※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

リガンドの結合様式を予測するドッキングシミュレーションは、テンプレート、共有結合、電子密度、ファーマコフォアを考慮した結合部位への配置が可能です。リガンドの形状によりタンパク質を動かすInduced-Fitに対応しています。 Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析により活性・不活性を判別する相互作用を見いだせます。 受容体の適切な前処理として、PDBデータにおける原子欠損部位の確認と修正、イオン化やトートマーを考慮した水素原子付加状態の決定を行えます。受容体構造からポケット検索は、リガンド結合傾向によるポケットのランク付けが可能です。 結合部位でのリガンド設計は、置換基が付加可能な位置や、分子量やlogP、変異原性の有無などのリガンド特性、ドッキングスコアを評価しながら対話的な分子編集が可能です。 母核置換やフラグメント付加・変換などにより新規リガンド候補を探索できます。フラグメントは150万件以上の構造データを標準で搭載しています。 開発元のウェブページもあわせてご参照ください。 https://www.chemcomp.com/

【対応プラットフォーム】 ■Windows ■Linux x86 32bit / 64bit ■MacOS X

【対応プラットフォーム】 ■Windows ■Linux x86 32bit / 64bit ■MacOS X

【対応プラットフォーム】 ■Windows ■Linux x86 32bit / 64bit ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【対応プラットフォーム】 ■Windows ■Linux x86 32bit / 64bit (SeeSAR に統合されたReCore はMacOS X からもご利用いただけます) ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【基本機能】 ■蒸気圧の計算、沸点の計算、溶解度の計算、ガス溶解度の計算、 　活量係数の計算 ■Henry定数の計算、分配係数（log P）の計算、酸解離定数（pKa）の計算 ■多成分系2相平衡の計算、密度・粘度の計算、類似度の計算 ■界面張力・界面自由エネルギーの計算、反応平衡定数・ 　反応自由エネルギーの計算 ■高分子溶融状態への対応、イオン液体の各種プロパティの計算 ■メソスケールパラメータの計算、スクリーニング機能　など ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他の新機能】 ■ファミリーデータベース ■セキュリティーの向上 ■ウェブブラウザーのサポート ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他のバージョンアップ内容】 ＜機能改善＞ ■Hartree-FockおよびDFT 計算におけるGPU 計算への対応 ■多くのCPUを使用した並列計算の効率改善 ■CCSD 計算時のI/O 負荷軽減のためのメモリーアルゴリズムの最適化 ■構造最適化アルゴリズムGEDIISの改良 ■大きなActive space[>(10,10)]を用いたCASSCF 計算の効率改善 ＜標準設定の変更＞ ■積分精度の初期設定を10-10から10-12へ高精度化 ■DFTのグリッドをFineGirdからUltraFineに変更 ■メモリーの使用量が800MB（100MW）になり、多くのメモリーを確保 ■TD-DFT 計算において、解析的二次微分がデフォルトになり計算が高速化 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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Scilligence 社製ソフトウェアは、無償でトライアル利用可能です。 トライアルをご希望の方はお問い合わせ下さい。 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他の特徴 】 ■高解像度の PDB データ 50 件をテストセットとして 86％以上で X 線結晶構造を再現 ■様々な分子系に適用可能（タンパク質-低分子、タンパク質-ペプチド、 タンパク質-糖、DNA-低分子など） ■ファーマコフォア、部分構造の位置拘束によるポケットへの配置 ■受容体ポケットが不明な場合は、探索された全ポケットについて網羅的 なドッキングが可能 ■化合物や受容体の全体もしくは受容体の一部を剛体とした構造最適化計算 ■MOE/smp による並列計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【Solvent Analysis による解析】 ■結合部位内の水分子、Na+、Cl-、疎水性原子の存在確率の高い領域を可視化 ■酸素原子、水素原子を独立して評価することで水分子の配向を予測 ■分子系に接している水分子の隣の水分子についても可視化 ■脱水和エネルギーマップによる、水素結合や疎水性相互作用、水分子を 　介した水素結合ブリッジの理解を支援 ■複合体、リガンド、受容体の各エネルギーマップの比較による 　リガンドの修正もしくは保存すべき原子団の判別 ■Water Siteの予測と水分子の配置 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

MOEは、計算化学者やメディシナルケミスト、バイオロジストなどの様々なユーザーに利用されている分子モデリングソフトウェアです。 低分子、受容体構造、複合体構造などユーザーが持つ実験的な知見に基づき、柔軟かつ適切なアプローチでの分子設計が可能です。LBDD的なアプローチであればSAR解析やファーマコフォア解析、SBDD的なアプローチであればドッキングシミュレーションやフラグメント創薬など、目的にあわせた利用が可能です。 ユーザーフレンドリーなインターフェースを搭載し、初心者でも自由に操作ができます。MOEに搭載されていないアプリケーションは、新規追加も可能で、ユーザーに応じたメニュー編集も可能です。 NAMD, KINIME, Gaussian, GAMESS, MOPAC, Mogul, FlexX、Gold等のサードパーティ製品とMOEを連携させて利用できます。 医薬品開発では、低分子、中分子、抗体など様々な医薬品の設計にMOEは応用されています。 開発元のウェブページもあわせてご参照ください。 https://www.chemcomp.com/

〇　誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 〇　直感的で操作しやすいGUI 〇　処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 〇　多くの創薬研究のためのノードを用意 〇　ケムインフォマティクス、データマイニングなど 〇　ユーザー独自の新規ノード開発も可能

MOEは、計算化学者やメディシナルケミスト、バイオロジストなどの様々なユーザーに利用されている分子モデリングソフトウェアです。 低分子、受容体構造、複合体構造などユーザーが持つ実験的な知見に基づき、柔軟かつ適切なアプローチでの分子設計が可能です。LBDD的なアプローチであればSAR解析やファーマコフォア解析、SBDD的なアプローチであればドッキングシミュレーションやフラグメント創薬など、目的にあわせた利用が可能です。 ユーザーフレンドリーなインターフェースを搭載し、初心者でも自由に操作ができます。MOEに搭載されていないアプリケーションは、新規追加も可能で、ユーザーに応じたメニュー編集も可能です。 NAMD, KINIME, Gaussian, GAMESS, MOPAC, Mogul, FlexX, Gold等のサードパーティ製品とMOEを連携させて利用できます。 医薬品開発では、低分子、中分子、抗体など様々な医薬品の設計にMOEは応用されています。 開発元のウェブページもあわせてご参照ください。 https://www.chemcomp.com/

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開発元からは、MOEのクラウドコンピューティングへの応用と最新機能のエピトープマッピングを紹介。 ユーザーからは、MOEを活用した様々な応用事例を紹介。 当日の資料をご希望の方はご連絡ください。 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【その他新たな収載データ】 ■TCGAデータの追加収載 ■GTExデータの新規収載 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【機能】 ■検索 　・高速なテキスト検索 　・タンパク質／抗体アミノ酸配列検索 　・類似ポケット構造検索 　・3D相互作用検索 　・化合物部分構造・類似構造検索 ■タンパク質立体構造の重ね合わせ 　・タンパク質立体構造全体の重ね合わせ 　・ポケット類似性による重ね合わせ 　・リガンド構造による重ね合わせ 　・重ね合わせ構造における相互作用の比較 　・重ね合わせ構造のMOEへの読み込み ■データ表示 　・リガンド結合部位の2D/3D表示 　・電子密度図の描画 　・タンパク質立体構造のヘルスチェック 　・タンパク質機能部位のアノテーション 　・アミノ酸配列のアノテーション ■データ更新とバージョンコントロール 　・PDBデータの自動更新 　・in-houseデータの簡単な登録 　・コメントフォーラム ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【特長】 ■膨大な遺伝子発現データ ■高速な検索エンジン ■使いやすいインターフェース ■マニュアルキュレーション ■高品質なデータ ■データの正規化 ■定期的なデータ更新 ■あらゆるマシンで使用可能 【主な対応プラットフォーム：（例）ヒト】 ■Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 ■Illumina RNA-seq (HiSeq 2000/2500, GA II) ■Affymetrix Human Genome U133A ■Affymetrix Human Gene 1.0 ST ■Affymetrix miRNA 1.0 HS ■LINCS L1000 Level 3 ■Agilent Whole Human Genome 4×44K ■Illumina HumanHT-12 V3.0 【動作環境】 ■Windows (64bit) ■Linux (64bit) ■MacOS X ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【特長】 ■優れたユーザーインターフェース ■充実したデータ解析機能 ■多彩なデータ表示機能 ■複数のユーザーが同時にどこからでも利用可能 【対応ファイル形式】 FASTQ / FASTA / SFF / CSFASTQ / CSFASTA / QUAL / SRA / BCF / VCF / BAM / SAM 【動作環境：サーバー】 ■OS：Red Hat, CentOS, Fedora, Ubuntu (64bit) 　　　 Mac OS X 10.10以降 ■CPU：2GHz以上、4コア以上 (STARを使用する場合は16コア以上を推奨) ■メモリ：32GB以上 (STARを使用する場合は38GB以上を推奨) ■ディスク：150MB以上の空き領域 (インストールのみ) ■その他(推奨)：インターネット接続環境 【動作環境：サーバー】 ■ウェブブラウザー：Google Chrome ■その他(推奨)：インターネット接続環境1280×1024pixel以上のモニタ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【対応プラットフォーム】 ■推奨 OS: Windows 7 / 8 / 10、 Mac OSX 10.11 以降、 　　　　　 Linux x86 32bit / 64bit ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【各システムの主な機能】 ■ChemTunes 毒性データベース ・ エンドポイント固有の包括的な安全評価とリスク評価に関連する情報を収載 ・安全率、暴露幅、参照用量、無毒性量、一日摂取許容量、不確実係数、標的部位、 　重大影響、規制機関、年を含む安全性評価指標 ・専門家によるデータの信頼性と品質スコア　など ■ToxGPS 予測システム ・グローバルおよびローカルの作用機序モデルによるQSARの結果 ・重症度スコアを含むケモタイプ・アラート（構造知識ベース） ・ワークフローによるリードアクロス解析 ・ChemTunes の毒性データベースへリンク　 ■ヒト代謝物予測システム ・ルールベースの代謝物の予測と優先順位付け ・親化合物と代謝物の構造を可視化 ・ChemTunes & ToxGPSとシームレスに統合 ・ヒトの第１相と第２相の代謝物を生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他の特長】 ■ChemTunes ・規制機関や毒性学のデータ・ソースから構築されたデータベースを搭載 ・専門家により品質管理されたin vitroおよびin vivoの毒性情報 ■ToxGPS ・ヒトの健康と規制関連の一連のエンドポイントに対する予測・ 　ワークフローシステム ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【抗体モデリングと解析機能】 ■重鎖と軽鎖の配列からの抗体の自動モデリング ■各領域(Fv, Fab, F(ab)2, rIg, Ig)のモデリング ■単一ドメイン抗体(VHH, VLL)、一本鎖抗体(scFv)、ヒト化抗体、 　バイスペシフィック抗体のモデリング ■抗原―抗体複合体モデリング ■抗体薬物複合体(ADC)や 糖鎖修飾の検討 ■複数の配列を入力とした連続計算 ■バックミューテーション解析 ■配列と構造に基づいたLiabilityの検出 ■溶媒和を考慮した相互作用エネルギー(GBVI)や 　重鎖-軽鎖間の相互作用エネルギーによるモデル評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他の特長】 ■Exact マッチ（完全一致）とSemi-exact マッチ（部分完全一致）による構造検索 ■MOE アプリケーションとシームレスに連携 ■2D-Scaffold Hopping ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他の特長】 ■相互作用解析 ■核酸-タンパク質ドッキング ■物性推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他改良点】 ■芳香族環に結合したメトキシ基を同一平面上に拘束 ■読み込みデータ区切り文字（タブ、スペース等）指定 ■SDファイル出力時に入力SMILESあるいは指定したカラムのデータをコメント行に挿入 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【対応プラットフォーム】 ■Windows 64bit ■Linux x86 64bit ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【その他の特長】 ■受容体が持つ相互作用点を満足するように化合物を配置 ■水素結合、配位結合、疎水相互作用等に対応 ■毎分数分子のドッキングを行うことができる ■複数コアを指定した並列計算に対応 ■ファーマコフォアを用いてドッキングポーズを絞れる ■水素結合ドナー/アクセプター、疎水性、環構造等、様々なファーマコフォアに対応 ■受容体構造の前処理やファーマコフォア拘束等の準備は 　別モジュールのSeeSARを用いて簡単にできる ■当製品によるドッキングシミュレーションの結果をSeeSARに読み込み、 　結合自由エネルギー Hydeスコア2を用いてドッキングポーズのリスコアリングが可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【対応ケミカルスペース】 ■Enamine REAL Space ■GalaXi ■KnowledgeSpace ■インハウスライブラリー ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【対応プラットフォーム】 ■Windows、Linux x86 32bit/64bit ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

【対応プラットフォーム】 ■Windows 64bit ■Linux x86 64bit ■Mac OS X 64bit（メインメモリー 4GB以上必要） ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。