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米国Scilligence 社製『TouchMol4Office』は、Microsoft Office への プラグインです。 Microsoft Officeの各ソフトウェア内で化学的・生物学的機能を用いて 構造情報を含む研究データを整理することができ、研究データの解析や レポート作成を容易に行えます。 また、Scilligence ELN（電子実験ノート）などと連携して利用すること により研究を効率的に行えます。 当資料では、当製品の概要と機能についてご紹介します。 【掲載内容】 ■概要 ■機能 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ヒト白血球型抗原（HLA）の立体構造は細胞性免疫の分子機構を解明する ために重要な分子です。 当社では、MOE上で動作するHLAに特化したホモロジーモデリングツール 「HLA-Modeler」とHLA 結合抗原性ペプチド予測ツール「HLABAP」を 開発しました。 「HLA-Modeler」は、構造未知のHLA の立体構造を既知のHLAの構造を参照し 予測。「HLABAP」はHLA に結合する任意のペプチドの結合強度を予測し、 親和性の高いペプチド配列を提案します。 当資料では、これらのツールの概要と特長および解析例について説明します。 【掲載内容】 ■HLA-Modeler の概要 ■HLA-Modeler の特長 ■HLABAP の概要 ■HLABAP の特長 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
【技術資料】 材料設計支援統合システム『MedeA』は、原子スケールのシミュレーション技術により機械物性を推算することができるソフトウェアです。当ソフトウェアで推算可能な物性にビッカース硬さが新たに加わりました。材料の組成（およびその結晶構造）の情報のみを元にしてビッカース硬さを精度良く推算することができます。 当資料では、第一原理計算によってビッカース硬さを推算する方法とその適用事例を紹介します。さらなる展開として、マテリアルズインフォマティクスへの展開やそのための支援機能もあわせて紹介します。 【掲載内容（抜粋）】 ■材料設計支援統合システム【MedeA』 ■第一原理計算プログラム『VASP』 ■ビッカース硬さ / 弾性定数 / 機械物性 ■計算手法 ■計算結果 ■マテリアルズインフォマティクスへの展開 ■ハイスループット機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CDD Vault』は、米国Collaborative Drug Discovery 社（CDD社）により 開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。 優れた可視化機能を持ち、システム導入や管理に手間をかけることなく、 創薬研究データの管理システムをすぐに利用できるため、製薬企業や ベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を進めるための プラットフォームとして多数の実績があります。 当資料では、2019年12月以降に実装された新機能について紹介します。 【掲載内容】 ■CDD Vault とは ■ELN の反応式での塩の取り扱い ■検索結果のURL による共有 ■COVID-19 関連の公開データセットの追加 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独BioSolveIT社から、SBDD統合ツールの新版『SeeSAR 10』がリリースされました。 従来の操作性はそのままで、より直感的に使用できるようにGUIを再設計。 その他の新機能として、タンパク質の構造改変を行うProtein Editor モード、 結合部位の形状や深さの視覚化を支援する分子表面のクリッピング機能、 SMARTS表現を用いたファーマコフォア拘束、フラグメント伸長のための フラグメントライブラリーの選択機能が追加されました。 当資料では、当製品の概要を紹介します。 【掲載内容】 ■SeeSAR 10 の概要 ■GUI の刷新 ■Protein Editor モード ■分子表面のクリッピング機能 ■SMARTS 表現を用いたファーマコフォア拘束 ■フラグメント伸長のためのフラグメントライブラリーの選択 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
近年、抗体医薬品開発を効率化するためにインシリコによる合理的な設計が益々重要となっています。 統合計算化学システム MOEは、低分子、ペプチド、抗体、核酸などの広範なスケールの分子の設計に活用でき、創薬モダリティー開発に対応した分子モデリングソフトウェアです。ホモロジーモデリング、タンパク質デザイン、バーチャルファージディスプレイ、エピトープマッピング、分子表面解析、物性推算、化学的修飾候補部位の検出など抗体設計に活用できるアプリケーションがMOEには統合されています。 Fv、Fab、F(ab’)、rIgGなどの各領域、抗体の全長構造、二重特異性抗体(bispecific抗体)、一本鎖抗体(scFv)、ADC(Antibody-drug conjugate)、VHH/VLL抗体など様々な抗体構造のモデリングと設計をMOEはカバーします。構築した抗体と抗原の分子間相互作用解析、Developability（開発可能性）の評価などが可能です。 MOEは、計算化学者から実験研究者まで幅広く利用されています。 無料アプリケーション紹介セミナーも開催中（お問い合わせください）
ChemInnovationSoftware社製の、Chemical and Biological Information System は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポートといった 文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できるwebシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れたコスト パフォーマンスで高い評価をいただいております。 当資料では、複数の原料を組み合わせて目的の性質の複合材料や混合物質を 設計する配合研究で用いられるレシピ管理機能を紹介いたします。 【掲載内容】 ■配合研究における情報管理 ■研究情報共有システム導入メリット ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
量子化学計算ソフトウェアADFの『遅延蛍光材料の励起状態計算』 について当資料では詳しく解説しております。 有機ELに用いられるメタルフリーな発光材料として近年注目を 集めている、熱活性化遅延蛍光(TADF)材料の計算結果を詳しくご紹介。 「スピン軌道相互作用の行列要素の計算」や「Franck-Condonの重み付き 状態密度の計算」などを掲載しております。 【掲載内容】 ■はじめに ■逆項間交差(RISC)の速度定数の評価 ・スピン軌道相互作用の行列要素の計算 ・Franck-Condonの重み付き状態密度の計算 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
トランスレーショナルリサーチでは、前臨床研究の成果を臨床研究に 効率的に橋渡しすることと同時に、市販後の安全性の監視で得られた 情報を新たな治療薬の開発にフィードバックすることが求められます。 当資料では、医薬品開発に携わる研究者やさまざまな部門において、 それぞれの目的に応じてご活用いただける趣旨を掲載しております。 【掲載内容】 ■生物学研究者および情報生物学研究者 ■メディシナルケミストおよび情報化学研究者 ■毒性学・安全性薬理学研究者 ■臨床開発研究者 ■レギュラトリーサイエンス ■ファーマコビジランス ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独 BioSolveIT社製ドッキングツールFlexXがバージョンアップし、 FlexX 4としてリリースされました。 FlexX 4では今までのバージョンから完全にコードを書き直し、効率的な 並列処理が可能になりました。 SBDD統合ツールSeeSARとの統合版とコマンドライン版の2種類が利用可能。 当資料ではFlexX4の新機能およびSeeSARとの統合版とコマンドライン版 について説明します。 【掲載内容】 ■FlexX4の概要 ■FlexX4の新機能 ■SeeSAR統合版FlexX4 ■コマンドライン版FlexX4 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Aeon Technology 社は高精度分子シミュレーション支援ソフトウェア 「Direct Force Field」を通じ、力場データベースから力場開発ツールまで 力場計算に関するさまざまなツールを提供しています。 当資料では、Direct Force Field (DFF) の力場パラメーターアサインから 分子動力学計算までの力場計算機能についてご紹介いたします。 【掲載内容】 ■はじめに ■分子構造の作成 ■形式電荷のアサイン ■モデル分子へのパラメーターアサイン ■分子動力学計算用入力ファイルの生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MedeA のメジャーバージョンアップは、2.0 がリリースされて以来、 実に15年ぶりとなります。 今回のバージョンアップではソフトウェア全体のコードが見直され、 現在の使用環境に適した改善が数多く実施されております。 バージョン 3.0 においてMedeA は、さらに使いやすい環境へと進化しました。 【特長】 ■VASP 5.4.4をサポート ■アイコンの図柄やウィンドウの色等を含めユーザーインターフェースが刷新 ■ソースコードの見直しを行ったことでモデル構造の表示機能が大幅改善 ■新しいモジュールとしてMedeA-QT、MedeA-HT-Descriptors がリリース ■ReaxFFポテンシャルがサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOEsaic』は、構造活性相関/構造物性相関解析を行うための MOE/web アプリケーションです。 Matched Molecular Pairs解析やR-group解析等の合成研究者に使用頻度の 高い機能を統合しており、母核・置換基と活性・物性の関係を分かり やすくまとめ、ウェブブラウザー上に可視化。 当資料では、MOEsaicに搭載されているMMP解析機能とカスタムプロパティー モデルBOILED-Egg の導入事例をご紹介いたします。 【掲載内容】 ■MOE/web ■MOEsaic概要 ■MMP Profileによるマジックメチル効果の探索 ■Interesting MMPによるActivity Cliffの探索 ■カスタムプロパティーモデル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や 在庫管理など研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合 プラットフォームを提供しています。 電子実験ノートELN、分子情報・アッセイデータ登録システムRegMol、 在庫管理システムInventoryの各製品では低分子化合物から核酸・ペプチド・ タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、多様な モダリティのデータを一元的に取り扱えます。 当資料では、ELN、RegMol、Inventoryに共通する創薬研究における モダリティの多様性への対応機能を紹介いたします。 【掲載内容】 ■製品概要 ■生体高分子に対応した描画ツール ■生体高分子の管理 ■ADCの管理 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Scilligence社は、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理 など研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合プラット フォームを提供しています。 低分子化合物からペプチドや核酸などの中分子、抗体や抗体薬物複合体 などの高分子までの情報を単一のプラットフォームで管理でき、 低分子医薬品から生物学的製剤まで幅広いモダリティに活用可能。 当資料では、プラットフォームを構成する各製品の概要と機能について ご紹介します。 ■Scilligence ELN ■RegMol ■Scilligence Inventory ■Scilligence SDMS ■Scilligence PMF ■共通のツール ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬 PROTACの開発を 支援するためのMOEのカスタムアプリケーションです。 4通りの手法によりPROTACを介した三元複合体構造の予測とモデリングを容易 に行え、タンパク質間の接触を表すスコアにより適切なモデルを選別可能。 当資料では、三元複合体のモデリング手法の概要とその適用事例について ご紹介します。 【掲載概要】 ■PROTAC 概要 ■PROTAC Modeling Tools2）概要 ■三元複合体の各モデリング手法 ■三元複合体モデルのスコアリング ■適用事例 ■アプリケーションの入手方法 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、『MedeA Deposition』の力場計算によるシミュレーションを ご紹介します。 『MedeA Deposition』は固体表面への原子・分子の堆積、吸着といった 現象を力場計算によってシミュレートするためのツールです。 工業的に重要なさまざまなプロセスに関する知見を得るための有益な手段 となります。 【掲載概要】 ■概要 ■機能 ■適用範囲 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CDD Vault』は米国Collaborative Drug Discovery社により開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。 システム導入や管理に手間をかけずに、創薬研究データの管理システムをすぐに利用できるため、優れた可視化機能を持ち、製薬企業やベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を進めるためのプラットフォームとして多数の実績があります。 当資料では、2019年中にELN モジュール(電子実験ノート)に実装された新機能についてご紹介します。 【掲載概要】 ■CDD Vault とは ■エントリーのウィットネスの要求 ■化学量論表に関する機能 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬（PROTAC）の 開発を支援するためのMOEのカスタムアプリケーションです。 三元複合体（標的タンパク質-PROTAC-E3リガーゼ）の構造の予測と モデリングを容易に行えます。 タンパク質間の衝突や接触を表すスコアにより適切なモデルを選別できます。 当製品は保守契約中であれば無償で入手でき、また、アプリケーションの 使用にトークンを追加する必要はありません。 【特長】 ■PROTAC開発用アプリケーション ■三元複合体構造の予測とモデリングを容易に行える ■タンパク質間の衝突や接触を表すスコアにより適切なモデルを選別できる ■アプリケーションの使用にトークンを追加する必要がない ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOE-Extensions for KNIME』は、MOEをワークフローツール 「KNIME」上で使用するためのインターフェイスです。 当製品を利用することで、化合物や受容体構造の前処理、 ドッキング、FBDD、ファーマコフォア検索などのMOEによる 連続的な処理を容易に定義できます。 【特長】 ■誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 ■プログラミング不要で作業を自動化 ■処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 ■創薬研究のための多数のノードを提供 ■KNIMEの他ノードとの連携が容易（機械学習等） ■ユーザーオリジナルノードの作成が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『REAL Space Navigator』は、Enamine社における110億構造におよぶ バーチャル化合物群の中からクエリー化合物に類似の構造を 高速に探索するツールです。 ヒットした構造は同社により実際に合成できる可能性が高く、ユーザーは スキャフォールドホッピングされた新規化合物をオンデマンドに入手可能。 当製品による検索は、BioSolveIT社のFTrees-FSの類似構造構築手法に 基づいて行われます。 【特長】 ■110億通りのバーチャル化合物の中から、まだ発見されていない 新規リガンド候補を超高速に探索 ■クエリー化合物が持つ化学的な特長とその2次元的な位置が類似する 構造を簡単かつ効率的に得ることができる ■ヒット構造をEnamine社に合成依頼が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 （水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。 得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。 【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成 ■相互作用しているアミノ酸の種類や原子などを分かりやすく2次元で表示 ■操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ ■作成された図は、Protein Data Bankの公式の相互作用図として採用されている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『infiniSee』は、既存の化合物ライブラリーあるいは、10^20個を超える バーチャル化合物群の中より類似構造を高速に探索するソフトウェアです。 新規構造、SAR展開、特許を回避した構造など、目的に応じた候補構造を 簡単な操作で発見できます。 創薬における加速化と低コスト化を実現します。 【特長】 ■超高速ケミカルスペースナビゲーション 分単位で10^20構造を探索 ■容易なスキャフォールドホッピング FTreesFSアルゴリズムを用いた構造構築 ■構造類似性の可視化 分かりやすい表示による候補構造の決定 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『FlexX』は、タンパク質のリガンド結合部位に、医薬候補化合物を フラグメント単位で配置することで高速に化合物のドッキング構造を 予測するプログラムです。 結合部位に化合物群を順次配置しリガンド候補を絞り込むバーチャル スクリーニングや、リガンド-受容体間の相互作用解析に利用できます。 【特長】 ■多様な分子系に対応 ■高速ドッキング ■ファーマコフォアフィルター ■SeeSARとの連携 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CoLibri』は、反応式をもとにフラグメントライブラリーと バーチャルライブラリーを作成するツールです。 ライブラリーは化学反応式に基づいて作成されるため、 より現実的なバーチャル化合物を得ることが可能。 サードパーティとの連携に優れた、BioSolveIT社のソフトウェアです。 【特長】 ■化学反応に基づき試薬構造の一部を反応点で置き換えたフラグメント ライブラリーとフラグメント同士をつなげるルールの情報を出力 ■もとになる化合物は、試薬ベンダーから提供される試薬データベースを 用いることができる ■試薬データベース内で指定した化学反応に適合する化合物が自動的に選択 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
材料設計支援プラットフォーム『SciMAPS』の各計算プログラムは、 計算プログラム本体とそれに対するインターフェースから構成される プラグインとして提供されます。 基本環境である「Platform」に各プラグインを追加することにより研究に 適した環境を取り揃えることができます。 当資料では、6月にリリースされました4.3 の概要について紹介します。 【掲載概要】 ■リリース概要 ■SAFT-γ Mie力場 ■MesoAtom converter ■Size distribution ■VOTCA Plug-in ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、『MedeA-MT』による材料の機械的特性評価を紹介しております。 MedeA-MTモジュールは、機械物性を評価することができます。 差分法による弾性定数計算に加え、各種弾性率、Poisson比などの 機械的特性の他、延性・脆性の判定に使えるPugh比など様々な物性値を算出。 「MedeA」に搭載されているハイスループットモジュールと組み合わせることで、 材料の物性値データの大量生成にもお使いいただける便利なツールです。 【掲載概要】 ■第一原理・力場計算による弾性定数計算 ■実験値との比較 ■Pugh 比による脆性/ 延性の判定 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、リードアクロスによる安全性評価についてを紹介しております。 『ChemTunes ＆ ToxGPS』は、毒性・安全性情報のデータベース「ChemTunes」と、毒性の予測およびワークフローを含む知識ベース「ToxGPS」から成る化合物の安全性評価とリスク評価のための統合プラットフォームです。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象とし、 化合物の毒性学、安全性学研究全般で利用することができます。 【掲載概要】 ■ChemTunes ＆ ToxGPS Version 3.0 ■ToxGPS Read-Across ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、ChemInnovation Software 社製の『CBIS』の製品概要を紹介。 『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献や レポートといった文書など研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数の導入実績があり、柔軟なカスタマイズ性と優れたコスト パフォーマンスで高い評価をいただいております。 【掲載概要】 ■CBISとは ■CBISの構成 ■モジュールの例 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Scilligence社のライフサイエンス向けインフォマティクス・ソフトウェアは 電子実験ノート、分子情報およびアッセイデータ登録システム、 在庫管理システム、プロジェクト管理システム、実験データ管理システムなどの 製品から構成されています。 当資料では、在庫管理システムである「Scilligence Inventory」について 紹介しています。 【掲載内容】 ■Scilligence社製ソフトウェアの特長 ■Inventoryでの在庫管理 ■Scilligence社の他製品との連携 ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独 BioSolveIT社から、膨大なバーチャル化合物群の中より類似構造を高速に 探索するソフトウェア「infiniSee」がリリースされました。 当資料では、熱力学物性推算ソフトウェアなどの新製品情報をはじめ、 医薬品安全性情報サービスなどの技術情報についてご紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■新製品情報 ・COSMOtherm バージョン19リリース ・COSMOplex・COSMOpermリリース ・バーチャルライブラリー高速探索ツール infiniSee ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品の モデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。 広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの 配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。 当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を 紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■環状ペプチドの概要 ■環状ペプチドのモデリング ■環状ペプチドの配座解析 ■環状ペプチドの安定性予測 ■環状ペプチドの膜透過性予測 ■環状ペプチドの相互作用解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
熱力学物性推算ソフトウェア「COSMOtherm」の新バージョン19が リリースされました。 当資料では、新バージョンに搭載された新機能や改良された機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■新バージョンのトピックス ■状態方程式(EoS)を用いた物性推算機能の追加 ■液液平衡探索と共晶点探索機能 ■BP-TZVPD-FINEレベルの物性推算精度の向上 ■活量係数モデルへのフィッティング機能の強化 ■COSMO-RS-DARE機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
新製品「COSMOplex」「COSMOperm」が正式リリースされました。 両製品は、これまで分子膜・ミセル内分子分布シミュレーターとして 提供されていたCOSMOmicを改良・発展させた製品です 当資料では、両製品の概要と応用事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■COSMOmicとCOSMOplex ■COSMOperm ■応用事例：ミセル構造予測とミセル内の分布予測 ■応用事例：低分子の上皮透過性予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独BioSolveIT社の「SeeSAR」は、メディシナルケミストのための リード化合物最適化ツールです。 リガンド原子の結合自由エネルギーへの寄与や結合二面角の妥当性、 物性値等を総合的に評価しながら受容体の結合部位内での分子設計が可能です。 当資料では、バージョン9.0での更新点であるGUIの刷新と テンプレートドッキングを中心に紹介しています。 【掲載内容】 ■GUIの刷新 ■テンプレートドッキング ■そのほかの更新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独BioSolveIT社から、膨大なバーチャル化合物群の中よりクエリーと類似する 構造を高速に探索するソフトウェア「infiniSee」がリリースされました。 通常では閲覧が難しい数十億を超えるバーチャル化合物群の中より、 合成可能性の高い新規構造を数分という短い時間で提案できます。 当資料では、製品の概要や解析事例などをご紹介しています。 【掲載内容】 ■infiniSeeの概要 ■探索アルゴリズム ■操作の流れ ■infiniSeeとREAL Space Navigator ■解析事例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
BioSolveIT社から、さまざまな創薬支援ツールを『KNIME』上で 利用するためのKNIME Interfaces（23種の解析ノードセット）の 新バージョンがリリースされました。 メディシナルケミスト向けのリード化合物最適化ツールであるSeeSAR等の BioSolveIT社のツールを使った解析が可能です。 当資料ではKNIMEを使ったドッキングシミュレーションの解析例を 紹介しています。 【掲載内容】 ■BioSolveIT KNIME Interfacesで利用できる機能 ■KNIME Interfacesによるワークフロー例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOE 2019.01』は、さまざまな分子のモデリングとシミュレーションに 対応する統合計算化学システム「MOE」の新バージョンです。 当資料では、代表的な新機能や機能強化を紹介。 リガンドと受容体間の結合自由エネルギー計算、pHや構造変化を考慮した タンパク質物性推算、実験情報に基づく立体配座予測、柔軟な原子ラベル設定が 新機能として追加されます。 【掲載内容（抜粋）】 ■リガンドと受容体間の結合自由エネルギー計算 ■MOEsaicアップデート ■柔軟な原子ラベル表示 ■pHや構造変化を考慮したタンパク質物性推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、III-V族化合物半導体で電子・光学デバイスのバンド構造 エンジニアリングに必要となる、固体エネルギーバンド構造の詳細を 計算するため、Hartree-Fock-DFTハイブリッド汎関数であるHSE06を用いた 事例について報告します。 InAsのエネルギーバンド、特にその微細構造を例として、精度の高い 第一原理電子状態計算を用いることで、実験に匹敵する精度と信頼性を持つ 材料特性のデータが得られることを示しました。 【掲載内容】 ■結晶構造 ■バンド構造計算 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CORINA Symphony 1.1』は、CORINA Classicのアルゴリズムを利用して 分子構造の標準化と三次元化をGUIのワークフローから実行できるように 拡張したソフトウェアです。 当資料では、主な機能について紹介しています。 「分子構造標準化」をはじめ、「分子構造三次元化」や「記述子計算」 について掲載しています。 【掲載内容】 ■CORINA Symphony 1.1概要 ■分子構造標準化 ■分子構造三次元化 ■記述子計算 ■ToxPrint 計算 ■データセット管理機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CDD Vault』は、米国Collaborative Drug Discovery（CDD）社により 開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。 「CDD VaultとELNモジュールの連携強化」をはじめ、 「ELN へのアッセイアノテーション付与」や「生物製剤情報の管理」、 「数値計算時に不等号を適切に保持」等を2018年に実装。 当資料では、特に重要な機能強化である最初の2点について紹介しています。 【掲載内容】 ■CDD Vaultとは ■CDD VaultとELNモジュールの連携強化 ■ELNへのアッセイアノテーション付与 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MedeAは原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を 行うための統合支援環境です。 第一原理計算が比較的容易に行える現在において、データ生成を目的とし 異なるモデル構造に対して、同じ計算を繰り返し実行する場面が増えています。 「MedeA-HT 機能」を活用することで、そうした大量の繰り返し計算を 簡単に自動化することができます。 当資料では『MedeA-HT』を用いたSlater-Pauling曲線の作成例を示します。 Slater-Pauling曲線とは、合金中の組成の違いによる磁気モーメントの変化を プロットした図のことです。 【掲載内容】 ■本稿の概要 ■フローチャートを用いた計算の設定 ■計算結果 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『TURBOMOLE 7.3』は、高速量子化学計算ソフトウェアTURBOMOLEの 新バージョンです。 Resolution of the identity (Rl) 近似の導入により、膨大な計算時間が 必要なクーロン積分を高速化し、Hartree-Fock法、密度汎関数法(DFT)、 Møller-Plesset摂動法およびクラスター展開法の計算時間を大幅に 短縮することを可能にしています。 新バージョンでは、さらにradlessモジュールが追加され、FCを考慮した 吸収・発光スペクトルの算出が可能になりました。 【バージョンアップのトピックス】 ■Franck-Condon因子を計算する新モジュールradless ■RI 法によるGW の高速化とevGW/qsGW のサポート ■時間依存密度汎関数法（TDDFT）による2光子吸収断面積 ■周期境界条件DFT 計算における大規模基底関数のサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CORINA Classic 4.2.0』は、低分子量から中分子量までの有機化合物の 三次元分子構造を生成するソフトウェアの新バージョンです。 経験的手法を用いることで高速かつ高精度な三次元化を実現します。 新バージョンでは、アトロプ異性体発生機能の追加や大環状化合物の取り扱いの 見直し、計算速度と変換率の向上、読み込みデータ区切り文字の指定を はじめとするファイルI/Oに関するオプション追加などの改良が行われています。 【特長】 ■アトロプ異性体発生機能の追加 ■大環状化合物の取り扱いの見直し ■計算速度と変換率の向上 ■ファイルI/Oに関するオプション追加 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CBIS：汎用電子実験ノート』は、研究に使用する資材、研究で生じた 実験データ、文献やレポートといった文書など研究に関わる多様なデータを 統合して管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高い評価をいただいております。 また、当システムはあらかじめ用意された表示内容やワークフローを 組み合わせながら開発することで、ご要望に沿ったシステムを短期間で 提供することが可能です。 【特長】 ■紙の実験ノートに近い構成 ■非定型データの登録 ■ページの登録状態 ■業務フローに応じたカスタマイズ ■他のモジュールとの連携 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
