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短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析
外来DNAが目的位置も含め、ランダムにホストゲノムへ挿入（ランダムインテグレーション）された位置を決定することが可能です。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定に利用できます。 Tail-PCRやLAM-PCR、サザンブロットなどの従来のトランスジーン挿入位置決定法に比べて、短時間、簡便、高感度、低コストでの解析を実現します。
マウスやゼブラフィッシュ等の組織片、培養細胞ペレット等からDNA抽出、PCR、変異検出を行います。
大規模スクリーニングや1検体ごとの詳細解析等、ご要望に合わせた解析が可能です。検体数や解析内容に合わせてお見積りいたします。
COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施した事例をご紹介します！※解析事例集進呈中
当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った 各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “野生生物の食性解析”の例では、MiSeqを用いた解析で腸内細菌叢の 解析と同様にPCR産物を直接解析。 具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコード オブライフ・イニシャチブで動物のバーコーディングに用いられている COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を行います。 【事例概要】 ■MiSeqを用いた解析では腸内細菌叢の解析と同様にPCR産物を直接解析 ■具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、 COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定を、短時間・高感度・低コストで実現。
『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。 少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、 創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、 ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、 外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。 【特長】 ■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能 ■一度の解析で複数の挿入部位を検出可能 ■独自技術により再現性の高い結果が得られる 【解析事例】 ◎HTLV-1（ヒトT細胞白血病ウイルス）クロナリティ解析 少ないDNA量で素早く検出できるRAISING法の特長を活かし、 プロウイルス量0.032％でも高い検出感度を実現しています。 ◎ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出 CRISPR/Casで作製したノックインマウスについて、NGSとの組み合わせにより ノックイン効率とオフターゲットサイトの検出を行いました。 ※事例やサービスの詳細は「ダウンロード」から資料をご覧ください。
通常10,000程度のデータと、マイナーなグループのデータが得られる事例をご紹介！
当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った 各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “細菌叢の解析”の例では、PCR産物を解析対象として直接塩基配列を 決定し、通常10,000程度はデータが得られます。 さらに、クローンライブラリー法では得ることが非常に難しかった マイナーなグループのデータを得ることができます。 【事例概要】 ■PCR産物を解析対象として直接塩基配列を決定 ■得られる塩基配列のデータは通常10,000を超える ■マイナーなグループのデータが得られる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
次世代シーケンス解析の基礎知識・メリットを解説！具体的な解析事例も多数ご紹介※解析事例集進呈中
これから次世代シーケンス解析を検討されたい方に向けて、 具体的な解析事例を多数紹介した資料をダウンロードいただけます。 また実際の解析データや関連サービスを本資料内のリンクから閲覧する事も出来、 よりイメージしていただけ易い内容となっております。 ★下記「PDFダウンロード」ボタンより、資料をダウンロードいただけます。 〈掲載内容※一部抜粋〉 ■次世代シーケンス解析ってどんなメリットがあるの？ ■どんなサンプルを調べる事ができるの？ ■どういったデータが得られるの？ 当社ではお客様の目的に沿った各種プランを設けており、またご要望に応じたご提案を心がけております。 ご興味をお持ちいただけた方はお気軽にお問い合わせください。
