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株式会社モルシス

設立平成28年12月5日
資本金3000万
従業員数21名
住所東京都中央区八丁堀三丁目19番9号 ジオ八丁堀7階
電話03-3553-8030
  • 特設サイト
  • 公式サイト
最終更新日:2024/08/19
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ケーススタディ

ケーススタディ

弊社取扱いソフトウェアの応用事例やどのようなシーンに活用できるかを紹介します。

MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

MOEを用いたStructure-Based Drug Design(SBDD)が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。 以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理(原子欠損の確認と修正) ■水素原子付加状態の決定 ■ポケット探索 ■フラグメント結合位置検索 ■結合部位中での分子設計 ■リガンド-受容体との相互作用解析 ■Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析 ■母核置換とのフラグメントベースの分子設計 ■3D-RISM法による溶媒解析 ■タンパク質表面解析 ■SBDDのためのプロジェクトデータ構築

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材料開発における研究情報管理(原材料/レシピ/実験結果/規格)

農薬・化粧品・機能性材料などの研究開発で必要とされる研究情報の統合管理!原材料とその配合条件、製品の規格と実験結果をまとめて管理

『CBIS』は研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポートといった文書など研究に関わる多様なデータを統合して管理できるウェブシステムです。 『CBIS』のレシピモジュールは、材料開発における原材料や添加剤およびその配合条件、製品に求められる規格と製品の実験結果を統合して管理します。農薬、化粧品、インク・トナー、機能性材料、食品添加物などさまざまな分野の研究開発で利用できます。 【特長】 ■情報の共有で研究開発を効率化  ・過去の研究情報を検索/閲覧  ・社内で研究情報を共有(属人化の回避、ノウハウの継承)  ・セキュリティーを確保した状態で共同研究先との情報共有 ■データの散在・散逸を防止  ・多様な種類の情報を1つのシステムで管理  ・関連するデータはクリックすることで表示  ・ファイルの内容で測定機器ファイルや実験データを検索 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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デュピルマブの潜在的な新規適応症の同定

GENEVESTIGATORを使ったプラットフォーム横断的な遺伝子発現解析によりデュピルマブの新規適応症の可能性を検討

Nebion社のPhilip Zimmermann、Jana Sponarova、Frank Staubliは、同社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、IL-4Rαに対するモノクローナル抗体で阻害剤として働くデュピルマブの発現パターンを解析しました。 『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 このケーススタディの概要は以下の通りです。 ■類似の発現応答をもたらす実験条件の特定 ■潜在的な新規適応症の特定 ■他の解剖学的部位における発現 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル(液滴、周期境界条件) ■スケッチャーツールからの分子のコピー&ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション

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熱力学物性推算ソフト『COSMOtherm』※適用事例集進呈

化合物、混合溶液などの幅広い物性予測を実現。医薬品・製剤プロセス等の各種設計に

『COSMOtherm』は、気液・液液・固液平衡、酸解離定数、反応平衡定数、 イオン液体の各種プロパティ等の「熱力学物性」を予測するソフトウェアです。 COSMO-RS法により、分子の構造情報から直接、熱力学物性を推算し 特殊な仮定を用いず、有限希釈・無限希釈の両方を高精度に予測できます。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。 ★さらに、適用事例集をプレゼント中です★ (下記「ダウンロード」ボタンからご覧いただけます。) 【事例集の内容】 ■気液平衡推算 (蒸気圧推算、2成分系気液平衡、臨界点近傍の気液平衡推算) ■液液平衡推算 (2成分系・3成分系の液液平衡、3成分3相平衡推算) ■固液平衡推算 (相対溶解度による溶媒スクリーニング、2成分固液平衡推算) ※詳しくは資料をご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。

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力場計算支援ソフトウエア『Direct Force Field』

材料科学、生命科学向け力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により力場計算の問題を解決

「力場パラメータが足りなくて計算できない」、「化学的に誤った構造を結果として与える」、これらは、分子シミュレーションソフトウェアに付属する力場パラメータを利用して計算を行うと、しばしば直面する問題です。 Direct Force Fieldは、開発元の提供する高精度な力場パラメータを登録した力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により、力場パラメータの問題を解決します。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。

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熱力学物性推算ソフト『COSMOtherm』共結晶スクリーニング

化合物、混合溶液などの幅広い物性予測を実現。医薬品・製剤プロセス等の各種設計に

『COSMOtherm』は、気液・液液・固液平衡、酸解離定数、反応平衡定数、 イオン液体の各種プロパティ等の「熱力学物性」を予測するソフトウェアです。 COSMO-RS法により、分子の構造情報から直接、熱力学物性を推算し 特殊な仮定を用いず、有限希釈・無限希釈の両方を高精度に予測できます。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。 ★共結晶スクリーニングに関する適用事例集を公開中です★ (下記「ダウンロード」ボタンからご覧いただけます。) ※詳しくは資料をご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。

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GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの遺伝子発現解析の結果を統合してPCSK9遺伝子の機能を解析

Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生物種での発現変動の特性を明らかにしました。また、PCSK9遺伝子と共発現する遺伝子を同定しています。 『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 このケーススタディの概要は以下の通りです。 ■遺伝子の機能解析と適応症の研究 ■モデル生物の選択 ■遺伝子のネットワーク解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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RNA-seqデータ解析 ユーイング肉腫の解析事例

Partek社製ソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアライメントからパスウェイを使った生物学的解釈まで実行

 Partek社はNGSデータ解析ソフトウェアPartek Flow、NGS/マイクロアレイデータ解析ソフトウェアPartek Genomics Suite、パスウェイ解析ソフトウェアPartek Pathwayをリリースしています。これらのソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアラインメントからパスウェイを使った生物学的解釈まですべてサポートします。  Partek FlowはFASTQファイルを読み込んで、アラインメント前後のQA/QC、参照ゲノム配列へのアラインメント、発現量の定量および正規化、遺伝子発現解析、選択的スプライシング解析、主成分分析や階層型クラスタリング、GOやパスウェイを使った生物学的解釈、ゲノムビューアーによる可視化などRNA-seqのデータ解析全般をサポートします。  Partek Genomics SuiteはBAMファイルを読み込んで、遺伝子発現解析、選択的スプライシング解析に加えてアリル特異的発現解析、コーディング領域のSNV解析をサポートします。  Partek PathwayはKEGGパスウェイ情報を使ったパスウェイ解析をサポートします。

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【書籍発刊】「MOE」を用いた創薬研究の効率化 ※抜刷進呈中

in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例としてCCG社の統合計算化学システム「MOE」の特長と事例を紹介

株式会社技術情報協会から2018年1月31日に「in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術」が発刊されました。 本書には、コンピュータの処理能力の速さを活かしつつ、計算コスト増大の課題をいかに克服するか?という課題についてin silico創薬を成功に導く計算科学やスパコン、データベース構築の重要技術が満載されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。 第4章「in silico創薬におけるソフトウェア活用の具体例」の第2節で「MOE」を用いた創薬研究の効率化について紹介されています。本節はMOEの特長とMOEを利用した創薬研究の効率化の事例について詳しく説明しています。特にMOEが持つ多彩な機能の中から特にバーチャル・スクリーニングに焦点を絞り、解析事例も交えながら、MOEの機能を紹介しています。 本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい! 「PDFダウンロード」からはMOEのカタログをダウンロードできます。

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インシリコ創薬技術の資料進呈

創薬研究書籍の抜刷記事を配布中!

『MOE』は、創薬・生命科学研究のための分子モデリング、シミュレーションソフトウェアです。 直観的に操作できる多彩なアプリケーションと豊富なデータコンテンツで、 計算化学者から実験研究者まで、幅広いユーザーの研究をサポートします。 国内外で多くの導入実績があり、分子シミュレーション、ケモインフォマティクス、 タンパク質・抗体・ペプチドモデリング、立体構造に基づく分子設計、 ファーマコフォア解析など様々な機能を搭載。 現在『MOE』の特長・事例が紹介された書籍 『in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術(注1)』 の抜刷資料を進呈中。 「お問い合わせ」より「抜刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。 ※製品の詳細は『PDFダウンロード』よりカタログをご覧ください。

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【技術情報】DFFとSciMAPSによる二次電池用電解質の検討

軽量化、高安全性、高耐久性などを実現する電解質材料の開発が重要となっています!

当資料では、DFFとSciMAPSによる二次電池用電解質の検討について ご紹介しております。 「SciMAPSによる物性推算」をはじめに「DFFの力場」、「計算手順」など 図とともに詳しく掲載。 計算結果についても記載されておりますので、ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■SciMAPSによる物性推算 ■DFFの力場 ■計算対象 ■計算手順 ■計算結果 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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