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『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬（PROTAC）の 開発を支援するためのMOEのカスタムアプリケーションです。 三元複合体（標的タンパク質-PROTAC-E3リガーゼ）の構造の予測と モデリングを容易に行えます。 タンパク質間の衝突や接触を表すスコアにより適切なモデルを選別できます。 当製品は保守契約中であれば無償で入手でき、また、アプリケーションの 使用にトークンを追加する必要はありません。 【特長】 ■PROTAC開発用アプリケーション ■三元複合体構造の予測とモデリングを容易に行える ■タンパク質間の衝突や接触を表すスコアにより適切なモデルを選別できる ■アプリケーションの使用にトークンを追加する必要がない ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOE-Extensions for KNIME』は、MOEをワークフローツール 「KNIME」上で使用するためのインターフェイスです。 当製品を利用することで、化合物や受容体構造の前処理、 ドッキング、FBDD、ファーマコフォア検索などのMOEによる 連続的な処理を容易に定義できます。 【特長】 ■誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 ■プログラミング不要で作業を自動化 ■処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 ■創薬研究のための多数のノードを提供 ■KNIMEの他ノードとの連携が容易（機械学習等） ■ユーザーオリジナルノードの作成が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『REAL Space Navigator』は、Enamine社における110億構造におよぶ バーチャル化合物群の中からクエリー化合物に類似の構造を 高速に探索するツールです。 ヒットした構造は同社により実際に合成できる可能性が高く、ユーザーは スキャフォールドホッピングされた新規化合物をオンデマンドに入手可能。 当製品による検索は、BioSolveIT社のFTrees-FSの類似構造構築手法に 基づいて行われます。 【特長】 ■110億通りのバーチャル化合物の中から、まだ発見されていない 新規リガンド候補を超高速に探索 ■クエリー化合物が持つ化学的な特長とその2次元的な位置が類似する 構造を簡単かつ効率的に得ることができる ■ヒット構造をEnamine社に合成依頼が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 （水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。 得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。 【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成 ■相互作用しているアミノ酸の種類や原子などを分かりやすく2次元で表示 ■操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ ■作成された図は、Protein Data Bankの公式の相互作用図として採用されている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『infiniSee』は、既存の化合物ライブラリーあるいは、10^20個を超える バーチャル化合物群の中より類似構造を高速に探索するソフトウェアです。 新規構造、SAR展開、特許を回避した構造など、目的に応じた候補構造を 簡単な操作で発見できます。 創薬における加速化と低コスト化を実現します。 【特長】 ■超高速ケミカルスペースナビゲーション 分単位で10^20構造を探索 ■容易なスキャフォールドホッピング FTreesFSアルゴリズムを用いた構造構築 ■構造類似性の可視化 分かりやすい表示による候補構造の決定 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『FlexX』は、タンパク質のリガンド結合部位に、医薬候補化合物を フラグメント単位で配置することで高速に化合物のドッキング構造を 予測するプログラムです。 結合部位に化合物群を順次配置しリガンド候補を絞り込むバーチャル スクリーニングや、リガンド-受容体間の相互作用解析に利用できます。 【特長】 ■多様な分子系に対応 ■高速ドッキング ■ファーマコフォアフィルター ■SeeSARとの連携 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CoLibri』は、反応式をもとにフラグメントライブラリーと バーチャルライブラリーを作成するツールです。 ライブラリーは化学反応式に基づいて作成されるため、 より現実的なバーチャル化合物を得ることが可能。 サードパーティとの連携に優れた、BioSolveIT社のソフトウェアです。 【特長】 ■化学反応に基づき試薬構造の一部を反応点で置き換えたフラグメント ライブラリーとフラグメント同士をつなげるルールの情報を出力 ■もとになる化合物は、試薬ベンダーから提供される試薬データベースを 用いることができる ■試薬データベース内で指定した化学反応に適合する化合物が自動的に選択 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
材料設計支援プラットフォーム『SciMAPS』の各計算プログラムは、 計算プログラム本体とそれに対するインターフェースから構成される プラグインとして提供されます。 基本環境である「Platform」に各プラグインを追加することにより研究に 適した環境を取り揃えることができます。 当資料では、6月にリリースされました4.3 の概要について紹介します。 【掲載概要】 ■リリース概要 ■SAFT-γ Mie力場 ■MesoAtom converter ■Size distribution ■VOTCA Plug-in ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、『MedeA-MT』による材料の機械的特性評価を紹介しております。 MedeA-MTモジュールは、機械物性を評価することができます。 差分法による弾性定数計算に加え、各種弾性率、Poisson比などの 機械的特性の他、延性・脆性の判定に使えるPugh比など様々な物性値を算出。 「MedeA」に搭載されているハイスループットモジュールと組み合わせることで、 材料の物性値データの大量生成にもお使いいただける便利なツールです。 【掲載概要】 ■第一原理・力場計算による弾性定数計算 ■実験値との比較 ■Pugh 比による脆性/ 延性の判定 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、リードアクロスによる安全性評価についてを紹介しております。 『ChemTunes ＆ ToxGPS』は、毒性・安全性情報のデータベース「ChemTunes」と、毒性の予測およびワークフローを含む知識ベース「ToxGPS」から成る化合物の安全性評価とリスク評価のための統合プラットフォームです。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象とし、 化合物の毒性学、安全性学研究全般で利用することができます。 【掲載概要】 ■ChemTunes ＆ ToxGPS Version 3.0 ■ToxGPS Read-Across ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、ChemInnovation Software 社製の『CBIS』の製品概要を紹介。 『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献や レポートといった文書など研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数の導入実績があり、柔軟なカスタマイズ性と優れたコスト パフォーマンスで高い評価をいただいております。 【掲載概要】 ■CBISとは ■CBISの構成 ■モジュールの例 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Scilligence社のライフサイエンス向けインフォマティクス・ソフトウェアは 電子実験ノート、分子情報およびアッセイデータ登録システム、 在庫管理システム、プロジェクト管理システム、実験データ管理システムなどの 製品から構成されています。 当資料では、在庫管理システムである「Scilligence Inventory」について 紹介しています。 【掲載内容】 ■Scilligence社製ソフトウェアの特長 ■Inventoryでの在庫管理 ■Scilligence社の他製品との連携 ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独 BioSolveIT社から、膨大なバーチャル化合物群の中より類似構造を高速に 探索するソフトウェア「infiniSee」がリリースされました。 当資料では、熱力学物性推算ソフトウェアなどの新製品情報をはじめ、 医薬品安全性情報サービスなどの技術情報についてご紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■新製品情報 ・COSMOtherm バージョン19リリース ・COSMOplex・COSMOpermリリース ・バーチャルライブラリー高速探索ツール infiniSee ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品の モデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。 広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの 配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。 当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を 紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■環状ペプチドの概要 ■環状ペプチドのモデリング ■環状ペプチドの配座解析 ■環状ペプチドの安定性予測 ■環状ペプチドの膜透過性予測 ■環状ペプチドの相互作用解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
熱力学物性推算ソフトウェア「COSMOtherm」の新バージョン19が リリースされました。 当資料では、新バージョンに搭載された新機能や改良された機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■新バージョンのトピックス ■状態方程式(EoS)を用いた物性推算機能の追加 ■液液平衡探索と共晶点探索機能 ■BP-TZVPD-FINEレベルの物性推算精度の向上 ■活量係数モデルへのフィッティング機能の強化 ■COSMO-RS-DARE機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
新製品「COSMOplex」「COSMOperm」が正式リリースされました。 両製品は、これまで分子膜・ミセル内分子分布シミュレーターとして 提供されていたCOSMOmicを改良・発展させた製品です 当資料では、両製品の概要と応用事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■COSMOmicとCOSMOplex ■COSMOperm ■応用事例：ミセル構造予測とミセル内の分布予測 ■応用事例：低分子の上皮透過性予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独BioSolveIT社の「SeeSAR」は、メディシナルケミストのための リード化合物最適化ツールです。 リガンド原子の結合自由エネルギーへの寄与や結合二面角の妥当性、 物性値等を総合的に評価しながら受容体の結合部位内での分子設計が可能です。 当資料では、バージョン9.0での更新点であるGUIの刷新と テンプレートドッキングを中心に紹介しています。 【掲載内容】 ■GUIの刷新 ■テンプレートドッキング ■そのほかの更新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
独BioSolveIT社から、膨大なバーチャル化合物群の中よりクエリーと類似する 構造を高速に探索するソフトウェア「infiniSee」がリリースされました。 通常では閲覧が難しい数十億を超えるバーチャル化合物群の中より、 合成可能性の高い新規構造を数分という短い時間で提案できます。 当資料では、製品の概要や解析事例などをご紹介しています。 【掲載内容】 ■infiniSeeの概要 ■探索アルゴリズム ■操作の流れ ■infiniSeeとREAL Space Navigator ■解析事例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
BioSolveIT社から、さまざまな創薬支援ツールを『KNIME』上で 利用するためのKNIME Interfaces（23種の解析ノードセット）の 新バージョンがリリースされました。 メディシナルケミスト向けのリード化合物最適化ツールであるSeeSAR等の BioSolveIT社のツールを使った解析が可能です。 当資料ではKNIMEを使ったドッキングシミュレーションの解析例を 紹介しています。 【掲載内容】 ■BioSolveIT KNIME Interfacesで利用できる機能 ■KNIME Interfacesによるワークフロー例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOE 2019.01』は、さまざまな分子のモデリングとシミュレーションに 対応する統合計算化学システム「MOE」の新バージョンです。 当資料では、代表的な新機能や機能強化を紹介。 リガンドと受容体間の結合自由エネルギー計算、pHや構造変化を考慮した タンパク質物性推算、実験情報に基づく立体配座予測、柔軟な原子ラベル設定が 新機能として追加されます。 【掲載内容（抜粋）】 ■リガンドと受容体間の結合自由エネルギー計算 ■MOEsaicアップデート ■柔軟な原子ラベル表示 ■pHや構造変化を考慮したタンパク質物性推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、III-V族化合物半導体で電子・光学デバイスのバンド構造 エンジニアリングに必要となる、固体エネルギーバンド構造の詳細を 計算するため、Hartree-Fock-DFTハイブリッド汎関数であるHSE06を用いた 事例について報告します。 InAsのエネルギーバンド、特にその微細構造を例として、精度の高い 第一原理電子状態計算を用いることで、実験に匹敵する精度と信頼性を持つ 材料特性のデータが得られることを示しました。 【掲載内容】 ■結晶構造 ■バンド構造計算 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CORINA Symphony 1.1』は、CORINA Classicのアルゴリズムを利用して 分子構造の標準化と三次元化をGUIのワークフローから実行できるように 拡張したソフトウェアです。 当資料では、主な機能について紹介しています。 「分子構造標準化」をはじめ、「分子構造三次元化」や「記述子計算」 について掲載しています。 【掲載内容】 ■CORINA Symphony 1.1概要 ■分子構造標準化 ■分子構造三次元化 ■記述子計算 ■ToxPrint 計算 ■データセット管理機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CDD Vault』は、米国Collaborative Drug Discovery（CDD）社により 開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。 「CDD VaultとELNモジュールの連携強化」をはじめ、 「ELN へのアッセイアノテーション付与」や「生物製剤情報の管理」、 「数値計算時に不等号を適切に保持」等を2018年に実装。 当資料では、特に重要な機能強化である最初の2点について紹介しています。 【掲載内容】 ■CDD Vaultとは ■CDD VaultとELNモジュールの連携強化 ■ELNへのアッセイアノテーション付与 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MedeAは原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を 行うための統合支援環境です。 第一原理計算が比較的容易に行える現在において、データ生成を目的とし 異なるモデル構造に対して、同じ計算を繰り返し実行する場面が増えています。 「MedeA-HT 機能」を活用することで、そうした大量の繰り返し計算を 簡単に自動化することができます。 当資料では『MedeA-HT』を用いたSlater-Pauling曲線の作成例を示します。 Slater-Pauling曲線とは、合金中の組成の違いによる磁気モーメントの変化を プロットした図のことです。 【掲載内容】 ■本稿の概要 ■フローチャートを用いた計算の設定 ■計算結果 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『TURBOMOLE 7.3』は、高速量子化学計算ソフトウェアTURBOMOLEの 新バージョンです。 Resolution of the identity (Rl) 近似の導入により、膨大な計算時間が 必要なクーロン積分を高速化し、Hartree-Fock法、密度汎関数法(DFT)、 Møller-Plesset摂動法およびクラスター展開法の計算時間を大幅に 短縮することを可能にしています。 新バージョンでは、さらにradlessモジュールが追加され、FCを考慮した 吸収・発光スペクトルの算出が可能になりました。 【バージョンアップのトピックス】 ■Franck-Condon因子を計算する新モジュールradless ■RI 法によるGW の高速化とevGW/qsGW のサポート ■時間依存密度汎関数法（TDDFT）による2光子吸収断面積 ■周期境界条件DFT 計算における大規模基底関数のサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CORINA Classic 4.2.0』は、低分子量から中分子量までの有機化合物の 三次元分子構造を生成するソフトウェアの新バージョンです。 経験的手法を用いることで高速かつ高精度な三次元化を実現します。 新バージョンでは、アトロプ異性体発生機能の追加や大環状化合物の取り扱いの 見直し、計算速度と変換率の向上、読み込みデータ区切り文字の指定を はじめとするファイルI/Oに関するオプション追加などの改良が行われています。 【特長】 ■アトロプ異性体発生機能の追加 ■大環状化合物の取り扱いの見直し ■計算速度と変換率の向上 ■ファイルI/Oに関するオプション追加 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『CBIS：汎用電子実験ノート』は、研究に使用する資材、研究で生じた 実験データ、文献やレポートといった文書など研究に関わる多様なデータを 統合して管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高い評価をいただいております。 また、当システムはあらかじめ用意された表示内容やワークフローを 組み合わせながら開発することで、ご要望に沿ったシステムを短期間で 提供することが可能です。 【特長】 ■紙の実験ノートに近い構成 ■非定型データの登録 ■ページの登録状態 ■業務フローに応じたカスタマイズ ■他のモジュールとの連携 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『ReaxFF 2018』は、CVHD（Collective Variable-driven Hyperdynamics） やbond-boostといった燃焼反応やポリマーの架橋反応のMDを加速させるための 手法が搭載されたことに加えて、CMA-ES（Covariance Matrix Adaptation Evolution Strategy）法を用いた反応力場パラメーターの最適化に 対応しています。 また、非平衡MDによる熱伝導率の計算や、圧力・弾性テンソルと関連の プロパティ計算ができるようになりました。 【特長】 ■燃焼反応やポリマーの架橋反応のMDを加速させるための手法を搭載 ■CMA-ES法を用いた反応力場パラメーターの最適化に対応 ■応力計算が可能 ■ヤング率などの機械特性の計算が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOE』は、柔軟な核酸モデリングが可能です。 二本鎖および一本鎖核酸を容易にモデリングでき、修飾核酸にも対応。 塩基配列のセンス、アンチセンス表示や塩基配列のアライメント、 核酸構造の重ね合わせも可能です。 また、構築した核酸の物性推算や、ドッキング計算による核酸-タンパク 質複合体の構造予測ができます。 核酸の配列・立体構造・相互作用・物性を相互に関連付けて 解析することで、核酸創薬の現場を強力に支援します。 【特長】 ■核酸の構築、伸長、修正のための専用パネルを搭載 ■核酸用パラメーターの改良 ■一本鎖および二本鎖の構築、伸長、編集 ■アンチセンス対応 ■核酸のアライメント・重ね合わせ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「SciMAPS」は、、外部プログラムとの連携を前提とした、拡張性の高い 設計思想を持つ材料設計支援プラットフォームです。 使いやすいモデル構築機能、データ解析機能が標準装備され、大学や研究機関で 開発された世界的に定評のある先進の計算プログラムを統一された操作で利用できます。 最新版リリースに先立ち、開発元の研究者を招聘して6月末に開催された MOLSIS特別セミナーの報告とSciMAPS最新版の4.2の概要についてご紹介します。 【掲載内容】 ■MOLSIS特別セミナー ■SciMAPS 4.2リリース情報 ・粗視化モデルのサポート強化 ・LAMMPSの物性計算と解析機能の追加 ・Crosslinkerの改良 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOE-QFSS』は、複数の巨大な化合物ライブラリーから、高速かつ横断的に 構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 リレーショナルデータベースを使用することなく、ユーザーはMOEのみで 高速な分子構造検索が可能です。 高速な化合物検索を通して、分子設計やバーチャルスクリーニングの現場を 強力に支援します。 【特長】 ■部分構造の超高速検索 ■類似構造検索に対応 ■分子記述子フィルター ■化合物ライブラリーの追加 ■連続検索に対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOEフォーラム2018』では、医薬、農薬、化学、バイオ関連の企業、 研究機関、大学などから多くの研究者にご参加いただき、様々な 意見交換がなされました。 4名の先生方からはMOEの活用事例のご講演と、開発元のCCG社からは 次バージョンに搭載予定の新機能の紹介を行いました。 当社からは、実験研究者のためのMOE/webアプリケーションと その活用事例を紹介しました。 【招待講演】 ■創薬支援研究におけるインシリコ技術の活用事例の紹介 ■構造生物学解析が拓く、特徴的PPARγアゴニストへの合理的構造転換 ■分子設計におけるAI活用の動向と将来展望 ■硝化抑制剤の構造ベース創農薬 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MedeA-HT』は、信頼性の高い計算データの大量生成・解析のための ツールとして開発された材料設計支援統合システムです。 また、当システムは、原子・分子スケールのシミュレーション技術を 基に各種の物性評価を行うための統合支援環境「MedeA」に搭載されており、 マテリアルズインフォマティクスに不可欠なシミュレーションによる 大量データ生成を簡便に行うことが出来ます。 そして、固体の電子状態については「MedeAVASP」、分子が対象で あれば「Gaussian」や「MOPAC」、力場計算であれば「MedeA-LAMMPS」 や「MedeA-GIBBS」を選択することができます。 当資料では、機能と特長、事例も含めご紹介します。 【掲載内容】 ■マテリアルズインフォマティクス ■MedeA-HT LaunchpadとStructure list ■MedeA-HT Descriptors ■適用事例：融点の推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEの カスタムアプリケーションです。 抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、 配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行えます。 MOEの標準アプリケーションと組み合わせて、生物学的製剤の開発における 問題や課題をクリアにし、in-silicoを用いた合理的な分子設計が可能です。 【特長】 ■バイオ医薬品開発のためのカスタムアプリケーション ■従来のMOEのメニューにBio-MOEメニューを新規に追加し使用 ■より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行える ■生物学的製剤の開発における問題や課題をクリア ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当システムは、化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウド上の ウェブシステム、創薬研究情報共有クラウドシステムです。 化学データや生物学データを安全に管理して共有するための クラウド型データベースソリューションです。 また、使いやすい可視化機能によりプロジェクトメンバー全員がデータを 簡単に解釈できることで、プロジェクトの効率化につなげます。 【掲載内容】 ■創薬プロジェクトはなぜ困難なのか？ ■創薬プロジェクトチームの目的 ■プロジェクトチームの情報管理 ■創薬プロジェクト管理システム CDD Vault ■結論 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、独BioSolveIT社のメディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツール『SeeSAR 8.0リリース』について 掲載しています。 『SeeSAR』は、受容体の結合部位内において、リガンド原子の 結合自由エネルギーへの寄与、結合二面角の妥当性、リガンド物性 などを評価できます。 今回のリリースでは、バージョンアップによるFragment Based Ligand Designの ためのInspirator機能の強化およびタンパク質の構造アラインメントの 機能の強化と、配列表示機能の改良を行いました。 【掲載内容】 ■FBLDのためのInspirator機能の強化 ■タンパク質構造のアラインメント機能の強化 ■配列表示機能の改良 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『MOE』は、創薬・生命科学研究のための分子モデリング、シミュレーションソフトウェアです。 直観的に操作できる多彩なアプリケーションと豊富なデータコンテンツで、 計算化学者から実験研究者まで、幅広いユーザーの研究をサポートします。 国内外で多くの導入実績があり、分子シミュレーション、ケモインフォマティクス、 タンパク質・抗体・ペプチドモデリング、立体構造に基づく分子設計、 ファーマコフォア解析など様々な機能を搭載。 現在『MOE』の特長・事例が紹介された書籍 『in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術(注1)』 の抜刷資料を進呈中。 「お問い合わせ」より「抜刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。 ※製品の詳細は『PDFダウンロード』よりカタログをご覧ください。
当資料では、ニューラルネットワーク手法に基づくデータ解析が可能な SONNIAについて掲載しています。 MN-AM社製「SONNIA」は、自己組織化ニューラルネットワーク手法に 基づいて低分子化合物のクラスター解析とQSA(P)R解析を行います。 データの入出力、計算の設定、結果の表示に対話的かつグラフィカルな インターフェースを提供し、化合物の物理化学的特性間あるいはそれらと 生物活性等の実験値との関係を可視化して解析することができます。 【掲載内容】 ■SONNIA 概要 ■SONNIAの主な機能 ■応用事例紹介 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、バージョンアップされた創薬支援ツール SeeSAR 7.2について掲載しています。 独BioSolveIT社の「SeeSAR」は、メディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツールです。 今回のバージョンアップでは、フラグメントベースのリガンドデザイン機能が 強化され、従来の母核構造置換に加え、フラグメント付加、複数フラグメント の結合によって新規リガンド候補構造を設計できるようになりました。 【掲載内容】 ■追加されたFBDD機能の概要 ■フラグメント付加の解析例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、タンパク質立体構造データベースシステム PSILO 2018の新機能について掲載しています。 「PSILO」は、生体高分子やタンパク質ーリガンド複合体構造情報の データベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、 データの共有を支援します。 公共データやインハウスデータなどの散在するタンパク質立体構造データを 統合し、ウェブベースのインターフェースから容易に活用することができます。 【掲載内容】 ■MOE Project データベース ■NGL 3D Visualizerのサポート ■ブラウザーベースのスケッチャー ■MMTF フォーマット出力 ■MOEからのファイルアクセス ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、QFSSの概要と新機能、構造検索事例について掲載しています。 「MOE-QFSS」は、複数の巨大な化合物データベースに対して高速かつ 横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 新バージョンでは、公共データベースへのアクセスと MOE/web SOAPサーバーでの検索に対応しました。 さらに、QFSSのMOE/webアプリケーションを提供。それによって目的や 計算資源に応じたQFSSの実行環境を構築できます。 【掲載内容】 ■QFSS概要 ■QFSSによる検索 ■バージョンアップ内容 ■QFSSを用いた応用事例 ■QFSSの入手方法 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、MedeAの新版としてリリースされたバージョン2.22について 掲載しています。 「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に 各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 新版では、VASP等の計算プログラムがアップデートされ、 新しい計算機能を使用できるようになりました。 【掲載内容】 ■MedeA 2.22アップデート内容 ・MedeA-VASP ・MedeA-GIBBS ・MedeA-LAMMPS ・MedeA-MOPAC ・MedeA-Gaussian 他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、MedeA環境に統合された第一原理計算ソフトウェア 「MedeA-VASP」を用いた遷移金属酸化物表面のモデリング事例について 掲載しています。 酸化触媒としても使用される酸化鉄（ヘマタイトFe2O3）の(0001)面 についてさまざまな表面終端モデルの表面エネルギーを評価し、 触媒として活性な表面構造について解析します。 【掲載内容】 ■表面エネルギーによる酸化鉄表面の評価 ■表面エネルギーと構造の関係 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当資料では、「COSMOperm」の予測方法と予測精度について掲載しています。 COSMOlogic社新製品として、低分子の分子膜透過性を予測する ソフトウェアがリリースされます。 本製品は、既存の分子膜・ミセル内分子分布シミュレーター「COSMOmic」で 算出される分子膜中の分配係数と新たに考案されたCOSMO－RS法に基づく 拡散係数予測式を用いて膜透過性を予測します。 【掲載内容】 ■COSMOpermの予測方法と予測精度 ■予測精度の検証事例 ・約40種の低分子の膜透過性が検討された ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に 各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 開発元であるMaterials Design社では、ユーザー会を例年開催しており 昨年は9月にフランスで開催しました。 また、日本では11月にJFCC（ファインセラミックスセンター）にて セミナーを開催し、新開発動向や適用事例を紹介しました。 【概要】 ■MedeA ユーザー会 ・世界中から50名程のユーザーが参加 ・「ハンズオントレーニングセッション」では、モデリングや解析方法を演習 ・「サイエンティフィックプログラム」と称し、ユーザーからの研究報告や 開発元からの新動向が発表 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
【イプロス初主催】AIを活用したリアル展示会！出展社募集中
