【その他の特長】 ■Exact マッチ（完全一致）とSemi-exact マッチ（部分完全一致）による構造検索 ■MOE アプリケーションとシームレスに連携 ■2D-Scaffold Hopping ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他の掲載内容】 ■量子化学計算インターフェースの強化 ■MOEsaicの機能強化 ■ファーマコフォア検索の機能強化 ■その他の機能強化 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

リガンドの結合様式を予測するドッキングシミュレーションは、テンプレート、共有結合、電子密度、ファーマコフォアを考慮した結合部位への配置が可能です。リガンドの形状によりタンパク質を動かすInduced-Fitに対応しています。 Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析により活性・不活性を判別する相互作用を見いだせます。 受容体の適切な前処理として、PDBデータにおける原子欠損部位の確認と修正、イオン化やトートマーを考慮した水素原子付加状態の決定を行えます。受容体構造からポケット検索は、リガンド結合傾向によるポケットのランク付けが可能です。 結合部位でのリガンド設計は、置換基が付加可能な位置や、分子量やlogP、変異原性の有無などのリガンド特性、ドッキングスコアを評価しながら対話的な分子編集が可能です。 母核置換やフラグメント付加・変換などにより新規リガンド候補を探索できます。フラグメントは150万件以上の構造データを標準で搭載しています。 開発元のウェブページもあわせてご参照ください。 https://www.chemcomp.com/

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【その他の特徴 】 ■高解像度の PDB データ 50 件をテストセットとして 86％以上で X 線結晶構造を再現 ■様々な分子系に適用可能（タンパク質-低分子、タンパク質-ペプチド、 タンパク質-糖、DNA-低分子など） ■ファーマコフォア、部分構造の位置拘束によるポケットへの配置 ■受容体ポケットが不明な場合は、探索された全ポケットについて網羅的 なドッキングが可能 ■化合物や受容体の全体もしくは受容体の一部を剛体とした構造最適化計算 ■MOE/smp による並列計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

MOEは、計算化学者やメディシナルケミスト、バイオロジストなどの様々なユーザーに利用されている分子モデリングソフトウェアです。 低分子、受容体構造、複合体構造などユーザーが持つ実験的な知見に基づき、柔軟かつ適切なアプローチでの分子設計が可能です。LBDD的なアプローチであればSAR解析やファーマコフォア解析、SBDD的なアプローチであればドッキングシミュレーションやフラグメント創薬など、目的にあわせた利用が可能です。 ユーザーフレンドリーなインターフェースを搭載し、初心者でも自由に操作ができます。MOEに搭載されていないアプリケーションは、新規追加も可能で、ユーザーに応じたメニュー編集も可能です。 NAMD, KINIME, Gaussian, GAMESS, MOPAC, Mogul, FlexX、Gold等のサードパーティ製品とMOEを連携させて利用できます。 医薬品開発では、低分子、中分子、抗体など様々な医薬品の設計にMOEは応用されています。 開発元のウェブページもあわせてご参照ください。 https://www.chemcomp.com/

【Solvent Analysis による解析】 ■結合部位内の水分子、Na+、Cl-、疎水性原子の存在確率の高い領域を可視化 ■酸素原子、水素原子を独立して評価することで水分子の配向を予測 ■分子系に接している水分子の隣の水分子についても可視化 ■脱水和エネルギーマップによる、水素結合や疎水性相互作用、水分子を 　介した水素結合ブリッジの理解を支援 ■複合体、リガンド、受容体の各エネルギーマップの比較による 　リガンドの修正もしくは保存すべき原子団の判別 ■Water Siteの予測と水分子の配置 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他の特長】 ■相互作用解析 ■核酸-タンパク質ドッキング ■物性推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【MOEを用いたワークフロー例】 ■化合物処理 ■AutoQuaSAR ■ドッキングシミュレーション ■ファーマコフォア ■タンパク質デザイン ■抗体モデリング　など ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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MOE 抗体アプリケーション例 ★抗体モデリング 　・領域(FR、CDR)ごとのテンプレート検索 　・各タイプのモデリング 　Fv, Fab, F(ab’), rIg, Ig, VHH, VLL, 二重特異性抗体(bispecific抗体)、 一本鎖抗体(scFv)、ADC(Antibody-drug conjugate)、ヒト化抗体 ・ループモデリング/リンカーモデリング(scFv) ★抗体設計 　・アラニンスキャン, システインスキャン, 変異体スキャン 　・バーチャルファージディスプレイ 　・非天然アミノ酸の導入 　・リガンドとの親和性予測 　・分子表面特性 ★タンパク質間相互作用解析 (PPI解析) 　・相互作用検出 　・疎水性/電荷表面パッチ解析 　・タンパク質-タンパク質ドッキング 　・エピトープマッピング ★Developability の評価 　・化学的修飾部位の検出 　・pHや構造変化を考慮した物性推算 　・熱安定性、溶解性、粘度 ★その他 　・溶媒解析 　・分子シミュレーション、分子動力学計算

【掲載内容】 ■はじめに ■MOE ■MOEにおける分子構造データ解析 ■各種分子構造データベースと活用事例 ■おわりに ※詳しくは、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他の掲載内容】 ■Reagentタブ ■Productsタブ ■データの出力 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他掲載内容】 ■GPUによる計算の高速化 ■抗体モデリング機能の強化 ■ウェブベースのコンビナトリアルライブラリーの生成 ■MOEsaicでのドッキング計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他の掲載内容】 ■ハイスループットスクリーニング（HTS）に向けたドッキングの最適化 ■タンパク質のLiabilityに関する記述子の追加 ■抗体モデリング関連機能の強化 ■MOEsaicのアップデート ■新しいMOEプロジェクトデータベース ■その他の機能強化 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他の新機能】 ■ファミリーデータベース ■セキュリティーの向上 ■ウェブブラウザーのサポート ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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クラウド型電子実験ノート Scilligence ELN の主な特長 ■モダリティ 　低分子化合物や核酸情報、ペプチドなどの中分子、抗体などの生物学的製剤や抗体薬物複合体（ADC）を共通のプラットフォームで扱えます。低分子から核酸やペプチドなど高分子までシームレスに取り扱える描画ツールHELM Web Editor (*) を内蔵しています。 　*HELM: モノマーを表す文字列を連結して高分子を表現する表記法 ■多様なテンプレート 　実験の種類に応じて多様なテンプレートが利用できます。各テンプレートでは入力項目が定められており、実験データを過不足なく記録できます。 　カスタマイズで新しいテンプレートを追加することも可能です。 ■導入が容易で費用も手頃なクラウドシステム 　アマゾンウェブサービス（AWS）などのクラウド上にシステムを構築します。サーバーの維持管理の手間をかけず、安定した運用ができます。セキュリティやバックアップなどのクラウドサービスの機能を利用できます。 　複数の事業所や社外の共同研究先からもアクセス可能です。物理的な場所を超えて研究情報を共有して活用できます。

【特長】 ■研究における情報管理の効率化とコスト削減 ■情報共有によるアイデアの創出と協業の活性化 ■データの散逸や不整合の防止 ■必要な情報への容易なアクセス ■優れたインターフェース 【動作環境（サーバー）】 CBISは物理サーバー／仮想サーバー、クラウド環境など多様なサーバー環境でご利用いただけます。 ■CPU：Intel Xeon相当、2コア以上 ■メモリ：8GB以上 ■HDD：1GB以上の空き（プログラムのみ） ■OS：Windows Server 2012以降 ■データベース：SQL Server 2012以降 【動作環境（クライアント）】 CBISはウェブシステムなので、ユーザーは利用するパソコンに専用ソフトウェアをインストールする必要はありません。 ■OS：Windows 7以降 ■ウェブブラウザー：Internet Explorer 11以降 【ライセンス形態】 CBISはモジュールごとの年間ライセンスです。使用するユーザー数によってライセンス費用は変わりません。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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プロプロテイン変換酵素サブチリジン／ケキシン9型(PCSK9)は血漿中のコレステロールの恒常性の調節に対して極めて重要な酵素です。それは低比重リポタンパク質(LDL)受容体パスウェイおよび肝臓でのLDLの分解の天然阻害剤として働きます。 GENEVESTIGATORを使った詳細な解析によりPCSK9の発現は栄養状態およびスタチン治療により直接間接の両方で調節されていることが確かめられました。さらに、PCSK9の恒常性は炎症性大腸炎や消化管癌のような消化管の疾患で変動しています。脂肪酸代謝に関連するいくつかの遺伝子が主な共発現する遺伝子として確認されました。 最後に、我々の解析結果はPCSK9が気管支上皮細胞で高発現しておりこの組織で主要な役割を果たしている可能性があることを示しています。