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株式会社モルシス

設立平成28年12月5日
資本金3000万
従業員数23名
住所東京都中央区八丁堀三丁目19番9号 ジオ八丁堀7階
電話03-3553-8030
  • 特設サイト
  • 公式サイト
最終更新日:2025/08/01
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【新製品情報】MedeA 3.3 リリース

Material Intelligence プラットフォーム!新バージョン3.3のアップデート項目についてご紹介

MedeAは、第一原理計算や力場計算を基に材料のさまざまな物性を算出する ことができるソフトウェアです。 当資料では、新バージョン3.3のアップデート項目について紹介します。 MedeA 3.3では、第一原理計算プログラムVASPが新版6.2に対応し、 分子動力学計算プログラムLAMMPSはオフィシャルな安定版LAMMPS 29Oct20に 更新されました。 また、これらのプログラムの架け橋として、新モジュール「Machine Learning Potential(MLP)」がリリースされました。 【掲載内容】 ■MedeA環境 ■計算エンジン ■生成エネルギー ■力場 ■GPUの活用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】電解液に対応したCOSMO-RS-ES法

電解液などのイオンを含む系に対応することが可能!COSMO-RS-ES法をご紹介します

熱力学物性推算ソフトウェアBIOVIA COSMOthermの新バージョン2021に 搭載されたCOSMO-RS-ES(ES:Electrolyte System)法を紹介します。 COSMO-RS-ES法は、COSMO-RS法とPizter-Debye-Huckel モデルを 組み合わせた方法で、COSMO-RS法では考慮が難しい電解液などの イオンを含む系に対応することが可能になります。 “COSMO-RS-ES法の推算事例”などを掲載しておりますので、 ぜひご一読ください。 【掲載内容】 ■COSMO-RS-ES法 ■COSMO-RS-ES 法の推算事例:  酢酸カリウムを添加した酢酸メチル―メタノールの定圧気液平衡 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】Batchremovalツールによるバッチ効果の低減

バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能についてご紹介!

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー(NGS)から出力されたリード配列を読み込んで、 RNA-seqやSingle Cell RNA-seq等のデータを解析することが可能。 当資料では、バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能について 紹介しています。 【掲載内容】 ■Flowの製品概要 ■Batch removalとは ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】統合計算化学システム『MOE』

「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能をご紹介!

「Reverse Fingerprint Modeling」は、MOEユーザーコミュニティーのための SVLコード交換サイトSVL Exchangeで公開されている統合計算化学システム MOEのアドオンプログラムです。 化合物のさまざまな分子フィンガープリントと活性値の情報を用いて、 活性化合物に共通の部分構造や活性/不活性に寄与する部分構造を特定したり、 ファーマコフォアモデルを構築/評価したりできます。 当資料では、「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■Reverse Fingerprint Modelingの概要 ■Motif Detection ■Virtual Pockets ■Fragment Placement ■Activity Scan ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】医薬品の探索と薬理・安全性予測

独自の予測モデルにより薬理活性、毒性・安全性、代謝産物の予測を行います!

『Chemotargets CLARITY』は、膨大な量のアッセイデータと有害事象レポートを 整理統合して活用することで、隠れた知識を発見し、医薬品開発の効率を 改善する革新的なデータサイエンス・ソリューションです。 アッセイデータは、公共および商用データベースから取得した524万以上の 化合物に対する448万以上の相互作用情報から成り、有害事象情報は、過去50年間 にFAERSから抽出された1500万以上のレポートから成ります。 これらの膨大なデータに対して、Drug Explorer、FAERS Explorer、MedChem Explorer のデータ探索ツールを用いて、有益な知識を引出し、また、独自の予測モデルにより 薬理活性、毒性・安全性、代謝産物の予測を行います。 【掲載内容】 ■はじめに ■Drug Explorer ■Prediction Analysis ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】CDD Vault新機能紹介 (2021.07)

多数の実績あり!2021年1月以降に実装された新機能についてご紹介

米国Collaborative Drug Discovery社により開発された『CDD Vault』は、化合物・抗体・細胞などのサンプルの情報とアッセイ情報の管理・共有機能と、電子実験ノート機能を有するクラウドサービスです。 優れた可視化機能を持つ『CDD Vault』は、システム導入や管理に手間をかけることなく、創薬研究データの管理システムをすぐに利用できるため、製薬企業やベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を進めるための プラットフォームとして多数の実績があります。 当資料では、2021年1月以降に実装された新機能について紹介しています。 【掲載内容】 ■CDD Vaultとは ■ユニークIDを使用したサンプルの登録 ■Marvin JSの新しい描画テンプレート ■ELNから登録したエントリーのリンク ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】CBIS:配合研究データの管理

複数の原材料を配合して望む性質の素材を作る配合研究について、原材料、配合レシピ、測定した物性などのデータを統合的に管理。

ChemInnovation Software社製『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で 生じた実験データ、参考文献やレポートといった文書など、研究に関わる 多様なデータを統合して管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 当資料では、配合研究のデータを管理するCBISのレシピ管理モジュールに ついて紹介しています。 【掲載内容】 ■配合研究における情報管理 ■CBISレシピ管理モジュールの機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】SeeSAR 11リリース

共有結合ドッキングのサポートなど多数の機能強化!新機能を中心にご紹介します

『SeeSAR』は、メディシナルケミストのために開発された3Dリガンド設計ツールです。 リガンド-受容体間の相互作用解析、分子編集、ドッキングシミュレーション、 フラグメント創薬、リガンド結合部位解析などの様々なSBDD機能が統合されています。 バージョン11では、共有結合ドッキングのサポート、リガンド結合部位探索の刷新、 結合部位の3Dモデルの出力等、多数の機能強化がなされています。 当資料では、SeeSAR11で搭載された新機能を中心に紹介しています。 【掲載内容】 ■SeeSAR 11新機能 ■共有結合ドッキングのサポート ■結合部位探索の刷新 ■結合部位の3Dモデルの出力 ■その他機能強化 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他ソフトウェア

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【セミナー情報】Scienomics社ウェビナーのご紹介

SciMAPSを紹介するためのウェビナーを開催!最近開催されたウェビナーの内容をご紹介します

『SciMAPS』は、量子化学計算からメソスケール計算まで時間的にも 空間的にも異なるさまざまなスケールの計算科学手法に対応した 材料設計支援プラットフォームです。 開発元であるScienomics社では、SciMAPSの各パッケージの機能や その応用事例を紹介するための月に1度ウェビナーを開催しております。 当資料では、最近開催されたウェビナーの内容を紹介いたします。 【掲載内容(抜粋)】 ■Thermophysical properties and phase behavior of industrially relevant systems ■Molecular simulations of tribological systems using MAPS and LAMMPS ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】MedeA-VASPによる分子結晶の安定性評価

『MedeA-VASP』を用いたグリシン結晶の計算事例をご紹介します!

「MedeA」は、第一原理計算や力場計算を基に材料の様々な物性を算出することが できる材料設計支援統合システムです。 『MedeA-VASP』には、van der Waals相互作用を評価できる手法が搭載されており、 分子結晶への適用が可能。 当資料では、『MedeA-VASP』を用いたグリシン結晶の計算事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■密度汎関数法とvdW相互作用 ■分子結晶へのバンド計算の適用 ■適用事例:グリシン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他情報システム

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【技術情報】AMS 2021リリース

PESの自動探索機能の他、AMSの各計算エンジンなどについてご紹介!

『AMS』は、量子化学計算プログラムのADFをはじめとする計算化学統合 パッケージです。 AMSの新バージョン2021では、各計算エンジンに対して構造最適化やMDなどを 統一的に行うためのツール“AMS driver”に新たに反応経路自動探索機能が 追加されました。 当資料では、今回追加されたPESの自動探索機能の他、AMSの各計算エンジン (ADF・BAND・DFTB・ReaxFF・COSMO-RS)、その他ツールの主な新機能に ついて紹介しています。 【掲載内容】 ■AMS driverによる反応経路の自動探索 ■AMSの各計算エンジン・ツールの主な新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他情報システム
  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)

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【新製品情報】Molpro用GUI『gmolpro』

4つのウィンドウから構成!Expertモードによる入力ファイルの直接編集も可能!

「Molpro」は、配置問相互作用法、クラスタ展開法、多配置SCF法、 多配置参照摂動法など、電子相関の取り扱いに関する様々な計算機能を 搭載した量子化学計算ソフトウェアです。 当資料では、「Molpro」のグラフィカルユーザーインターフェース(GUI) 『gmolpro』についてご紹介しています。 是非、ダウンロードしてご覧ください。 【掲載内容】 ■gmolpro の構成と機能 ■稼働プラットフォーム ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他

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【新製品情報】材料設計支援プラットフォーム SciMAPS4.4

ゼロせん断粘度を推算!表示に関する機能が向上し、大きな系についても高速な表示が可能

「SciMAPS」は、外部プログラムとの連携を前提とした、拡張性の高い 設計思想を持つ材料設計支援プラットフォームです。 「SciMAPS」には、Quantum、Classical、Engineeringの3つのパッケージがあり、 目的に応じて導入。各パッケージにはその分野で定評のある計算プログラムが 利用できますので、研究目的に合わせて使い分けることが可能です。 当資料では、1月にリリースされました『SciMAPS 4.4』の新機能について ご紹介しています。 【掲載内容】 ■Cassandra ■Mesophase DPD Builder ■新しい物性推算機能とチュートリアル ■その他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他
  • 開発支援ツール(ICE・エミュレータ・デバッガ等)

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【新製品情報】計算化学統合パッケージ『AMS 2020』

複数種を取り込んだ計算に対応!新モジュールや各計算エンジンの主な新機能についてご紹介

「AMS」は、量子化学計算プログラムのADFをはじめとする計算化学統合 パッケージです。 昨年末にリリースされた新バージョン『AMS 2020』では、マルチレイヤーでの QM/MM計算を可能にする新しい計算エンジン"Hybrid "が搭載されました。 「AMS」パッケージ内の任意のQMエンジン、MMエンジンを組み合わせた計算が 可能で、分子系だけでなく、周期系(1~3次元)の取り扱いにも対応。 当資料では、これら新モジュールの他、AMSの各計算エンジン(ADF・BAND・ DFTB・ReaxFF・COSMO-RS)の主な新機能についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■新しい計算エンジンHybrid ■新製品ML Potential ■AMS の各計算エンジンの主な新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他
  • その他ネットワークツール

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【技術情報】MedeA-VASP:生成エネルギー自動計算機能

格子振動に起因するエントロピーの値の算出が可能!生成エネルギー自動計算機能について解説

「MedeA」は、第一原理計算や力場計算を基に材料の様々な物性を 算出することができます。 当資料では、新しいバージョン『MedeA 3.2』で「MedeA-VASP」 インターフェースに搭載された生成エネルギー自動計算機能について 解説しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■MedeA-VASPと生成エネルギー自動計算機能 ■生成エネルギーと標準生成エンタルピーの比較 ■格子振動効果の考慮 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他

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【製品紹介】CBIS: 電子実験ノート モジュール

実験データを管理・共有、実験資材情報や参考文献との連携で研究開発を効率化。化学合成用と汎用の2種類の電子実験ノートを用意。

ChemInnovation Software社製『Chemical and Biological Information System(CBIS)』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、 文献やレポートといった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 当資料では、CBISの電子実験ノート モジュールについてご紹介しています。 【掲載内容】 ■電子実験ノートのメリット ■CBISの電子実験ノートの機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他
  • その他運用管理ソフト

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【製品紹介】Version 6.5および6.6の新機能

研究開発における知識の共有を促進!より簡単にデータの管理を行えるようになりました

Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理など、 研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合プラットフォームを 提供しています。 電子実験ノート「ELN」、分子情報・アッセイデータ登録システム「RegMol」、 在庫管理システム「Inventory」の各製品では低分子化合物から核酸・ ペプチド・タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、 多様なモダリティのデータを一元的に取り扱えます。 当資料では、version 6.5およびversion 6.6で実装された新機能について ご紹介しています。 【掲載内容(抜粋)】 ■Scilligence社製統合プラットフォームの特長 ■プロジェクトメンバーの追加 ■一括編集機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他

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【技術情報】空間的遺伝子発現データ解析

同時に複数のデータを解析することが可能!4週間無償トライアルにてご評価いただけます

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインター フェース(GUI)上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで 幅広くご利用いただけます。 当資料では、「Single Cell RNAseqtoolkit」を用いた組織切片の空間的遺伝子 発現データ解析についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■空間的遺伝子発現解析とは ■組織切片の画像データの取得 ■遺伝子発現データと組織切片画像の重ね合わせ ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他
  • その他解析

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【技術情報】膨大なケミカルスペースに対する超高速類似構造探索

創薬の高速化と低コスト化を実現する上で強力なツール!原理と適用事例についてご紹介

薬物様化合物のケミカルスペースは10^60構造存在するとも言われ、 従来のプログラムでは有効な時間内で検索することは不可能です。 BioSolveIT社『infiniSee』は、数百億を超える実際に合成可能かつ 購入可能な化合物ライブラリーから、ターゲット分子と化学的特長類似 化合物を高速に検索することができます。 当資料では、薬剤耐性菌が生産する「CTX-M β-lactamase」に対する 合成可能なリガンド類似化合物の検索を例に、『infiniSee』の原理と 適用事例についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■CTX-M β-lactamase 複合体の三次元構造 ■母核置換 ■infiniSee による合成可能な化合物ライブラリーの類似構造検索 ■SeeSAR によるドッキングとHYDE スコアリング ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • 開発支援ツール(ICE・エミュレータ・デバッガ等)
  • その他

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【技術情報】MOE:SVL Exchange:AutoPH4

リガンド結合部位から自動的にファーマコフォアモデルを作成するアドオンプログラム

『SVL Exchange』は、統合計算化学システム「MOE」のアドオンプログラムを 共有するためのウェブサイトです。 300以上のアドオンプログラムが公開されており、それらは簡単に「MOE」に インストールして使用できます。 当資料では、『SVL Exchange』で公開されている「AutoPH4」や、当社開発の アドオンプログラムをご紹介しています。 【掲載内容】 ■MOEの開発言語SVL ■AutoPH4 ■当社開発のアドオンプログラム ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】MedeAによる第一原理計算とVASP 6.1

自動でパラメーターを調整!核となる第一原理計算プログラムは「VASP」を採用!

『MedeA』は、原子スケールのシミュレーション技術を基に、物性評価を 行うための統合支援環境です。 最新版では、VASPのバージョン6.1が組み込まれており、精度向上とともに 高速化が図られています。 当資料では、MedeAによる第一原理計算とVASP 6.1について詳しくご紹介 しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■第一原理計算とは ■マテリアルズインフォマティクス ■MedeA-VASP 6.1 新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】Single Cell RNA-seq データの収載

細胞集団の不均一性の解析や細胞系譜を推測する研究などに使用!解析事例についてご紹介

「GENEVESTIGATOR」は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載しているため、 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する 遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に 行うことができます。 当資料では、2020年の10月に追加された、Single Cell RNA-seqキュレーション データを使用した解析事例について紹介しています。 【掲載内容】 ■はじめに ■特定の遺伝子が発現する細胞種の解析 ■COVID-19 患者と健常者の発現遺伝子比較 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】Direct Force Field 7.2

新たに2つの目的に対する力場が追加!5つの系統の陽イオンと12種類の陰イオンに対応!

「Direct Force Field」は、力場作成とAeon社の開発した力場を利用するための ソフトウェアです。 力場を作成するために必要な機能を簡単な手順で利用できるようになっており、 開発された力場を管理するデータベースが搭載されています。 当資料では、2020年12月にリリースされた新バージョン『Direct Force Field 7.2』 についてご紹介しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■Direct Force Field 概要 ■新機能の紹介 ■参照文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)

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【新製品情報】CDD Vault 新機能紹介 (2021.01)

導入実績多数のクラウド型研究データ管理システム!サンプルのバッチ同士の関連付けや、APIの機能強化など新機能についてご紹介

『CDD Vault』 は、化合物・抗体・細胞などのサンプルの情報とアッセイ情報の管理・共有機能と、電子実験ノート機能を有するクラウドサービスです。 システム導入や管理に手間をかけることなく、創薬研究データの管理システムをすぐに利用できるため、製薬企業やベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を進めるためのプラットフォームとして多数の実績があります。 当資料では、2020年7月以降に実装された新機能についてご紹介しています。是非、ご一読ください。 【主な新機能】 ■低分子化合物以外のサンプル向けの機能変更 ■サンプルのバッチ同士の関連付け ■サンプルから参照元への逆リンク ■ELNエントリーの一括出力 ■APIの機能強化 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他情報システム

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【新製品情報】PSILO 2020 リリース情報

操作性や使いやすさが以前のバージョンと比較して格段に向上!新機能や機能強化をご紹介

当資料では、タンパク質立体構造データベースシステム『PSILO 2020』の 主な新機能や機能強化をご紹介しています。 ウェブベースのインターフェースのさまざまな機能がJavaScriptで 実装されており、操作性や使いやすさが以前のバージョンと比較して 格段に向上しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■構造ビューアー ■検索 ■構造重ね合わせ ■タンパク質ファミリーデータベース ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • データベース

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【新製品情報】MOE 2020.09 の新機能

MDシミュレーションのインターフェースが一新!メニューバーもさまざまな言語に変更可能!

当資料では、統合計算化学システム『MOE 2020.09』の主な新機能や機能強化を ご紹介しています。 日本語をはじめとする多言語がサポートされるようになり、大規模計算のための フレームワークなどが新機能として追加。 また、ドッキング、タンパク質の物性推算、抗体モデリング、MOEsaicの機能も 強化され、プロジェクトデータベースも更新されました。 【掲載内容】 ■日本語などの多言語のサポート ■ONIOM法によるQM/MM計算 ■MDシミュレーションインターフェースの  機能拡張と再生プレイヤーの追加 ■HPCフレームワークの強化 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他

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創薬モダリティの多様性に対応したソフトウェア《動画&資料 提供》

創薬モダリティに興味のある方必見! 3つのライフサイエンスソフトウェアを紹介!

《情報計算化学生物学会 2020 年大会で開催したモルシス企業セミナーの動画のリンクと資料をご提供します。》 創薬モダリティの多様化に伴い、創薬研究支援ソフトウェアにはモダリティに対応した機能が求められています。弊社取り扱い製品の中から「統合計算化学システム MOE」、「研究情報管理統合プラットフォーム Scilligence」、「医薬品安全性情報ポータル OFF-X」の3製品について創薬モダリティ関連の機能を紹介します。 ・MOE 低分子、ペプチド、タンパク質、抗体、核酸のデザインとシミュレーションに対応した統合計算化学プラットフォーム ・Scilligence 多様な創薬モダリティの研究データに対応した研究情報管理統合プラットフォーム ・OFF-X 規制機関、学術論文、学術会議、企業等の情報源から収集された前臨床試験の毒性情報と臨床試験および市販後の安全性情報を統合し、解析機能と組み合わせて情報提供する医薬品の安全性情報ポータル ※詳しくはPDFダウンロード、またはお問い合わせください。

  • タンパク質構造表示ソフトウェア
  • 計算化学
  • ファイル管理

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高速量子化学計算ソフトウェア BIOVIA TURBOMOLE

NMRスピン-スピン結合定数の計算やPBC計算におけるハイブリッド汎関数への対応などを掲載!

高速量子化学計算ソフトウェア『BIOVIA TURBOMOLE』の新バージョン7.5と グラフィカルユーザーインターフェース(GUI)TmoleX 4.6が リリースされました。 当資料では、新バージョンに搭載された新機能や改善された機能について 紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■バージョンアップのトピックス ■NMRスピン-スピン結合定数の計算 ■PBC計算におけるハイブリッド汎関数への対応 ■Damped response法による吸収スペクトル、および周波数依存分極率計算 ■光学スペクトル情報に基づく色予測ツール ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)

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Scilligence version 6.3.1 新機能紹介

電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理など研究情報を一元管理可能!

当資料では、Scilligence version 6.3.1で実装された新機能について ご紹介します。 Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や 在庫管理など研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合 プラットフォームを提供。 電子実験ノートELN、分子情報・アッセイデータ登録システムRegMol、 在庫管理システムInventoryの各製品では低分子化合物から核酸・ペプチド・ タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、 多様なモダリティのデータを一元的に取り扱えます。 【掲載内容】 ■Scilligence 統合プラットフォームの特長 ■プロジェクトメンバーの追加 ■ノートページのお気に入り機能 ■SciFinder、Reaxysとの連携 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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【技術情報】データ解析ソフトウェア Partek Flow

データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご利用可能!

『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-Seqや DNA-Seq、ChIP-Seq、Single Cell RNA-Seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 また、搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザー インターフェース上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 当資料では、k-meansクラスタリングによる細胞の分類やマーカー遺伝子の 表示、UMAPによる次元削減、遺伝子リストの作成など、Single Cell RNA-seqデータ解析に有用な機能について紹介します。 【掲載内容】 ■クラスタリング ■次元削減による可視化 ■発現変動遺伝子リスト ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他解析

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【技術情報】遺伝子発現データベース GENEVESTIGATOR

使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載!実験条件の検索例についてご紹介

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。 当資料では、遺伝子発現変動データの検索や、タンパク質ACE受容体の 発現レベルが高い実験条件の検索例についてご紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【特長】 ■コロナウイルス関連データの収載 ■SARS-CoV-2 感染による発現遺伝子 ■ACE2 受容体発現と実験条件 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • データベース

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【セミナー情報】MOEフォーラム2020 開催報告

統合計算化学システム!5名の先生方にMOEを活用した研究事例についてご講演いただきました

当資料では、日英同時通訳付きウェビナーとして開催した 「MOEフォーラム2020」の招待講演と開発元の講演を紹介します。 生命科学、創薬研究の分野の先端で活躍されている5名の先生方に MOEを活用した研究事例についてご講演いただきました。 また、開発元のCCG社からは、対話的なSAR解析が行える MOEウェブアプリケーションのMOEsaicの機能強化、タンパク質の 開発可能性や化学修飾部位予測にかかわる物性推算機能の応用事例、 次バージョンのMOEやPSILOの機能について発表しました。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■招待講演 ■Chemical Computing Group社講演 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他情報システム

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【技術情報】材料設計支援統合システム MedeA

MedeA-Deformation:分子動力学計算による塑性変形の取り扱いについて掲載!

『MedeA』は、第一原理計算や力場計算を基に材料の様々な物性を 算出することができる材料設計支援統合システムです。 当資料では、塑性領域における物性予測のため、応力ひずみ曲線を 算出するツール「MedeA-Deformation」について、カーボンナノチューブへの 適用事例を交えてご紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■MedeA-Deformation ■CNTの引張変形 ■弾性領域の取り扱い ■まとめ ■謝辞 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】CBIS: 研究資材と在庫の管理

柔軟なカスタマイズ性と優れたコストパフォーマンス!CBISの研究資材・在庫管理機能をご紹介

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献や レポートといった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 当資料では、化合物・試薬や細胞株などの研究資材とその在庫情報を 当製品で管理するメリットについてご紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■研究資材の在庫管理の重要性 ■CBISによる研究資材の在庫管理 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】創薬支援ツールを用いたKNIME用ワークフロー

ノードを用いて作成されたリガンド設計に関する4種類のKNIME用ワークフローをご紹介!

『KNIME』は、データ分析やレポート作成を行うためのオープンソースの 統合プラットフォームです。 BioSolveIT社は、創薬支援ツールを当製品上で実行するためのノード群を 無償で提供。 当資料では、それらのノードを用いて作成されたリガンド設計に関する 4種類の当製品用ワークフローを紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■KNIME インターフェース ■BioSphere ワークフロー ■MedChemWizard ワークフロー ■FragXplorer ワークフロー ■REALizer ワークフロー ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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【技術資料】材料設計支援システム『SciMAPS』

三つの構造構築機能を工夫して利用することで、複雑な系を構築する二つの例をご紹介

分子シミュレーションを成功裏に行うには研究対象となる分子系の モデル化の成否が重要です。 当システムの構造構築機能は、高分子鎖、結晶構造、表面構造などを 作成する「基本構造構築機能」、アモルファス構造や界面構造の 基本構造を複数組み合わせた構造を作成する「複合構造構築機能」、 架橋構造やカーボンナノチューブを構築する「特定構造構築機能」 の三つからなります。 これらの機能を組み合わせることによって、研究対象にマッチした 分子モデルを構築。 当資料ではこれらの機能を工夫して利用することで、より複雑な系を 構築する二つの例を紹介します。 【掲載内容】 ■架橋分子膜-水の界面構造の構築 ■内包ナノチューブの構造構築 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他運用管理ソフト
  • 開発支援ツール(ICE・エミュレータ・デバッガ等)

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【製品紹介】TouchMol4Officeの機能

研究情報管理統合プラットフォーム「Scilligence」と連携で効率的な研究が可能!

米国Scilligence 社製『TouchMol4Office』は、Microsoft Office への プラグインです。 Microsoft Officeの各ソフトウェア内で化学的・生物学的機能を用いて 構造情報を含む研究データを整理することができ、研究データの解析や レポート作成を容易に行えます。 また、Scilligence ELN(電子実験ノート)などと連携して利用すること により研究を効率的に行えます。 当資料では、当製品の概要と機能についてご紹介します。 【掲載内容】 ■概要 ■機能 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • 文書・データ管理
  • その他解析
  • その他運用管理ソフト

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【製品紹介】遺伝子発現データベース GENEVESTIGATOR

データのキュレーションや製品概要、「Dimension Reduction Tool」についてご紹介!

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析が可能。 また、当ツールは使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを 搭載しているため、研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を 行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを 簡単かつ正確に行うことができます。 当資料ではデータのキュレーションや製品概要、また新しく追加された 「DimensionReduction Tool」について紹介します。 【掲載内容】 ■遺伝子発現データのキュレーション ■GENEVESTIGATOR の製品概要 ■Dimension Reduction Tool ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術資料】MOE のHLA 解析アプリケーションの紹介

統合計算化学システム「HLA-Modeler」「HLABAP」の概要と特長および解析例をご紹介

ヒト白血球型抗原(HLA)の立体構造は細胞性免疫の分子機構を解明する ために重要な分子です。 当社では、MOE上で動作するHLAに特化したホモロジーモデリングツール 「HLA-Modeler」とHLA 結合抗原性ペプチド予測ツール「HLABAP」を 開発しました。 「HLA-Modeler」は、構造未知のHLA の立体構造を既知のHLAの構造を参照し 予測。「HLABAP」はHLA に結合する任意のペプチドの結合強度を予測し、 親和性の高いペプチド配列を提案します。 当資料では、これらのツールの概要と特長および解析例について説明します。 【掲載内容】 ■HLA-Modeler の概要 ■HLA-Modeler の特長 ■HLABAP の概要 ■HLABAP の特長 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他運用管理ソフト
  • その他ネットワークツール

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理論計算でビッカース硬さを推算する方法/事例/ソフトウェア

機械物性をシミュレーションするためのソフトウェア / 第一原理計算 MedeA-VASP / マテリアルズインフォマティクス

【技術資料】 材料設計支援統合システム『MedeA』は、原子スケールのシミュレーション技術により機械物性を推算することができるソフトウェアです。当ソフトウェアで推算可能な物性にビッカース硬さが新たに加わりました。材料の組成(およびその結晶構造)の情報のみを元にしてビッカース硬さを精度良く推算することができます。 当資料では、第一原理計算によってビッカース硬さを推算する方法とその適用事例を紹介します。さらなる展開として、マテリアルズインフォマティクスへの展開やそのための支援機能もあわせて紹介します。 【掲載内容(抜粋)】 ■材料設計支援統合システム【MedeA』 ■第一原理計算プログラム『VASP』 ■ビッカース硬さ / 弾性定数 / 機械物性 ■計算手法 ■計算結果 ■マテリアルズインフォマティクスへの展開 ■ハイスループット機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新機能紹介】創薬研究情報共有クラウドシステム CDDVault

創薬研究データの管理システムをすぐに利用可能!2019年12月以降に実装された新機能をご紹介

『CDD Vault』は、米国Collaborative Drug Discovery 社(CDD社)により 開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。 優れた可視化機能を持ち、システム導入や管理に手間をかけることなく、 創薬研究データの管理システムをすぐに利用できるため、製薬企業や ベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を進めるための プラットフォームとして多数の実績があります。 当資料では、2019年12月以降に実装された新機能について紹介します。 【掲載内容】 ■CDD Vault とは ■ELN の反応式での塩の取り扱い ■検索結果のURL による共有 ■COVID-19 関連の公開データセットの追加 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】SeeSAR 10 リリース

概要をはじめ、分子表面のクリッピング機能などを掲載!創薬支援ツールのご紹介資料です

独BioSolveIT社から、SBDD統合ツールの新版『SeeSAR 10』がリリースされました。 従来の操作性はそのままで、より直感的に使用できるようにGUIを再設計。 その他の新機能として、タンパク質の構造改変を行うProtein Editor モード、 結合部位の形状や深さの視覚化を支援する分子表面のクリッピング機能、 SMARTS表現を用いたファーマコフォア拘束、フラグメント伸長のための フラグメントライブラリーの選択機能が追加されました。 当資料では、当製品の概要を紹介します。 【掲載内容】 ■SeeSAR 10 の概要 ■GUI の刷新 ■Protein Editor モード ■分子表面のクリッピング機能 ■SMARTS 表現を用いたファーマコフォア拘束 ■フラグメント伸長のためのフラグメントライブラリーの選択 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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MOE抗体設計アプリケーション

コンピューターで抗体モデリング・抗体設計を行うための有用なアプリケーションを搭載

近年、抗体医薬品開発を効率化するためにインシリコによる合理的な設計が益々重要となっています。 統合計算化学システム MOEは、低分子、ペプチド、抗体、核酸などの広範なスケールの分子の設計に活用でき、創薬モダリティー開発に対応した分子モデリングソフトウェアです。ホモロジーモデリング、タンパク質デザイン、バーチャルファージディスプレイ、エピトープマッピング、分子表面解析、物性推算、化学的修飾候補部位の検出など抗体設計に活用できるアプリケーションがMOEには統合されています。 Fv、Fab、F(ab’)、rIgGなどの各領域、抗体の全長構造、二重特異性抗体(bispecific抗体)、一本鎖抗体(scFv)、ADC(Antibody-drug conjugate)、VHH/VLL抗体など様々な抗体構造のモデリングと設計をMOEはカバーします。構築した抗体と抗原の分子間相互作用解析、Developability(開発可能性)の評価などが可能です。 MOEは、計算化学者から実験研究者まで幅広く利用されています。 無料アプリケーション紹介セミナーも開催中(お問い合わせください)

  • タンパク質解析ソフトウェア

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【技術資料】レシピ管理機能による配合研究データの管理

配合研究における情報管理や研究情報共有システム導入メリットについてをご紹介!

ChemInnovationSoftware社製の、Chemical and Biological Information System は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポートといった 文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できるwebシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れたコスト パフォーマンスで高い評価をいただいております。 当資料では、複数の原料を組み合わせて目的の性質の複合材料や混合物質を 設計する配合研究で用いられるレシピ管理機能を紹介いたします。 【掲載内容】 ■配合研究における情報管理 ■研究情報共有システム導入メリット ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術資料】熱活性化遅延蛍光材料の励起状態計算

熱活性化遅延蛍光(TADF)材料の計算結果を詳しくご紹介しております

量子化学計算ソフトウェアADFの『遅延蛍光材料の励起状態計算』 について当資料では詳しく解説しております。 有機ELに用いられるメタルフリーな発光材料として近年注目を 集めている、熱活性化遅延蛍光(TADF)材料の計算結果を詳しくご紹介。 「スピン軌道相互作用の行列要素の計算」や「Franck-Condonの重み付き 状態密度の計算」などを掲載しております。 【掲載内容】 ■はじめに ■逆項間交差(RISC)の速度定数の評価 ・スピン軌道相互作用の行列要素の計算 ・Franck-Condonの重み付き状態密度の計算 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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