ウェーブフロントの製品ラインアップ

『BIOVIA Discovery Studio』は、医薬品・医療機器業界向けの分子の 3Dモデリングとシミュレーションを行えるソフトウェアです。 作用機序を原子レベルまで掘り下げて調べる事ができ、タンパク質の 微妙な差異を調べ、創薬ターゲット同定からリード最適化まで 行うことができます。 モデリング・シミュレーション機能に加え、データベースを用いた スクリーニングや品質予測の機能も備えた創薬・医療機器開発向けの 包括的ツールです。 単体でのご利用はもちろん、他に取り扱いをしているBIOVIAラボ管理 ソリューションとの連携機能がございます。それにより、創薬にラボ単位で 必要なソリューションを提供することが可能です。 ◎トライアル（試用） トライアル（試用）も実施しております。 詳しくは下記の「お問い合わせ」より、お気軽にお問い合わせ下さい！

タンパク質の立体構造(3D空間構造)は生理学的な機能と密接に 関連しています。この構造を解明することは、生物学的プロセスの 理解やライフサイエンス分野の課題解決に不可欠です。 タンパク質の構造決定には実験技術が一般的とされてきましたが、 1970年代には手作業による最適化、1990年代には計算設計、そして 現在はAI駆動型の手法が登場し、タンパク質の構造を予測することが 可能になっています。 弊社が取り扱っているタンパク質の分子モデリング/シミュレーションソフトウェア 「BIOVIA Discovery Studio」では、多様なタンパク質の構造予測が可能です。 タンパク質構造予測の具体的な技術内容など、コラムの詳細内容は、 下記のリンクより閲覧いただけます。是非ご覧ください。

BIOVIA DiscoveryStudioは般的なドッキングシミュレーションよりも複雑とされているタンパク質間ドッキングも簡単な操作で解析することが可能です。 以下の2つの操作を行うことで、解析を行います。 1.簡単なタンパク質間ドッキングを行い、複数の候補構造を生成・スコアリングします。 2.生成された候補構造をエネルギー計算に基づいて再スコアリングして絞り込みをします。 画像ではこの手順により、ウシ膵臓由来のβ-トリプシン（タンパク質受容体）とカボチャ種子由来の阻害剤CMTI-I（タンパク質リガンド）の複合体ドッキングを解析しています。 詳細な手順・技術的解説は以下の弊社の事例ページをご覧ください！ https://www.wavefront.co.jp/tech-blog/posts/docking-proteins.html

近年、創薬においてタンパク質の機能制御、探索などにおいて重要視されている機能性タンパク質バインダーですが、 その設計は非常に複雑であり、たとえ生成AIを用いたとしても容易ではありません。 しかしDiscovery Studioでは、 結合剤の構造と配列をオールインワンで自動設計することが可能です。 実行手順は至って簡単。 ・標的タンパク質の分子構造 ・相互作用部位の残基（特定の標的とした場合） ・設計したいバインダーの大きさ 上記3点を設定するだけです。 結合剤の構造と配列に関するデータはゼロから生成され、 設計の最小要件を満たす候補が探索されます。 更に発見された候補はスコア関数によって評価され、繰り返しスコアが良くなるよう改良され、 最終的に「望ましいパラメータセット」と「そのバインダーと標的の複合体構造」がスコアと共にリストアップされます。 詳細な技術的解説は以下の弊社の紹介ページをご覧ください！ https://www.wavefront.co.jp/tech-blog/posts/ai-assisted-design.html

タンパク質の立体構造(3D空間構造)は生理学的な機能と密接に関連しています。 「BIOVIA Discovery Studio」はこの構造をタンパク質のアミノ酸配列から 立体構造を決定するホモロジーモデリングや、Alphafold、Openfoldを 用いたAIアシスト機能を用いて解明することが可能です。 また標的分子となるタンパク質と、薬剤分子の非共有結合相互作用、 結合安定性、立体構造変化、溶媒和などの解析には分子シミュレーションが 有用です。 「BIOVIA Discovery Studio」は、洗練された計算手法である 分子ドッキングシミュレーションなどの手法を用いてタンパク質複合体の 迅速な静的解析もできます。分子シミュレーションとタンパク質構造予測を 組み合わせる事で、タンパク質の作用機序を的確に解析することが可能です。 ◎トライアル(試用) 「BIOVIA Discovery Studio」はトライアル(試用)を実施しております。 詳しくは下記の「Webからお問い合わせ」より、お気軽にお問い合わせ下さい。

「BIOVIA Discovery Studio」は、タンパク質や低分子などの3D分子構造を コンピュータ上でモデリング・解析し、構造ベース創薬を支援する 分子モデリング・シミュレーションソフトウェアです。 タンパク質のアミノ酸配列から立体構造を予測するホモロジーモデリングを はじめ、AlphaFold2やOpenFoldを用いたAIベースのタンパク質構造予測にも 対応しています。 また、予測したタンパク質構造を用いて、分子動力学シミュレーションや 分子ドッキングシミュレーションを実施し、標的タンパク質と薬剤分子の 非共有結合相互作用、結合安定性、立体構造変化、溶媒和などを 解析することが可能です。 【特長】 ■インシリコ創薬に必要な幅広い解析手法を利用可能 ■ホモロジーモデリングに加えAIを活用した構造予測にも対応 ■予測したタンパク質構造を起点とした多角的な解析を支援 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせください。

タンパク質間ドッキング（Protein-Protein Docking：PPD）によるタンパク質複合体の構造モデリングについて紹介いたします。 タンパク質間ドッキングでは、相互作用するタンパク質の立体構造から、複合体を形成する可能性のある結合ポーズを探索します。 「BIOVIA Discovery Studio」では、 ZDOCKによる高速なドッキングポーズの探索・評価と、RDOCKによる構造の精緻化・再評価を実行可能。 UI画面から一連の解析を操作でき、タンパク質間相互作用（PPI）の解析、抗体・抗原相互作用の研究、 創薬研究などに活用できます。 タンパク質複合体の構造予測・解析や、分子間相互作用の理解にご活用いただけます。 【特長】 ■インシリコ創薬に必要な幅広い解析手法を利用可能 ■ホモロジーモデリングに加え、AIを活用したタンパク質構造予測にも対応 ■予測したタンパク質構造を起点に、ドッキングなど多角的な解析を支援 ■ZDOCK・RDOCKによるタンパク質間ドッキングと複合体構造モデリングに対応 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせください。

「BIOVIA Discovery Studio」は、創薬・ライフサイエンス研究における分子モデリングやシミュレーションを支援する統合型ソフトウェアです。生成AIを活用したタンパク質結合剤（Protein Binders）の自動設計にも対応しています。 「Design Protein Binders」では、RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold2などのAI技術を統合し、 標的タンパク質に結合する新規タンパク質の構造・配列をデノボ設計。 標的やホットスポット、結合剤のサイズを指定し、3DEXPERIENCEクラウド上のGPUリソースを利用して自動設計を実行できます。 生成候補はpLDDT、PAE、iPAE、RMSDなどで評価でき、タンパク質間相互作用や構造安定性などの解析にも対応します。 【特長】 ■生成AIによるタンパク質構造・配列のデノボ設計 ■RFdiffusion・ProteinMPNN・AlphaFold2を統合 ■タンパク質結合剤の構造・配列をオールインワンで設計 ■設計候補のスコアリングやPPI解析に対応 ※詳しくはお気軽にお問い合わせください。