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最終更新日:2025年11月09日

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タンパク質構造予測ソフトAlphaFold2推奨モデル

AlphaFold2は、Google DeepMindが開発したAIベースのタンパク質構造予測モデルで、アミノ酸配列から高精度な立体構造を予測します。 従来のX線結晶解析やクライオ電子顕微鏡に比べ、時間・コストを大幅に削減できる点が革新的です。 2020年のCASP14で圧倒的な精度を示し、タンパク質の約3分の2でGDTスコア90以上を達成。 深層学習を活用し、進化的情報や既知の構造データを統合して予測精度を向上。 2021年にはソースコードが公開され、誰でも利用可能に1。創薬、疾患メカニズムの解明、環境科学など多分野で活用が進んでいます。

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基本情報

■CPU:Intel Xeon W5-2545 12コア24スレッド3.5~4.7GHz ■メモリ:256GB(64GB x4)DDR5-6400 ■SSD1: 1TB M.2 NVMe SSD R:7250MB/s W:6900MB/s ■SSD2:4TB M.2NVMe SSD R:7000MB/sW:6700MB/s ■OS:Ubuntu 22.04 LTS ■GPU:NVIDIA RTX 5000Ada 32GB GDDR6 ECC ■3年間センドバック保証

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AlphaFold2/バイオ・インフォマティクス

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