「MOE 2016.08」には新規アプリケーションとして「MOEsaic」が追加 されました。Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group 解析などの SAR 解析、分子設計、文書作成が行えるウェブアプリケーションです。 「MOEsaic」を用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 【MOEsaic 機能】 ■リガンド解析とSAR解析のためのWebアプリケーション ■部分構造と類似構造検索 ■R-group解析とプロファイリング ■Matched Molecular Pair解析（MMPs） ■新規バーチャルリガンドデザイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

MOEを用いたStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。 以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正） ■水素原子付加状態の決定 ■ポケット探索 ■フラグメント結合位置検索 ■結合部位中での分子設計 ■リガンド-受容体との相互作用解析 ■Potein-Ligand Interaction Fingerprint解析 ■母核置換とのフラグメントベースの分子設計 ■3D-RISM法による溶媒解析 ■タンパク質表面解析 ■SBDDのためのプロジェクトデータ構築

『FlexS』は、リガンド構造から予測されるファーマコフォアフィーチャーの 投影点をベースとして構造アラインメントを行い、妥当な重ね合わせ構造を 高速に求めるツールです。 また、高速なスクリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに 化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。 配置は、ファーマコフォアの投影点の一致（水素結合、イオン結合、疎水性相互作用）と vdW体積のオーバーラップに基づいてスコア化して評価します。 【特長】 ■リガンド分子対重ね合わせを平均2分/1アラインメント、早いものは数秒で行う ■分子のフレキシビリティの評価は環状構造の有無と合わせ、ねじれ角の評価を行う ■参照リガンドは剛体として評価 ■オプションモジュール：FlexS-C ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造を探索することができ、Scaffold Hopping へ の適用（新規母核構造の発見）も可能です。 【特長】 ■典型的な化合物カタログに対する検索が標準的なPCを使って15秒程度で終了します ■フィンガープリントベースで類似度が低いと判断された化合物を、 FTrees記述子を用いたファジー検索では高い類似度でヒットします ■重ね合わされた構造から、共通の官能基（または異なる官能基）を明らかにします ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2 次元で表示することができます。 操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は 各種画像フォーマットで出力することが可能 。作成された図は、多くの 論文で活用され、Protein Data Bankの公式の相互作用図としても採用 されております。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『ReCore』は、母核構造置換、フラグメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『COSMOtherm』は、物性推算法COSMO-RS法を用いた熱力学物性推算ソフト ウェアです。任意の化合物や混合溶液の蒸気圧・分配係数など様々な平衡 物性を推算可能です。 使用するCOSMO-RS法は量子化学計算で得られる分子の表面電荷情報と 分子統計力学に基づき、溶液中の分子の化学ポテンシャルを算出し、得られた 化学ポテンシャルを用いて、様々な平衡熱力学物性を算出します。 オプションとして、種々の溶媒分子を含む4000種類以上の有機化合物の 電荷分布データを収めたデータベースCOSMObaseも用意されていますので、 量子化学計算の手間を省くことも可能です。 【特長（Ver. C30 Release 17.01）】 ■純物質および混合物の引火点予測 ■臨界定数予測、ならびに状態方程式（EOS）との連携機能 ■液液平衡（LLE）予測における熱的ゆらぎに対する理論的補正 ■既存機能の改善や改良が図られ、推算精度と計算速度が向上 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析を効率化します。 使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載しているため、 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の 同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【特長】 ■公共データベースの遺伝子発現データ ■専門家によるキュレート ■キュレーション済データベースと高速な検索エンジン ■強力で使いやすい解析ツール ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOEsaic』は、Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group解析などの SAR解析、分子設計、文書作成が行える「MOE 2016.08」のウェブアプリケーションです。 当アプリケーションを用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 指定した部分構造だけが異なる分子ペアの検索をはじめ、指定した構造変換に 対応する分子ペアを検索し、構造変換による特性値の変化確認や、母核と 置換基へのフラグメント化などを行うことが可能です。 【特長】 ■MMP検索 ■MMPプロファイル ■R-group分解 ■R-groupプロファイル ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析可能にします。 「乳がん特異的な発現パターンと逆相関を示す化合物」の解析では、 隣接正常組織と比較して乳がん組織で発現が有意に変動している遺伝子を検索。 疾患特異的な発現変動と逆相関を示す医薬品候補化合物を検索することで、 解析対象の疾患に有効性を示す可能性がある化合物を見出すことができます。 【特長】 ■遺伝子発現データをキュレート ■大量の実験結果を統合して解析可能 ■解析対象の疾患に有効性を示す可能性がある化合物を見出すことが可能に ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「PSILO」は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報の データベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの 共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの分散するタンパク質 立体構造データを統合し、ウェブベースのインターフェースから容易に 活用可能です。 2016年末にリリースされた『PSILO 2016.10』では、タンパク質結晶構造解析 で利用されるCootを直接起動できるようになったほか、レコード表示に クオリティーサマリーを追加、構造因子(F)、σA 値(D)、fi gure of merit値(m) を利用した2mFo-DFcやmFo-DFcマップの計算が可能になるなどの機能が追加されました。 【新機能】 ■レコード表示（Cootの起動） ■クオリティーサマリー表示 ■電子密度マップ表示 ■検索（2Dスケッチャー、リガンド類似度ソート） ■3D構造検索結果の重ね合わせ ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「Gaussian」は、世界的に広く利用され、分子設計・構造解析・化学反応解析 などで、多大な成果をもたらしている量子化学計算ソフトウェアです。 メジャーバージョンアップ版『Gaussian16』では、励起状態の取り扱いや スペクトル計算における新機能や、計算速度向上を図る機能が追加されました。 時間依存密度汎関数法（TD-DFT）を用いた解析的振動計算により、IR・Raman スペクトル、遷移状態構造の最適化とIRC 計算が可能になったほか、 Hartree-FockおよびDFT計算におけるGPU計算へ対応しています。 【新機能】 ■時間依存密度汎関数法（TD-DFT)を用いた解析的振動計算 ■振動スペクトルの非調和項の考慮 ■分子振動準位を考慮した電子円偏光スペクトル、共鳴ラマンスペクトルの計算 ■EOM-CC法による構造最適化 ■新しいDFT汎関数（M08HX, MN15, MN15L） ■新しい半経験的手法（PM7） ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOE（Molecular Operating Environment）』は、カナダCCG社が独自に開発したSVL（Scientific Vector Language）を搭載する統合計算化学 システムです。 使いやすいインターフェイス、ソースコード公開の豊富なアプリケーション、目的に応じて使い分けできる複数の使用モード、柔軟なライセンス形態により幅広い分野の研究者のニーズに答えることのできるソフトウェアです。 CoMFAに基づき自動的に3D-QSARモデルの構築を行うMOEのアドオンプログラム「AutoGPA」では、三次元記述子として、新たに水素結合のドナー／アクセプターや芳香環のファーマコフォア、部分電荷、LogP、モル屈折などの幅広い特性を用いたCoMSIA法をサポートします。 【特長（AutoGPAのCoMSIA法）】 ■多様な物理化学的特性を3D-QSAR式に含める ■3D-QSAR 式の各特性の係数の大きさと位置から、物理化学的な特性を予測 ■CoMFA法と比較して、より具体的な特性の予測が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

Scilligence社製『RegMol』は、分子情報およびアッセイデータ登録システムです。 RegMolでは低分子から高分子まで様々な種類の分子の情報を登録できます。 例えば、RegMolにペプチドを登録する場合、プロジェクトや構造式、CAS 番号などの外部ID、名前、純度やLogPなどの物性情報、治療領域や標的タンパク質、電子実験ノートのページ番号、( 購入試薬の場合は) メーカー名やカタログ番号および購入日、NMRやHPLCなどのスペクトル、添付ファイルなどを登録します。また、RegMolに既に登録された分子と関連付けてネットワークを登録することもできます。 【Scilligence 社製ソフトウェアの特長】 ■低分子からペプチドや核酸などの中分子、抗体や抗体薬物複合体(ADC)などの高分子まで1つのプラットフォームで扱える ■HELM (Hierarchical Editing Language forMacromolecules)表記に対応 ■居室や実験室などにあるどのパソコンからも利用可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「MOE」はペプチド解析のための機能を多数搭載しております。 変異体解析として自動的な変異体モデルの構築と、各種物性値の推算などが可能です。 相互作用解析では、ドッキング計算によるペプチド-受容体複合体の構造 予測などが行えます。表面解析機能により分子表面の特徴づけも行えます。 配列を指定しペプチドを構築することも可能です。ペプチドの解析、 改変、構築を行える多彩な機能により研究をサポートします。 【特長】 ■ペプチド構築 ■変異体解析 ■相互作用解析 ■表面解析 ■構造解析 ■非天然アミノ酸（特殊アミノ酸）の構築/変異もサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOEsaic』は、SARデータを解析したり、トレンドの可視化、新しい仮想リード化合物、ドキュメント作成のためのMOE/webのアプリケーションです。 MMP解析とR-groupプロファイリング、新規構造デザインのためのスケッチ、プロパティ予測を特長としており、合理的なインターフェースによりプロパティ・クリフやフラグメントのSAR可搬性を素早く評価することが可能です。 【特長】 ■構造-活性、属性の関係の探索 ■SARデータとトレンドの可視化 ■部分構造探索と類似構造探索 ■R-groupのプロファイリングと解析 ■新規の仮想リガンドのデザイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析（疎水性/電荷） ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。 【特長】 ■化合物の配座を出力 ■様々な環状化合物に対しても適切な配座解析を行う ■配座の重複を除くことで計算の効率を上げる ■妥当な化合物の配置を効率的に発見 ■受容体ポケット内で化合物を構造最適化 ■Induced-Fit（誘導適合）にも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、 分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を支援します。 【Solvent Analysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド、受容体の各分子系を同時に処理 ■計算には水分子の相関を考慮 ■水分子だけでなく、イオンや疎水性原子の存在確率も可視化 ■長時間のシミュレーションが不要 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル（液滴、周期境界条件） ■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション

KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。 ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。 プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。 MOEノードと、既存のデータマイニングやマシンラーニング（機械学習）などのノード、サードパーティ製品のノードも自由に組み合わせることができ柔軟なワークフローの設計が可能になります。

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分けできる使用モード ■低分子・フラグメント・標的タンパク質データベース ■新機能開発やカスタマイズ ■サードパーティ製品との連携 ■Windows/Mac/Linuxに対応 ■計算化学者、実験研究者が広く利用 ■医薬、農薬、食品、材料設計などの様々な分野に対応 【搭載アプリケーション】 ■分子モデリング ■配座解析・分子動力学計算・量子化学計算 ■ドッキングシミュレーション ■構造活性相関・ケモインフォマティクス ■タンパク質・抗体モデリング ■変異体構築・タンパク質/ペプチドデザイン ■核酸モデリング ■ファーマコフォア解析 ■フラグメント構造に基づく分子設計

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の 入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。 相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメントを行い、 それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。 予測した抗体構造は、抗原との親和性、PPI解析、物性評価、エピトープマッピングなど様々な解析に利用できます。 【機能】 ■抗体データベース ■領域別のアノテーション ■抗体のための相同配列検索 ■抗体モデリング ■Ig 全長、fab、 Fv、sdAb、ヒト化抗体 ■表面パッチ解析 ■タンパク質ータンパク質ドッキング ■エピトープ・マッピング ■タンパク質の物性推算 ■ループ/リンカーモデリング ■MOE/webアプリケーション ■モデリングの自動化 カタログを刷新しました。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOEフォーラム2017』では、開発元からMOEの最新技術の講演、5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して講演いただきました。 【開発元講演】 ■Prediction of Protein-Protein Binding Sites and Epitope Mapping ■Optimizing Protein Properties in the Cloud with MOE 【招待講演】 ■「創薬等研究推進に向けたタンパク質の大規模情報解析」 ■「Structure-based drug designの手法を活用した創薬シード創成」 ■「創薬研究におけるSupervised Molecular Dynamicsの有用性検証」 ■「タンパク質間相互作用を誘導する有機小分子とその相互作用の 　解析法の開発」 ■「Integratedi n silico Strategy for Drug Discovery」 当日の資料をご希望の方はご連絡ください。 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOEフォーラム2018』では、医薬、農薬、化学、バイオ関連の企業、 研究機関、大学などから多くの研究者にご参加いただき、様々な 意見交換がなされました。 4名の先生方からはMOEの活用事例のご講演と、開発元のCCG社からは 次バージョンに搭載予定の新機能の紹介を行いました。 当社からは、実験研究者のためのMOE/webアプリケーションと その活用事例を紹介しました。 【招待講演】 ■創薬支援研究におけるインシリコ技術の活用事例の紹介 ■構造生物学解析が拓く、特徴的PPARγアゴニストへの合理的構造転換 ■分子設計におけるAI活用の動向と将来展望 ■硝化抑制剤の構造ベース創農薬 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア「Flow」を用いた DNA-seqデータ解析について紹介します。 「Partek Flow(Flow)」は、次世代シーケンサー（NGS）から出力された リード配列を読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータを解析することが可能です。 検出した変異のアノテーションや絞り込みや染色体ビューアーでの変異の表示など、 データ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【掲載内容】 ■DNA-seqとは ■SNVおよびIndelの検出 ■融合遺伝子の検出 ■コピー数変異の検出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『2-Gene Plot』は、同一プラットフォーム内で横断的に遺伝子発現を解析できる 「GENEVESTIGATOR」の解析ツールの一つであるSimilarity Search Toolsに 新たに追加された解析ツールです。 選択した2つの遺伝子の発現量をX軸とY軸にとることでサンプルの分布を 確認できます。 各サンプルはアノテーションにより色付けできるので、サンプルを 実験群ごとにクラスタリングすることで生物学的解釈が可能になります。 【特長】 ■Similarity Search Toolsに新たに追加された解析ツール ■2つの遺伝子の発現量をX軸とY軸にとることでサンプルの分布を確認可能 ■サンプルを実験群ごとにクラスタリングすることで生物学的解釈が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『PSILO』は、生体高分子やタンパク質－リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データ共有を支援します。 公共データやin-houseデータなどの分散するタンパク質立体構造データを統合し、ウェブベースの インターフェースから容易にアクセスすることができます。 【特長】 ■高速なテキスト検索 ■タンパク質／抗体アミノ酸配列検索 ■タンパク質立体構造全体の重ね合わせ ■リガンド結合部位の2D/3D表示 ■PDBデータの自動更新 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『GENEVESTIGATOR』は、GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種：biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌） 【対応生物種：plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イネ、コムギ、トウモロコシ、ソルガム、ヒメツリガネゴケ、ダイズ、ウマゴヤシ、トマト、タバコ、（酵母、大腸菌） 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【主な活用分野】 ■機能ゲノム科学 ■標的遺伝子の優先順位付け ■バイオマーカーの同定 ■発現変動遺伝子リストの解釈 ■遺伝子調節ネットワークの解析 ■実験計画の改善 ■ドラッグ・リポジショニング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 【対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq, Single Cell RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケンス解析（DNA-seq） ■転写因子結合部位解析（ChIP-seq） ■メチル化部位解析（MeDIP-seq） ■メタゲノム解析 【対応機器】 ■イルミナ（HiSeq, NextSeq, MiSeq, MiniSeq） ■サーモフィッシャー（Ion S5, Ion Proton, Ion PGM） 『Partek Flow』は、ウェブブラウザーから操作するのでコマンド入力したりパラメーターを手入力する必要はありません。インストールしたサーバーに接続可能なネットワーク上のあらゆるマシンから利用できます。読み込んだデータの種類に対応した解析メニューを表示しますので、データ解析に慣れていないウェットの研究者でも簡単に操作できます。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『SeeSAR』は、滑らかで美しい 3D モデルにより、リガンド-受容体間の相互作用を理解し、リガンドの物性値やADMEプロパティを評価しながら、対話的に新規リガンドを設計できるソフトウェアです。 リガンド原子毎の結合自由エネルギー寄与を算出し色付け、ねじれ角の妥当性の検証、リガンドの物性値、ADMEプロパティ、ポケット中の原子の存在しない空間等を分子をマニュアルで編集しながらリアルタイムにモニタリングできます。 ドッキングシミュレーションによるリガンドの配置、フラグメント交換や付加によるリガンド候補の出力を組み合わせて、研究者にあらたなリガンド候補を提案をします。 【特長】 ■高速な結合自由エネルギー推算 ■容易な操作と理解しやすいインターフェース ■視覚的かつ即座にリガンド候補の優先順位を決定 ■ΔGや物性値の改善を支援 ■母核置換、フラグメント連結、フラグメント付加 ■ドッキングシミュレーション ■ADME予測機能 ■結晶構造を解析した二面角の妥当性チェック ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

モルシスの『ChemTunes & ToxGPS』は、化合物の安全性評価と リスク評価のためのプラットフォームです。 毒性・安全性に関連するデータベース（ChemTunes）と、知識ベースを 含む予測・ワークフロー（ToxGPS）を統合しています。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象としており、 化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができます。 【特長】 ■作用機序（MoA）に基づく QSAR モデル ■構造ルールベース・アラート ■データベース & 知識ベース ■アメリカ食品医薬品局（US FDA）で実績のあるリスク評価のアプローチ ■証拠の重み付け（WoE : Weight of Evidence）アウトカム ■関連性、信頼性、一貫性、再現性に優れたリードアクロス解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『ChemTunes＆ToxGPS』は、化合物の安全性評価とリスク評価のための 毒性・安全性に関連するデータベース（ChemTunes）と、知識ベースの 予測・ワークフローシステム（ToxGPS）を統合したプラットフォームです。 QSARモデルとケモタイプ・アラートの両方の予測結果を証拠の重み付けにより 評価することで全体の不確実性を最小限に抑え、最終的な結果を予測します。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象としており、 化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができます。 【特長】 ■「ChemTunes」と「ToxGPS」を統合したプラットフォーム ■化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができる ■予測結果を証拠の重み付けにより評価することで全体の不確実性を 　最小限に抑える ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEの カスタムアプリケーションです。 抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、 配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行えます。 MOEの標準アプリケーションと組み合わせて、生物学的製剤の開発における 問題や課題をクリアにし、in-silicoを用いた合理的な分子設計が可能です。 【特長】 ■バイオ医薬品開発のためのカスタムアプリケーション ■従来のMOEのメニューにBio-MOEメニューを新規に追加し使用 ■より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行える ■生物学的製剤の開発における問題や課題をクリア ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOE-QFSS』は、複数の巨大な化合物ライブラリーから、高速かつ横断的に 構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 リレーショナルデータベースを使用することなく、ユーザーはMOEのみで 高速な分子構造検索が可能です。 高速な化合物検索を通して、分子設計やバーチャルスクリーニングの現場を 強力に支援します。 【特長】 ■部分構造の超高速検索 ■類似構造検索に対応 ■分子記述子フィルター ■化合物ライブラリーの追加 ■連続検索に対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOE』は、柔軟な核酸モデリングが可能です。 二本鎖および一本鎖核酸を容易にモデリングでき、修飾核酸にも対応。 塩基配列のセンス、アンチセンス表示や塩基配列のアライメント、 核酸構造の重ね合わせも可能です。 また、構築した核酸の物性推算や、ドッキング計算による核酸-タンパク 質複合体の構造予測ができます。 核酸の配列・立体構造・相互作用・物性を相互に関連付けて 解析することで、核酸創薬の現場を強力に支援します。 【特長】 ■核酸の構築、伸長、修正のための専用パネルを搭載 ■核酸用パラメーターの改良 ■一本鎖および二本鎖の構築、伸長、編集 ■アンチセンス対応 ■核酸のアライメント・重ね合わせ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『CORINA Classic 4.2.0』は、低分子量から中分子量までの有機化合物の 三次元分子構造を生成するソフトウェアの新バージョンです。 経験的手法を用いることで高速かつ高精度な三次元化を実現します。 新バージョンでは、アトロプ異性体発生機能の追加や大環状化合物の取り扱いの 見直し、計算速度と変換率の向上、読み込みデータ区切り文字の指定を はじめとするファイルI/Oに関するオプション追加などの改良が行われています。 【特長】 ■アトロプ異性体発生機能の追加 ■大環状化合物の取り扱いの見直し ■計算速度と変換率の向上 ■ファイルI/Oに関するオプション追加 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、ChemInnovation Software 社製の『CBIS』の製品概要を紹介。 『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献や レポートといった文書など研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数の導入実績があり、柔軟なカスタマイズ性と優れたコスト パフォーマンスで高い評価をいただいております。 【掲載概要】 ■CBISとは ■CBISの構成 ■モジュールの例 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、リードアクロスによる安全性評価についてを紹介しております。 『ChemTunes ＆ ToxGPS』は、毒性・安全性情報のデータベース「ChemTunes」と、毒性の予測およびワークフローを含む知識ベース「ToxGPS」から成る化合物の安全性評価とリスク評価のための統合プラットフォームです。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象とし、 化合物の毒性学、安全性学研究全般で利用することができます。 【掲載概要】 ■ChemTunes ＆ ToxGPS Version 3.0 ■ToxGPS Read-Across ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、『Partek Flow 8.0』の新機能を紹介しております。 『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータの解析から解析結果の 可視化までを行います。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインターフェース （GUI）上でパラメーターを選択しコマンドを実行。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析が専門でない実験研究者まで 幅広くご利用いただけます。 【掲載概要】 ■Partek Flowの製品概要 ■擬時間解析 ■UMAP プロットによる次元削減 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『CoLibri』は、反応式をもとにフラグメントライブラリーと バーチャルライブラリーを作成するツールです。 ライブラリーは化学反応式に基づいて作成されるため、 より現実的なバーチャル化合物を得ることが可能。 サードパーティとの連携に優れた、BioSolveIT社のソフトウェアです。 【特長】 ■化学反応に基づき試薬構造の一部を反応点で置き換えたフラグメント 　ライブラリーとフラグメント同士をつなげるルールの情報を出力 ■もとになる化合物は、試薬ベンダーから提供される試薬データベースを 　用いることができる ■試薬データベース内で指定した化学反応に適合する化合物が自動的に選択 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『FlexX』は、タンパク質のリガンド結合部位に、医薬候補化合物を フラグメント単位で配置することで高速に化合物のドッキング構造を 予測するプログラムです。 結合部位に化合物群を順次配置しリガンド候補を絞り込むバーチャル スクリーニングや、リガンド-受容体間の相互作用解析に利用できます。 【特長】 ■多様な分子系に対応 ■高速ドッキング ■ファーマコフォアフィルター ■SeeSARとの連携 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『infiniSee』は、既存の化合物ライブラリーあるいは、10^20個を超える バーチャル化合物群の中より類似構造を高速に探索するソフトウェアです。 新規構造、SAR展開、特許を回避した構造など、目的に応じた候補構造を 簡単な操作で発見できます。 創薬における加速化と低コスト化を実現します。 【特長】 ■超高速ケミカルスペースナビゲーション 　分単位で10^20構造を探索 ■容易なスキャフォールドホッピング 　FTreesFSアルゴリズムを用いた構造構築 ■構造類似性の可視化 　分かりやすい表示による候補構造の決定 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 （水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。 得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。 【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成 ■相互作用しているアミノ酸の種類や原子などを分かりやすく2次元で表示 ■操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ ■作成された図は、Protein Data Bankの公式の相互作用図として採用されている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『REAL Space Navigator』は、Enamine社における110億構造におよぶ バーチャル化合物群の中からクエリー化合物に類似の構造を 高速に探索するツールです。 ヒットした構造は同社により実際に合成できる可能性が高く、ユーザーは スキャフォールドホッピングされた新規化合物をオンデマンドに入手可能。 当製品による検索は、BioSolveIT社のFTrees-FSの類似構造構築手法に 基づいて行われます。 【特長】 ■110億通りのバーチャル化合物の中から、まだ発見されていない 　新規リガンド候補を超高速に探索 ■クエリー化合物が持つ化学的な特長とその2次元的な位置が類似する 　構造を簡単かつ効率的に得ることができる ■ヒット構造をEnamine社に合成依頼が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。