングおよびAI/機械学習ソフトウェアは、高分子材料、電池、半導体、有機エレクトロニクス、触媒、医薬品製剤、化粧品、金属・合金・セラミックなど、多様な材料開発に対応しています。

企業：シュレーディンガー株式会社
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組込みOS
EAI・ETL・WEBアプリケーションサーバ
シミュレーター
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【書籍発刊】「MOE」を用いた創薬研究の効率化　※抜刷進呈中

in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例としてCCG社の統合計算化学システム「MOE」の特長と事例を紹介

株式会社技術情報協会から2018年1月31日に「in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術」が発刊されました。本書には、コンピュータの処理能力の速さを活かしつつ、計算コスト増大の課題をいかに克服するか？という課題についてin silico創薬を成功に導く計算科学やスパコン、データベース構築の重要技術が満載されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。第4章「in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例」の第2節で「MOE」を用いた創薬研究の効率化について紹介されています。本節はMOEの特長とMOEを利用した創薬研究の効率化の事例について詳しく説明しています。特にMOEが持つ多彩な機能の中から特にバーチャル・スクリーニングに焦点を絞り、解析事例も交えながら、MOEの機能を紹介しています。本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい！「PDFダウンロード」からはMOEのカタログをダウンロードできます。

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【食品成分分析向け】AILANI

LLM搭載、食品成分分析を加速する検索ツール

食品業界における成分分析では、安全性や品質を確保するために、最新の研究論文や特許情報を迅速に収集し、分析することが重要です。特に、食品添加物やアレルギー物質に関する情報は、法規制遵守のためにも不可欠です。AILANIは、LLMを活用した高度なセマンティック検索により、これらの情報を効率的に検索し、分析業務を支援します。【活用シーン】・食品添加物の安全性評価・アレルギー物質に関する研究・新素材開発【導入の効果】・最新情報の迅速な収集・分析時間の短縮・研究効率の向上

企業：インフォコム株式会社ライフサイエンスグループ
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その他研究用ソフトウェア
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すべての研究者に！クラウド型電子実験ノート『Labstep』

研究者が研究者のために開発！簡単な操作感、豊富な機能で研究をサポート！

オックスフォード大学発 !”研究者が研究者のために” 開発した、クラウド型電子実験ノート（ELN）です。実験記録だけでなく、試薬管理や実験ワークフロー作成など研究活動すべてをサポートします。 1）直感的かつ簡単な操作感で、誰でもすぐに利用開始できます 2）導入までにコスト、時間はかかりません（最短1ヶ月） 3）データ記録（テキスト、ファイル、化学構造、遺伝子配列、図表）から検索、共有、比較を迅速に実施可能【主な特長】 ■ 高いカスタマイズ性で、幅広い研究分野に柔軟に対応！　 ⇒ 医薬、バイオ、化学、食品などなど分野や業種は問いません ■ セキュリティとコンプライアンス　 ⇒ ISO27001認定、GMP、GLP、FDA21 CFR Part 11準拠をサポート　 ⇒ 監査証跡機能により、「いつ、誰が、何を、どのように実験したのか」を記録、 ■ ブラウザでどこでも利用可能、デバイスも自由　 ⇒ スマホで記録することで、実験台上ですぐに記録 ■ バイオロジスト・ケミストをサポートする機能も充実 ■ サポートも充実！AIチャットによりすぐに問題を解決！