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株式会社モルシス

設立平成28年12月5日
資本金3000万
従業員数23名
住所東京都中央区八丁堀三丁目19番9号 ジオ八丁堀7階
電話03-3553-8030
  • 特設サイト
  • 公式サイト
最終更新日:2025/12/15
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研究データ管理システム 研究データ管理システム
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ケーススタディ(ライフサイエンス) ケーススタディ(ライフサイエンス)
ケーススタディ ケーススタディ
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【技術情報】CORINAClassic/Symphony製品紹介

配座発生/分子データセット管理とプロファイリング!製品の概要などを掲載!

当資料では、MN-AM社製「CORINA Classic」および「CORINA Symphony」 について掲載しています。 各製品の概要をはじめ、分子構造標準化などの機能をご紹介しております。 【掲載内容】 ■CORINA Classic 概要 ■CORINA Symphony 概要 ■分子構造標準化 ・フラグメントの除去 ・水素原子の付加 ・分子構造の中性化 ・重複分子の削除 他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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  • その他

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【新製品情報】CDD VAULT ELNリリース

製薬企業や公的研究機関などが共同研究を進めるためのプラットフォームに!

当資料では、CDD VAULTの電子ノートブックモジュール 「CDD VAULT ELN」について掲載しています。 「CDD VAULT」は米国CDD社により開発された化合物情報とアッセイ情報を 共有するクラウド上のウェブシステムです。 ウェブブラウザーだけで創薬研究の一連のデータを管理でき 優れた可視化機能を持っています。 製薬企業やベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を 進めるために適したプラットフォームになります。 【掲載内容】 ■CDD VAULT ELNとは ■特長 ・自由な記述 ・ファイルの添付 ・オートセーブ機能 ・エントリーの状態 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他情報システム

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【新製品情報】SeeSAR 7.1リリース

ユーザーインターフェース刷新!使いやすさがより向上した創薬支援ツールをご紹介

当資料では、独BioSolveIT社のメディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツールについて掲載しています。 「SeeSAR」は、既知のリガンド結合部位内における原子や母核の置換による リガンド修飾や、リガンドの物性とADME特性の計算、受容体との 結合親和性の評価等を組み合わせてシームレスな分子設計を可能にします。 最近実施されたバージョンアップでは、既存機能の強化がなされ、 ユーザーインターフェースが刷新されました。 ヘルプマニュアルが充実し、使いやすさがより向上しました。 【掲載内容】 ■ヘルプマニュアルの充実、ユーザーインターフェースの刷新 ■複数のタンパク質構造の取り扱い ■ファーマコフォアの設定 ■原子間結合の回転と二面角のラベル ■その他の機能増強 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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【新製品情報】SciMAPS 4.1.1リリース

材料設計支援プラットフォーム SciMAPS 4.1.1の概要についてご紹介

当資料では、2018年2月にリリースされました新版の4.1.1の 概要について掲載しています。 材料設計支援プラットフォームSciMAPSの各計算プログラムは、 計算プログラム本体とそれに対するインターフェースから構成される プラグインとして提供されます。 基本環境であるPlatformに各プラグインを追加することにより 研究に適した環境を取り揃えることができます。 【掲載内容】 ■新機能AtoMeso Converter ■構造構築機能の粗視化モデル対応 ■新製品とシミュレーションの粗視化対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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【新製品情報】MOE 2017.11 新機能紹介

分子系のより直感的な操作が可能に!主な新機能や機能強化をご紹介!

当資料では、統合計算化学システム「MOE 2017.11」の主な新機能や 機能強化を掲載しています。 新機能として抗原の抗体結合部位を精度よく予測するエピトープマッピング、 低分子の結合のねじれ角を回転させた際のエネルギープロファイルを 予測するTorsion Profileの機能が追加されます。 さらに、新しいデータコンテンツとして、TCR-MHC複合体データベースが 追加されます。 【掲載内容】 ■エピトープマッピング ■VRディスプレイ「zSpace」のサポート ■Torsion Profile ■DNA/RNA 関連機能の強化 ■TCR-MHC 複合体データベース 他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • 文書・データ管理
  • その他

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MOE Extensions for KNIME Ver.2.4

MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解析処理を可視化・保管できます

KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。 ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。 プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。 MOEノードと、既存のデータマイニングやマシンラーニング(機械学習)などのノード、サードパーティ製品のノードも自由に組み合わせることができ柔軟なワークフローの設計が可能になります。

  • 3次元CAD

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【書籍発刊】「MOE」を用いた創薬研究の効率化 ※抜刷進呈中

in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例としてCCG社の統合計算化学システム「MOE」の特長と事例を紹介

株式会社技術情報協会から2018年1月31日に「in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術」が発刊されました。 本書には、コンピュータの処理能力の速さを活かしつつ、計算コスト増大の課題をいかに克服するか?という課題についてin silico創薬を成功に導く計算科学やスパコン、データベース構築の重要技術が満載されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。 第4章「in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例」の第2節で「MOE」を用いた創薬研究の効率化について紹介されています。本節はMOEの特長とMOEを利用した創薬研究の効率化の事例について詳しく説明しています。特にMOEが持つ多彩な機能の中から特にバーチャル・スクリーニングに焦点を絞り、解析事例も交えながら、MOEの機能を紹介しています。 本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい! 「PDFダウンロード」からはMOEのカタログをダウンロードできます。

  • その他情報システム

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卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分けできる使用モード ■低分子・フラグメント・標的タンパク質データベース ■新機能開発やカスタマイズ ■サードパーティ製品との連携 ■Windows/Mac/Linuxに対応 ■計算化学者、実験研究者が広く利用 ■医薬、農薬、食品、材料設計などの様々な分野に対応 【搭載アプリケーション】 ■分子モデリング ■配座解析・分子動力学計算・量子化学計算 ■ドッキングシミュレーション ■構造活性相関・ケモインフォマティクス ■タンパク質・抗体モデリング ■変異体構築・タンパク質/ペプチドデザイン ■核酸モデリング ■ファーマコフォア解析 ■フラグメント構造に基づく分子設計

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)

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タンパク質立体構造情報データベースシステム『PSILO』

多様な条件で検索可能!生体高分子やリガンド複合体構造情報のデータベースシステム

『PSILO』は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データ共有を支援します。 公共データやin-houseデータなどの分散するタンパク質立体構造データを統合し、ウェブベースの インターフェースから容易にアクセスすることができます。 【特長】 ■高速なテキスト検索 ■タンパク質/抗体アミノ酸配列検索 ■タンパク質立体構造全体の重ね合わせ ■リガンド結合部位の2D/3D表示 ■PDBデータの自動更新 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • データ検索ソフト

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研究情報共有システム『CBIS』 創薬研究や材料開発に最適

研究情報を効率的に管理して情報資産としての価値を向上!利用人数に制限がないウェブシステムなので社内外のコラボレーションに最適!

『CBIS』は、化合物・細胞株・プラスミド・プレートなどの実験材料、プレートアッセイ結果や機器分析結果などの実験データ、報告書や参考文献などの関連文書といった研究に関わるあらゆるデータを統合的に管理する研究情報共有システムです。 『CBIS』はデータの種類ごとにモジュール化されています。化合物やアッセイ結果などの主要な研究データの管理システムは、基本的な機能を盛り込んだモジュールのテンプレートを利用して迅速に構築することができます。 【CBISの代表的なモジュール】 ■化合物(カタログ/在庫) ■アッセイデータ ■HTS(プレート/一次スクリーニング/二次スクリーニング) ■合成化学向け電子ノート ■バイオ研究向け電子ノート ■試薬 ■プラスミド ■細胞株 ■文書 ■プロジェクト ■材料管理(原材料/レシピ/実験結果/規格) 新規のモジュールを開発する際には、多数のパーツを組み合わせるイージーオーダー型の手法を取ることで、ご要望に沿ったシステムの導入を短期間で実現します。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他 研究用ソフトウェア
  • 文書・データ管理

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量子化学計算ソフトウェア『ADF』

豊富なプロパティ計算機能!様々な系に適用可能な密度汎関数法ソフトウェア

『ADF』は、密度汎関数法に基づく量子化学計算ソフトウェアです。 均一系・不均一系触媒から無機化学、重元素科学、生化学、各種分光学まで幅広い分野の研究に利用されています。遷移金属を含んだ系でもSCF計算の収束がよく、重元素系で重要な相対論の効果を含めることができます。さらに、周期表の全元素に対応した全電子計算用の基底関数(Slater型)を完備していることは当製品の大きな特長です。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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熱力学物性推算ソフトウェア『COSMOtherm』

ひろがる領域、ひろがる可能性!様々な平衡物性を推算することができるソフトウェア

『COSMOtherm』は、物性推算法COSMO-RS法を用いた熱力学物性推算ソフトウェアです。任意の化合物や混合溶液の蒸気圧・分配係数など様々な平衡物性を推算することができます。 COSMO-RS法は、量子化学計算で得られる分子の表面電荷情報と分子統計力学に基づき、溶液中の分子の化学ポテンシャルを算出します。そして、得られた化学ポテンシャルを用いて、様々な平衡熱力学物性を算出します。 当製品は、様々な化合物の物性予測を可能にし、研究者・技術者の幅広いニーズに応えます。例えば、プラント設計や材料設計から医薬品設計・製剤プロセスにおいて利用可能です。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)

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材料設計支援統合システム『MedeA』

第一原理バンド計算による「材料設計」!

『MedeA』は、材料設計のための統合的な計算環境です。 第一原理バンド計算を基に、材料(金属・セラミックス・半導体など)に対する、各種物性(構造、光学物性、磁性、熱力学物性、弾性、振動、電子伝導性)を評価することができます。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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創薬研究情報共有クラウドシステム『CDD VAULT』

サンプル情報およびアッセイデータをクラウド上で共有、ELNも利用可能! 製薬企業とバイオベンチャーやアカデミアの共同研究にも好適

『CDD VAULT』は、創薬研究に関する情報を共有するクラウドシステムです。化合物、ペプチド、DNA/RNAや細胞株などのサンプル情報と、それらのサンプルを用いたさまざまな実験データを登録し、研究者間で共有できます。 ■中核機能 ・サンプルの管理 ・アッセイなどの実験情報と、結果データの管理 ・データの可視化 ■オプション機能 ・サンプルの詳細な在庫管理 ・電子実験ノート ・多様なグラフの作成 ・創薬向けAI ・API CDD VAULTではデータをクラウドサーバーで管理し、ユーザーはデータにインターネット経由でアクセスします。異なる事業所や組織に所属するケミストやバイオロジストの間でもお互いの進捗をリアルタイムに把握でき、コミュニケーションがスムーズになります。その結果、合成した化合物をスクリーニングして、そのSAR解析の考察から新たな化合物を合成するという創薬研究のサイクルをスピードアップできます。 製薬企業とバイオベンチャーあるいは大学や公的研究機関の共同研究にも適しています。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • その他 研究用ソフトウェア
  • 文書・データ管理

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化学情報システム構築ツール Daylight

化学情報を効率よくハンドリング!理想的な化学情報システムを構築するためのツールをご提供します。

Daylight社のソフトウェア群は、in-silico創薬および化学情報管理システムを構築するための開発用ツールです。 化合物・化学反応情報のデータベース登録・検索や、化合物に対する様々な操作を効率よく行えるよう設計されています。システムの規模に係わらず、プロジェクトや創薬戦略に応じた理想的な化学情報管理システムが構築できます。 ■データ処理ツール 独自のデータ形式で化学情報を高速に処理するコマンドラインプログラム ■データベースシステム 化学情報を効率的に扱えるように設計されたTHORシステムと高速検索を実現するMerlinシステム ■DayCart OracleまたはPostgreSQLデータベースに分子構造の取り扱い機能を追加 ■ツールキット Daylight製品の機能を組み込んだ独自プログラムをC言語/C++/FORTRANで開発するためのライブラリー ■ウェブサービス Daylight製品の機能を利用したウェブアプリケーションを構築するためのライブラリー ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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電子実験ノート『Scilligence ELN』

低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート

Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。

  • その他 研究用ソフトウェア
  • 文書・データ管理

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対話型 SBDD ツール『SeeSAR』

メディシナルケミストのための受容体ポケット中でのリード最適化ツール

『SeeSAR』は、滑らかで美しい 3D モデルにより、リガンド-受容体間の相互作用を理解し、リガンドの物性値やADMEプロパティを評価しながら、対話的に新規リガンドを設計できるソフトウェアです。 リガンド原子毎の結合自由エネルギー寄与を算出し色付け、ねじれ角の妥当性の検証、リガンドの物性値、ADMEプロパティ、ポケット中の原子の存在しない空間等を分子をマニュアルで編集しながらリアルタイムにモニタリングできます。 ドッキングシミュレーションによるリガンドの配置、フラグメント交換や付加によるリガンド候補の出力を組み合わせて、研究者にあらたなリガンド候補を提案をします。 【特長】 ■高速な結合自由エネルギー推算 ■容易な操作と理解しやすいインターフェース ■視覚的かつ即座にリガンド候補の優先順位を決定 ■ΔGや物性値の改善を支援 ■母核置換、フラグメント連結、フラグメント付加 ■ドッキングシミュレーション ■ADME予測機能 ■結晶構造を解析した二面角の妥当性チェック ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • その他組込み系(ソフト&ハード)

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力場開発・データベース 『Direct Force Field』

力場パラメータの問題を解決!高精度分子シミュレーション支援ソフトウェア

『Direct Force Field』は、”さまざまな分子シミュレーションソフトウェアに高精度な力場パラメータを提供すること”を目的に開発された製品です。 独自の手法によりパラメータの代用の問題を解決し、分子系に最適な力場パラメータをアサインすることが可能です。また、登録されている力場パラメータは、開発者のCOMPASS等の力場開発における経験と知識に基づいて、作成、検証されています。そのため、Direct Force Fieldでは現在考えられる最も高い精度を持つ力場パラメータが提供されています。

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量子化学計算ソフトウェア『Gaussian』

量子化学計算のデファクトスタンダード

『Gaussian』は、多種多様な分子・化学反応を解析・設計するための量子化学計算ソフトウェアです。最も有名で利用者の多い量子化学系さんソフトウェアで、分子設計・構造解析・化学反応解析などで多大な成果をもたらしています。 2017年はじめに、Gaussian 16(量子化学計算ソフトウェア)ならびGaussView 6がリリースされました。本リリースは約7年ぶりとなるメジャーバージョンアップです。

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量子化学計算ソフトウェア『Molpro』

電子相関の取り扱いに関する様々な計算機能を搭載した量子化学計算ソフトウェア

『Molpro』は、非経験的分子軌道計算ソフトウェアで、電子相関の精確かつ効率的な取り扱いに特長があります。 配置間相互作用法、クラスター展開法、多配置SCF法、多配置参照摂動法など電子相関の取り扱いに関する様々な計算機能を搭載しています。多配置波動関数を用いた計算手法に強みをもち、精確な励起状態波動関数を計算できますので、励起状態の研究に適しています。

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材料設計支援プラットフォーム『SciMAPS』

最適な材料設計をお手元に。

SciMAPS (Scienomics Materials And Processes Simulations)は、外部プログラムとの連携を前提とした、拡張性の高い設計思想を持つ材料設計支援プラットフォームです。SciMAPSは量子化学計算からメソスケール計算まで、時間的にも空間的にも異なるさまざまなスケールの計算科学手法に対応しています。SciMAPSには、使いやすいモデル構築機能、データ解析機能が標準装備され、大学や研究機関で開発された世界的に定評のある先進の計算プログラムを統一された操作で利用できます。SciMAPSが提供するプラットフォーム上では、高分子の物性の推算をはじめ、低分子や高分子の凝集状態や挙動の解析、分子反応の解析、固体・表面・界面の電子状態の解析等、さまざまな解析が行えます。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。

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量子化学計算ソフトウェア『TURBOMOLE』

励起状態の構造・プロパティを高速に算出!高速な量子化学計算ソフトウェア

『TURBOMOLE』は、非経験的量子化学計算ソフトウェアです。分子の光学スペクトルなどのプロパティ計算や触媒反応の解析などに用いられ、多くの成果をもたらしています。 時間依存密度汎関数法(TD-DFT)を用いて励起エネルギーの算出および励起状態の構造最適化を行うことが可能です。また、円二色性スペクトル(ECD)や励起状態構造の振動計算の機能も搭載されています。 当製品の高速なDFT計算機能により、比較的サイズの大きな分子の励起エネルギーや励起状態構造の最適化も取り扱うことができます。

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安全性評価プラットフォーム『ChemTunes&ToxGPS』

医薬品、化粧品、食品業界の化合物の毒性額研究、安全性研究に利用できます

モルシスの『ChemTunes & ToxGPS』は、化合物の安全性評価と リスク評価のためのプラットフォームです。 毒性・安全性に関連するデータベース(ChemTunes)と、知識ベースを 含む予測・ワークフロー(ToxGPS)を統合しています。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象としており、 化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができます。 【特長】 ■作用機序(MoA)に基づく QSAR モデル ■構造ルールベース・アラート ■データベース & 知識ベース ■アメリカ食品医薬品局(US FDA)で実績のあるリスク評価のアプローチ ■証拠の重み付け(WoE : Weight of Evidence)アウトカム ■関連性、信頼性、一貫性、再現性に優れたリードアクロス解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • データ検索ソフト
  • その他情報システム

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MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル(液滴、周期境界条件) ■スケッチャーツールからの分子のコピー&ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション

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MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

MOEを用いたStructure-Based Drug Design(SBDD)が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。 以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理(原子欠損の確認と修正) ■水素原子付加状態の決定 ■ポケット探索 ■フラグメント結合位置検索 ■結合部位中での分子設計 ■リガンド-受容体との相互作用解析 ■Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析 ■母核置換とのフラグメントベースの分子設計 ■3D-RISM法による溶媒解析 ■タンパク質表面解析 ■SBDDのためのプロジェクトデータ構築

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分子高速アラインメントツール『FlexS』

リガンドの結合様式の解析やバーチャルスクリーニングを行うBioSolveIT社製ツール

『FlexS』は、リガンド構造から予測されるファーマコフォアフィーチャーの 投影点をベースとして構造アラインメントを行い、妥当な重ね合わせ構造を 高速に求めるツールです。 また、高速なスクリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに 化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。 配置は、ファーマコフォアの投影点の一致(水素結合、イオン結合、疎水性相互作用)と vdW体積のオーバーラップに基づいてスコア化して評価します。 【特長】 ■リガンド分子対重ね合わせを平均2分/1アラインメント、早いものは数秒で行う ■分子のフレキシビリティの評価は環状構造の有無と合わせ、ねじれ角の評価を行う ■参照リガンドは剛体として評価 ■オプションモジュール:FlexS-C ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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ファジー類似構造検索ツール『FTrees』

類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール

『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造を探索することができ、Scaffold Hopping へ の適用(新規母核構造の発見)も可能です。 【特長】 ■典型的な化合物カタログに対する検索が標準的なPCを使って15秒程度で終了します ■フィンガープリントベースで類似度が低いと判断された化合物を、 FTrees記述子を用いたファジー検索では高い類似度でヒットします ■重ね合わされた構造から、共通の官能基(または異なる官能基)を明らかにします ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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リガンド-受容体相互作用 2 次元図『PoseView』

自動的にクオリティの高い図を作成!さまざまな画像フォーマットに対応します

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類(水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用)を分かりやすく 2 次元で表示することができます。 操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は 各種画像フォーマットで出力することが可能 。作成された図は、多くの 論文で活用され、Protein Data Bankの公式の相互作用図としても採用 されております。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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FBLDツール『ReCore』

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支援ツール

『ReCore』は、母核構造置換、フラグメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析

MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、 分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質-リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を支援します。 【Solvent Analysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド、受容体の各分子系を同時に処理 ■計算には水分子の相関を考慮 ■水分子だけでなく、イオンや疎水性原子の存在確率も可視化 ■長時間のシミュレーションが不要 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、ヒト化抗体の構築。抗原とのエピトープマッピングに対応。

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の 入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。 相補性決定領域(CDR)を自動認識して配列アラインメントを行い、 それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。 予測した抗体構造は、抗原との親和性、PPI解析、物性評価、エピトープマッピングなど様々な解析に利用できます。 【機能】 ■抗体データベース ■領域別のアノテーション ■抗体のための相同配列検索 ■抗体モデリング ■Ig 全長、fab、 Fv、sdAb、ヒト化抗体 ■表面パッチ解析 ■タンパク質ータンパク質ドッキング ■エピトープ・マッピング ■タンパク質の物性推算 ■ループ/リンカーモデリング ■MOE/webアプリケーション ■モデリングの自動化 カタログを刷新しました。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム

リガンドの結合様式を予測!より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現!

『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。 【特長】 ■化合物の配座を出力 ■様々な環状化合物に対しても適切な配座解析を行う ■配座の重複を除くことで計算の効率を上げる ■妥当な化合物の配置を効率的に発見 ■受容体ポケット内で化合物を構造最適化 ■Induced-Fit(誘導適合)にも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOE』ペプチド解析

ペプチドの解析、改変、構築を支援する多彩な機能で研究をサポートします

「MOE」はペプチド解析のための機能を多数搭載しております。 変異体解析として自動的な変異体モデルの構築と、各種物性値の推算などが可能です。 相互作用解析では、ドッキング計算によるペプチド-受容体複合体の構造 予測などが行えます。表面解析機能により分子表面の特徴づけも行えます。 配列を指定しペプチドを構築することも可能です。ペプチドの解析、 改変、構築を行える多彩な機能により研究をサポートします。 【特長】 ■ペプチド構築 ■変異体解析 ■相互作用解析 ■表面解析 ■構造解析 ■非天然アミノ酸(特殊アミノ酸)の構築/変異もサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOE』タンパク質変異体解析

バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を搭載

「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析(疎水性/電荷) ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOEsaic』SAR解析のためのウェブアプリケーション

実験研究者のための構造活性相関(SAR)解析アプリケーション。化合物と物性・活性との関係をウェブブラウザーを用いて解析。

『MOEsaic』は、SARデータを解析したり、トレンドの可視化、新しい仮想リード化合物、ドキュメント作成のためのMOE/webのアプリケーションです。 MMP解析とR-groupプロファイリング、新規構造デザインのためのスケッチ、プロパティ予測を特長としており、合理的なインターフェースによりプロパティ・クリフやフラグメントのSAR可搬性を素早く評価することが可能です。 【特長】 ■構造-活性、属性の関係の探索 ■SARデータとトレンドの可視化 ■部分構造探索と類似構造探索 ■R-groupのプロファイリングと解析 ■新規の仮想リガンドのデザイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『MOE 2016.08』新機能のご案内

タンパク質デザイン機能やタンパク質解析の為の様々な機能が搭載

「MOE 2016.08」には新規アプリケーションとして「MOEsaic」が追加 されました。Matched MolecularPair(MMP)解析やR-group 解析などの SAR 解析、分子設計、文書作成が行えるウェブアプリケーションです。 「MOEsaic」を用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 【MOEsaic 機能】 ■リガンド解析とSAR解析のためのWebアプリケーション ■部分構造と類似構造検索 ■R-group解析とプロファイリング ■Matched Molecular Pair解析(MMPs) ■新規バーチャルリガンドデザイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • ソフトウェア(ミドル・ドライバ・セキュリティ等)
  • その他解析
  • その他

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材料開発における研究情報管理(原材料/レシピ/実験結果/規格)

農薬・化粧品・機能性材料などの研究開発で必要とされる研究情報の統合管理!原材料とその配合条件、製品の規格と実験結果をまとめて管理

『CBIS』は研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポートといった文書など研究に関わる多様なデータを統合して管理できるウェブシステムです。 『CBIS』のレシピモジュールは、材料開発における原材料や添加剤およびその配合条件、製品に求められる規格と製品の実験結果を統合して管理します。農薬、化粧品、インク・トナー、機能性材料、食品添加物などさまざまな分野の研究開発で利用できます。 【特長】 ■情報の共有で研究開発を効率化  ・過去の研究情報を検索/閲覧  ・社内で研究情報を共有(属人化の回避、ノウハウの継承)  ・セキュリティーを確保した状態で共同研究先との情報共有 ■データの散在・散逸を防止  ・多様な種類の情報を1つのシステムで管理  ・関連するデータはクリックすることで表示  ・ファイルの内容で測定機器ファイルや実験データを検索 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

  • 文書・データ管理
  • プロジェクト管理
  • その他情報システム

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量子化学計算ソフトウェア『ADF2017』

TDDFT法による第二超分極率の計算が可能や二光子吸収の計算が可能に!

『ADF2017』は、30年以上の歴史を誇る密度汎関数法 (DFT) を用いた 量子化学計算ソフトウェア「ADF」の、2017年リリースバージョンです。 分子系では、通常の密度汎関数法(DFT)では記述の難しいd→dや、f→d遷移 の計算を可能にするLigand Field DFT法の搭載や、TDDFT法による第二超分 極率の計算、特に二光子吸収の計算ができるようになりました。 また、周期系では非平衡グリーン関数(NEGF)法を搭載により、二つの電極に はさまれた単一分子のバリスティック伝導の計算に対応しました。 【特長】 ■密度汎関数法 (DFT) を用いた量子化学計算ソフトウェア ■Ligand Field DFT法/非平衡グリーン関数(NEGF)法を搭載 ■TDDFT法による第二超分極率の計算が可能 ■二光子吸収の計算が可能 ■二つの電極にはさまれた単一分子のバリスティック伝導の計算に対応 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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対話型SBDDツール『SeeSAR 5.5』

リガンドの結合サイト予測機能で、結合親和性の評価まで一連の解析が可能に!

『SeeSAR 5.5』は、メディシナルケミストのために設計された、 独BioSolveIT社製リード化合物最適化ツールです。 当製品は、既知のリガンド結合部位内における原子や母核の置換による リガンド修飾や、リガンドの物性とADME特性の計算、受容体との結合親和性の 評価等を組み合わせてシームレスな分子設計を可能にします。 今回のバージョンアップでは、リガンドが結合する可能性のあるサイトの予測 が可能になったほか、リガンド構造とそのプロパティーを総合的に評価する ために、一覧表示が追加され、より迅速な解析が可能になりました。 【特長】 ■メディシナルケミストのために設計 ■シームレスな分子設計が可能 ■リガンドの結合サイト予測機能 ■受容体-リガンドの相互作用解析が可能 ■リガンドのタイル表示とプロパティーのレーダーチャートのサポート ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【CBIS技術情報】製剤研究における情報管理

多様なデータを統合管理!製剤研究における情報管理についてご紹介

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポート といった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できる ChemInnovation Software社製のウェブシステムです。 製剤研究においては、主剤や添加剤の配合成分に関連する情報をはじめ、 成分の混合比率、使用する機器情報、混合時の温度や時間といった処理条件、 製剤後の物性について、測定値、測定に使用した機器情報、測定条件などの 情報管理が可能です。 当製品は、柔軟なカスタマイズ性と優れたコストパフォーマンスで、 製剤研究の情報管理以外にも様々な分野の研究情報を管理することができます。 情報資産の有効活用をお考えの場合や管理にお困りのデータがありましたら、 お気軽にご相談ください。 【製剤研究における情報管理】 ■成分の管理 ■製薬情報の管理 ■物性情報の管理 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【CBIS技術資料】研究情報の共有

多様なデータを統合管理!CBISを活用した研究情報の共有についてご紹介

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポート といった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できる ChemInnovation Software社製のウェブシステムです。 当製品は複数ユーザーが同時に使用することができ、研究情報の共有に メリットを発揮します。ログインするだけで、閲覧・情報登録・編集が可能。 台帳の編集待ちなどが発生せず、作業効率が向上します。 また、ユーザーやグループへの権限付与が可能で、無用な情報変更を避けられ ます。「承認者のみ変更できる入力欄」なども設定でき、承認までシステム内 で完結することができます。 【CBISを活用した情報共有のメリット】 ■複数ユーザーの同時使用が可能 ■ログインするだけで、管理されている情報を閲覧可能 ■回覧に時間をかけなくて済む ■閲覧済みかどうかのチェックが可能 ■台帳の編集待ちなどが発生しない ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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安全性評価プラットフォーム『ChemTunes&ToxGPS』

予測結果を証拠の重み付けにより評価!全体の不確実性を最小限に抑える!

『ChemTunes&ToxGPS』は、化合物の安全性評価とリスク評価のための 毒性・安全性に関連するデータベース(ChemTunes)と、知識ベースの 予測・ワークフローシステム(ToxGPS)を統合したプラットフォームです。 QSARモデルとケモタイプ・アラートの両方の予測結果を証拠の重み付けにより 評価することで全体の不確実性を最小限に抑え、最終的な結果を予測します。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象としており、 化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができます。 【特長】 ■「ChemTunes」と「ToxGPS」を統合したプラットフォーム ■化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができる ■予測結果を証拠の重み付けにより評価することで全体の不確実性を  最小限に抑える ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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創薬支援ツール『CoLibri 3.0』

Windowsに対応!KNIMEと連携することで利便性が向上!

『CoLibri』は、反応式をもとにフラグメントライブラリーを作成する、 独BioSolveIT社製の創薬支援ツールです。 ライブラリーは化学反応式をもとに作成されるため、より現実的なバーチャル 化合物を得ることができます。 「バージョン3.0」では、対応OSとしてWindowsが加わり、反応式の定義、 フラグメントライブラリーの出力、生成物のバーチャルライブラリーの出力 処理がWindows上のワークフローツールKNIMEでもできるようになり、 利便性が向上しました。 【特長】 ■Windowsに対応 ■反応式をもとにユーザー独自のフラグメントライブラリーを構築 ■より現実的なバーチャル化合物を得ることが可能に ■KNIMEと連携することでライトユーザーも利用可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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熱力学物性推算ソフトウェア『COSMOtherm』

Ver. C30では推算精度と計算速度が向上!純物質の引火点予測などが可能に

『COSMOtherm』は、物性推算法COSMO-RS法を用いた熱力学物性推算ソフト ウェアです。任意の化合物や混合溶液の蒸気圧・分配係数など様々な平衡 物性を推算可能です。 使用するCOSMO-RS法は量子化学計算で得られる分子の表面電荷情報と 分子統計力学に基づき、溶液中の分子の化学ポテンシャルを算出し、得られた 化学ポテンシャルを用いて、様々な平衡熱力学物性を算出します。 オプションとして、種々の溶媒分子を含む4000種類以上の有機化合物の 電荷分布データを収めたデータベースCOSMObaseも用意されていますので、 量子化学計算の手間を省くことも可能です。 【特長(Ver. C30 Release 17.01)】 ■純物質および混合物の引火点予測 ■臨界定数予測、ならびに状態方程式(EOS)との連携機能 ■液液平衡(LLE)予測における熱的ゆらぎに対する理論的補正 ■既存機能の改善や改良が図られ、推算精度と計算速度が向上 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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創薬支援ツール『FTrees 3』

バージョンアップで計算が高速化!グラフィックスの向上も!

「FTrees」は、既知の活性化合物と類似した構造をデータベースの中から 検索する、独BioSolveIT社製創薬支援ツールです。 官能基の物理化学的特徴とその結合の繋がりからクエリー分子を木構造で 表現し、類似する構造を高速に見出します。トポロジーを保持した検索が行え、 合成研究者が経験的に類似していると判断する構造が探索できます。 バージョンアップした『FTrees 3』では、プログラム内部を根本的に見直し、 高速化を実現したほか、グラフィックスの向上により類似構造の差異が わかりやすくなりました。 【特長】 ■クエリー分子を木構造(Feature Tree)で表現 ■トポロジーを保持した検索が可能 ■計算の高速化 ■グラフィックスの向上 ■KNIMEノードを提供するすることで、FTrees利用の可能性が拡大 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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