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株式会社モルシス

設立平成28年12月5日
資本金3000万
従業員数21名
住所東京都中央区八丁堀三丁目19番9号 ジオ八丁堀7階
電話03-3553-8030
  • 特設サイト
  • 公式サイト
最終更新日:2024/08/19
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マテリアルサイエンス系ソフトウェア マテリアルサイエンス系ソフトウェア
研究データ管理システム 研究データ管理システム
ケーススタディ(マテリアルサイエンス) ケーススタディ(マテリアルサイエンス)
ケーススタディ(ライフサイエンス) ケーススタディ(ライフサイエンス)
ケーススタディ ケーススタディ
ライフサイエンス系ソフトウェア

ライフサイエンス系ソフトウェア

当社では、分子シミュレーションやデータの可視化と解析を行う計算化学ソフトウェアを中心に実験データ解析用ソフトウェアなどを提供しています。

MOE-Extensions for KNIME

簡単かつ柔軟なワークフロー作成!KNIMEで動作するMOEインターフェイス

『MOE-Extensions for KNIME』は、MOEをワークフローツール 「KNIME」上で使用するためのインターフェイスです。 当製品を利用することで、化合物や受容体構造の前処理、 ドッキング、FBDD、ファーマコフォア検索などのMOEによる 連続的な処理を容易に定義できます。 【特長】 ■誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 ■プログラミング不要で作業を自動化 ■処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 ■創薬研究のための多数のノードを提供 ■KNIMEの他ノードとの連携が容易(機械学習等) ■ユーザーオリジナルノードの作成が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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アプリケーション『PROTAC Modeling Tools』

PROTACを介した三元複合体構造の予測とモデリングを容易に行えます

『PROTAC Modeling Tools』は、標的タンパク質分解誘導薬(PROTAC)の 開発を支援するためのMOEのカスタムアプリケーションです。 三元複合体(標的タンパク質-PROTAC-E3リガーゼ)の構造の予測と モデリングを容易に行えます。 タンパク質間の衝突や接触を表すスコアにより適切なモデルを選別できます。 当製品は保守契約中であれば無償で入手でき、また、アプリケーションの 使用にトークンを追加する必要はありません。 【特長】 ■PROTAC開発用アプリケーション ■三元複合体構造の予測とモデリングを容易に行える ■タンパク質間の衝突や接触を表すスコアにより適切なモデルを選別できる ■アプリケーションの使用にトークンを追加する必要がない ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術資料】Flowによるメタゲノム解析

コマンドによる操作は不要!Flowを用いたメタゲノム解析についてご紹介しております

『Partek Flow』は次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq、ChIP-seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインターフェース 上で選択できるので、コマンドによる操作を必要としません。 当資料では、Flowを用いたメタゲノム解析についてご紹介しております。 【掲載内容】 ■メタゲノム解析とは ■系統解析 ■α多様性解析・β多様性解析 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術資料】MOEsaic機能紹介

MMP解析機能とカスタムプロパティーモデルBOILED-Eggの導入事例をご紹介!

『MOEsaic』は、構造活性相関/構造物性相関解析を行うための MOE/web アプリケーションです。 Matched Molecular Pairs解析やR-group解析等の合成研究者に使用頻度の 高い機能を統合しており、母核・置換基と活性・物性の関係を分かり やすくまとめ、ウェブブラウザー上に可視化。 当資料では、MOEsaicに搭載されているMMP解析機能とカスタムプロパティー モデルBOILED-Egg の導入事例をご紹介いたします。 【掲載内容】 ■MOE/web ■MOEsaic概要 ■MMP Profileによるマジックメチル効果の探索 ■Interesting MMPによるActivity Cliffの探索 ■カスタムプロパティーモデル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【資料】高速ドッキングツール FlexX4 リリース

【新製品情報】ドッキングツールFlexXがバージョンアップし、FlexX 4としてリリースされました!

独 BioSolveIT社製ドッキングツールFlexXがバージョンアップし、 FlexX 4としてリリースされました。 FlexX 4では今までのバージョンから完全にコードを書き直し、効率的な 並列処理が可能になりました。 SBDD統合ツールSeeSARとの統合版とコマンドライン版の2種類が利用可能。 当資料ではFlexX4の新機能およびSeeSARとの統合版とコマンドライン版 について説明します。 【掲載内容】 ■FlexX4の概要 ■FlexX4の新機能 ■SeeSAR統合版FlexX4 ■コマンドライン版FlexX4 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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トランスレーショナルリサーチにおける医薬品安全性情報の活用

【技術資料】医薬品開発に携わる研究者や部門においてご活用いただける趣旨を掲載!

トランスレーショナルリサーチでは、前臨床研究の成果を臨床研究に 効率的に橋渡しすることと同時に、市販後の安全性の監視で得られた 情報を新たな治療薬の開発にフィードバックすることが求められます。 当資料では、医薬品開発に携わる研究者やさまざまな部門において、 それぞれの目的に応じてご活用いただける趣旨を掲載しております。 【掲載内容】 ■生物学研究者および情報生物学研究者 ■メディシナルケミストおよび情報化学研究者 ■毒性学・安全性薬理学研究者 ■臨床開発研究者 ■レギュラトリーサイエンス ■ファーマコビジランス ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術資料】レシピ管理機能による配合研究データの管理

配合研究における情報管理や研究情報共有システム導入メリットについてをご紹介!

ChemInnovationSoftware社製の、Chemical and Biological Information System は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポートといった 文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できるwebシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れたコスト パフォーマンスで高い評価をいただいております。 当資料では、複数の原料を組み合わせて目的の性質の複合材料や混合物質を 設計する配合研究で用いられるレシピ管理機能を紹介いたします。 【掲載内容】 ■配合研究における情報管理 ■研究情報共有システム導入メリット ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術資料】MOE のHLA 解析アプリケーションの紹介

統合計算化学システム「HLA-Modeler」「HLABAP」の概要と特長および解析例をご紹介

ヒト白血球型抗原(HLA)の立体構造は細胞性免疫の分子機構を解明する ために重要な分子です。 当社では、MOE上で動作するHLAに特化したホモロジーモデリングツール 「HLA-Modeler」とHLA 結合抗原性ペプチド予測ツール「HLABAP」を 開発しました。 「HLA-Modeler」は、構造未知のHLA の立体構造を既知のHLAの構造を参照し 予測。「HLABAP」はHLA に結合する任意のペプチドの結合強度を予測し、 親和性の高いペプチド配列を提案します。 当資料では、これらのツールの概要と特長および解析例について説明します。 【掲載内容】 ■HLA-Modeler の概要 ■HLA-Modeler の特長 ■HLABAP の概要 ■HLABAP の特長 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】遺伝子発現データベース GENEVESTIGATOR

データのキュレーションや製品概要、「Dimension Reduction Tool」についてご紹介!

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析が可能。 また、当ツールは使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを 搭載しているため、研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を 行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを 簡単かつ正確に行うことができます。 当資料ではデータのキュレーションや製品概要、また新しく追加された 「DimensionReduction Tool」について紹介します。 【掲載内容】 ■遺伝子発現データのキュレーション ■GENEVESTIGATOR の製品概要 ■Dimension Reduction Tool ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】TouchMol4Officeの機能

研究情報管理統合プラットフォーム「Scilligence」と連携で効率的な研究が可能!

米国Scilligence 社製『TouchMol4Office』は、Microsoft Office への プラグインです。 Microsoft Officeの各ソフトウェア内で化学的・生物学的機能を用いて 構造情報を含む研究データを整理することができ、研究データの解析や レポート作成を容易に行えます。 また、Scilligence ELN(電子実験ノート)などと連携して利用すること により研究を効率的に行えます。 当資料では、当製品の概要と機能についてご紹介します。 【掲載内容】 ■概要 ■機能 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】創薬支援ツールを用いたKNIME用ワークフロー

ノードを用いて作成されたリガンド設計に関する4種類のKNIME用ワークフローをご紹介!

『KNIME』は、データ分析やレポート作成を行うためのオープンソースの 統合プラットフォームです。 BioSolveIT社は、創薬支援ツールを当製品上で実行するためのノード群を 無償で提供。 当資料では、それらのノードを用いて作成されたリガンド設計に関する 4種類の当製品用ワークフローを紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■KNIME インターフェース ■BioSphere ワークフロー ■MedChemWizard ワークフロー ■FragXplorer ワークフロー ■REALizer ワークフロー ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】CBIS: 研究資材と在庫の管理

柔軟なカスタマイズ性と優れたコストパフォーマンス!CBISの研究資材・在庫管理機能をご紹介

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献や レポートといった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 当資料では、化合物・試薬や細胞株などの研究資材とその在庫情報を 当製品で管理するメリットについてご紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■研究資材の在庫管理の重要性 ■CBISによる研究資材の在庫管理 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【セミナー情報】MOEフォーラム2020 開催報告

統合計算化学システム!5名の先生方にMOEを活用した研究事例についてご講演いただきました

当資料では、日英同時通訳付きウェビナーとして開催した 「MOEフォーラム2020」の招待講演と開発元の講演を紹介します。 生命科学、創薬研究の分野の先端で活躍されている5名の先生方に MOEを活用した研究事例についてご講演いただきました。 また、開発元のCCG社からは、対話的なSAR解析が行える MOEウェブアプリケーションのMOEsaicの機能強化、タンパク質の 開発可能性や化学修飾部位予測にかかわる物性推算機能の応用事例、 次バージョンのMOEやPSILOの機能について発表しました。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■招待講演 ■Chemical Computing Group社講演 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】遺伝子発現データベース GENEVESTIGATOR

使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載!実験条件の検索例についてご紹介

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの 膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により 登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。 当資料では、遺伝子発現変動データの検索や、タンパク質ACE受容体の 発現レベルが高い実験条件の検索例についてご紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【特長】 ■コロナウイルス関連データの収載 ■SARS-CoV-2 感染による発現遺伝子 ■ACE2 受容体発現と実験条件 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】データ解析ソフトウェア Partek Flow

データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご利用可能!

『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-Seqや DNA-Seq、ChIP-Seq、Single Cell RNA-Seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 また、搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザー インターフェース上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 当資料では、k-meansクラスタリングによる細胞の分類やマーカー遺伝子の 表示、UMAPによる次元削減、遺伝子リストの作成など、Single Cell RNA-seqデータ解析に有用な機能について紹介します。 【掲載内容】 ■クラスタリング ■次元削減による可視化 ■発現変動遺伝子リスト ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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Scilligence version 6.3.1 新機能紹介

電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理など研究情報を一元管理可能!

当資料では、Scilligence version 6.3.1で実装された新機能について ご紹介します。 Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や 在庫管理など研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合 プラットフォームを提供。 電子実験ノートELN、分子情報・アッセイデータ登録システムRegMol、 在庫管理システムInventoryの各製品では低分子化合物から核酸・ペプチド・ タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、 多様なモダリティのデータを一元的に取り扱えます。 【掲載内容】 ■Scilligence 統合プラットフォームの特長 ■プロジェクトメンバーの追加 ■ノートページのお気に入り機能 ■SciFinder、Reaxysとの連携 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】Direct Force Field 7.2

新たに2つの目的に対する力場が追加!5つの系統の陽イオンと12種類の陰イオンに対応!

「Direct Force Field」は、力場作成とAeon社の開発した力場を利用するための ソフトウェアです。 力場を作成するために必要な機能を簡単な手順で利用できるようになっており、 開発された力場を管理するデータベースが搭載されています。 当資料では、2020年12月にリリースされた新バージョン『Direct Force Field 7.2』 についてご紹介しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■Direct Force Field 概要 ■新機能の紹介 ■参照文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】MOE:SVL Exchange:AutoPH4

リガンド結合部位から自動的にファーマコフォアモデルを作成するアドオンプログラム

『SVL Exchange』は、統合計算化学システム「MOE」のアドオンプログラムを 共有するためのウェブサイトです。 300以上のアドオンプログラムが公開されており、それらは簡単に「MOE」に インストールして使用できます。 当資料では、『SVL Exchange』で公開されている「AutoPH4」や、当社開発の アドオンプログラムをご紹介しています。 【掲載内容】 ■MOEの開発言語SVL ■AutoPH4 ■当社開発のアドオンプログラム ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】膨大なケミカルスペースに対する超高速類似構造探索

創薬の高速化と低コスト化を実現する上で強力なツール!原理と適用事例についてご紹介

薬物様化合物のケミカルスペースは10^60構造存在するとも言われ、 従来のプログラムでは有効な時間内で検索することは不可能です。 BioSolveIT社『infiniSee』は、数百億を超える実際に合成可能かつ 購入可能な化合物ライブラリーから、ターゲット分子と化学的特長類似 化合物を高速に検索することができます。 当資料では、薬剤耐性菌が生産する「CTX-M β-lactamase」に対する 合成可能なリガンド類似化合物の検索を例に、『infiniSee』の原理と 適用事例についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■CTX-M β-lactamase 複合体の三次元構造 ■母核置換 ■infiniSee による合成可能な化合物ライブラリーの類似構造検索 ■SeeSAR によるドッキングとHYDE スコアリング ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】空間的遺伝子発現データ解析

同時に複数のデータを解析することが可能!4週間無償トライアルにてご評価いただけます

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインター フェース(GUI)上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで 幅広くご利用いただけます。 当資料では、「Single Cell RNAseqtoolkit」を用いた組織切片の空間的遺伝子 発現データ解析についてご紹介しています。 【掲載内容】 ■空間的遺伝子発現解析とは ■組織切片の画像データの取得 ■遺伝子発現データと組織切片画像の重ね合わせ ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】Version 6.5および6.6の新機能

研究開発における知識の共有を促進!より簡単にデータの管理を行えるようになりました

Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理など、 研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合プラットフォームを 提供しています。 電子実験ノート「ELN」、分子情報・アッセイデータ登録システム「RegMol」、 在庫管理システム「Inventory」の各製品では低分子化合物から核酸・ ペプチド・タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、 多様なモダリティのデータを一元的に取り扱えます。 当資料では、version 6.5およびversion 6.6で実装された新機能について ご紹介しています。 【掲載内容(抜粋)】 ■Scilligence社製統合プラットフォームの特長 ■プロジェクトメンバーの追加 ■一括編集機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】CBIS: 電子実験ノート モジュール

実験データを管理・共有、実験資材情報や参考文献との連携で研究開発を効率化。化学合成用と汎用の2種類の電子実験ノートを用意。

ChemInnovation Software社製『Chemical and Biological Information System(CBIS)』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、 文献やレポートといった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して 管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 当資料では、CBISの電子実験ノート モジュールについてご紹介しています。 【掲載内容】 ■電子実験ノートのメリット ■CBISの電子実験ノートの機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】SeeSAR 11リリース

共有結合ドッキングのサポートなど多数の機能強化!新機能を中心にご紹介します

『SeeSAR』は、メディシナルケミストのために開発された3Dリガンド設計ツールです。 リガンド-受容体間の相互作用解析、分子編集、ドッキングシミュレーション、 フラグメント創薬、リガンド結合部位解析などの様々なSBDD機能が統合されています。 バージョン11では、共有結合ドッキングのサポート、リガンド結合部位探索の刷新、 結合部位の3Dモデルの出力等、多数の機能強化がなされています。 当資料では、SeeSAR11で搭載された新機能を中心に紹介しています。 【掲載内容】 ■SeeSAR 11新機能 ■共有結合ドッキングのサポート ■結合部位探索の刷新 ■結合部位の3Dモデルの出力 ■その他機能強化 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】CBIS:配合研究データの管理

複数の原材料を配合して望む性質の素材を作る配合研究について、原材料、配合レシピ、測定した物性などのデータを統合的に管理。

ChemInnovation Software社製『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で 生じた実験データ、参考文献やレポートといった文書など、研究に関わる 多様なデータを統合して管理できるウェブシステムです。 国内外で多数ご導入いただいており、柔軟なカスタマイズ性と優れた コストパフォーマンスで高いご評価をいただいております。 当資料では、配合研究のデータを管理するCBISのレシピ管理モジュールに ついて紹介しています。 【掲載内容】 ■配合研究における情報管理 ■CBISレシピ管理モジュールの機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】CDD Vault新機能紹介 (2021.07)

多数の実績あり!2021年1月以降に実装された新機能についてご紹介

米国Collaborative Drug Discovery社により開発された『CDD Vault』は、化合物・抗体・細胞などのサンプルの情報とアッセイ情報の管理・共有機能と、電子実験ノート機能を有するクラウドサービスです。 優れた可視化機能を持つ『CDD Vault』は、システム導入や管理に手間をかけることなく、創薬研究データの管理システムをすぐに利用できるため、製薬企業やベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を進めるための プラットフォームとして多数の実績があります。 当資料では、2021年1月以降に実装された新機能について紹介しています。 【掲載内容】 ■CDD Vaultとは ■ユニークIDを使用したサンプルの登録 ■Marvin JSの新しい描画テンプレート ■ELNから登録したエントリーのリンク ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】医薬品の探索と薬理・安全性予測

独自の予測モデルにより薬理活性、毒性・安全性、代謝産物の予測を行います!

『Chemotargets CLARITY』は、膨大な量のアッセイデータと有害事象レポートを 整理統合して活用することで、隠れた知識を発見し、医薬品開発の効率を 改善する革新的なデータサイエンス・ソリューションです。 アッセイデータは、公共および商用データベースから取得した524万以上の 化合物に対する448万以上の相互作用情報から成り、有害事象情報は、過去50年間 にFAERSから抽出された1500万以上のレポートから成ります。 これらの膨大なデータに対して、Drug Explorer、FAERS Explorer、MedChem Explorer のデータ探索ツールを用いて、有益な知識を引出し、また、独自の予測モデルにより 薬理活性、毒性・安全性、代謝産物の予測を行います。 【掲載内容】 ■はじめに ■Drug Explorer ■Prediction Analysis ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】統合計算化学システム『MOE』

「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能をご紹介!

「Reverse Fingerprint Modeling」は、MOEユーザーコミュニティーのための SVLコード交換サイトSVL Exchangeで公開されている統合計算化学システム MOEのアドオンプログラムです。 化合物のさまざまな分子フィンガープリントと活性値の情報を用いて、 活性化合物に共通の部分構造や活性/不活性に寄与する部分構造を特定したり、 ファーマコフォアモデルを構築/評価したりできます。 当資料では、「Reverse Fingerprint Modeling」の概要と4つの機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■Reverse Fingerprint Modelingの概要 ■Motif Detection ■Virtual Pockets ■Fragment Placement ■Activity Scan ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】Batchremovalツールによるバッチ効果の低減

バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能についてご紹介!

『Partek Flow』は、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー(NGS)から出力されたリード配列を読み込んで、 RNA-seqやSingle Cell RNA-seq等のデータを解析することが可能。 当資料では、バッチ効果の低減に利用可能なBatch removal機能について 紹介しています。 【掲載内容】 ■Flowの製品概要 ■Batch removalとは ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】電解液に対応したCOSMO-RS-ES法

電解液などのイオンを含む系に対応することが可能!COSMO-RS-ES法をご紹介します

熱力学物性推算ソフトウェアBIOVIA COSMOthermの新バージョン2021に 搭載されたCOSMO-RS-ES(ES:Electrolyte System)法を紹介します。 COSMO-RS-ES法は、COSMO-RS法とPizter-Debye-Huckel モデルを 組み合わせた方法で、COSMO-RS法では考慮が難しい電解液などの イオンを含む系に対応することが可能になります。 “COSMO-RS-ES法の推算事例”などを掲載しておりますので、 ぜひご一読ください。 【掲載内容】 ■COSMO-RS-ES法 ■COSMO-RS-ES 法の推算事例:  酢酸カリウムを添加した酢酸メチル―メタノールの定圧気液平衡 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】infiniSee Version 3.0リリース

無限に近いサイズのケミカルスペースからの高速構造探索。検索における利便性が各段に向上!購入可能な化合物を高速に提案。

infiniSeeは、無限に近いサイズの化合物空間(ケミカルスペース)の中から 目的分子を高速に探索するツールです。 リード探索、SAR 展開、特許回避を目的とした、購入可能な候補化合物を 簡単な操作で発見します。 Version 3.0 では、100億構造を超える新しいケミカルスペースCHEMriyaへの対応、検索履歴の閲覧、試薬ベンダーへのアクセス機能が追加され、 化合物検索における利便性が各段に向上しました。 【掲載内容】 ■infiniSee概要 ■新しいケミカルスペースCHEMriya ■検索履歴の閲覧 ■試薬ベンダーへのアクセス ■KNIMEインターフェースを用いた他ツールとの連携 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】RNA-seq データ解析

エンリッチメント解析やパスウェイマップの表示が可能!RNA-seqデータ解析をFlowだけで完結することができます

Partek Flowは、シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 シーケンサー(NGS)から出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq等のデータを解析することが可能。 Flowはリード配列の参照ゲノム配列へのアライメント前後の品質保証/ 品質管理(QA/QC)、発現遺伝子量の推定、正規化、発現変動遺伝子の検出など、 RNA-seq データ解析に必要な機能を多数搭載しています。 当資料では、RNA-seq データ解析について紹介します。 【掲載内容】 ■RNA-seq データ解析とは ■参照ゲノム配列へのアライメント ■発現遺伝子の推定と正規化 ■発現遺伝子リストの作成と生物学的解釈 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】Scilligence Focus の紹介

ウェブベースのデータ解析・可視化ツール!新製品Focusの機能を紹介します

Scilligence 社製統合プラットフォームの新製品Focusは、化学や生物学の データセットで複雑な分析を行うためのウェブベースのデータ解析・可視化ツールです。 RegMolの登録データと外部ソースからインポートしたデータを統合的に扱えます。 SAR解析機能ではRグループ分解が簡単に行え、可視化ツールではさまざまなタイプの チャートでデータのソートやフィルタリングを行えます。 当資料では、新製品Focusの機能を紹介します。 【掲載内容】 ■創薬研究とFocus ■データアクセス ■データ解析 ■データの可視化 ■SAR 解析 ■まとめ ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】CDD Visualization

共同研究の情報共有プラットフォームとしても実績あり!フリーの解析・可視化ツールをご紹介

米国Collaborative Drug Discovery社(CDD社)により開発・運用されている「CDD Vault」は、化合物・抗体・細胞などのサンプル情報とアッセイ情報の管理・共有機能、電子実験ノート機能、および可視化機能を有するクラウドサービスです。 創薬研究データの管理システムにおける導入や管理に要する手間を省き、システムをすぐに利用可能。製薬企業やベンチャー企業、CRO、大学や公的研究機関などでの利用のほか、共同研究の情報共有プラットフォームとしても実績があります。 当資料では、データ解析・可視化ツール「CDD Visualization」の無償利用について紹介します。 【掲載内容】 ■CDD Vaultとは ■CDD Visualizationの無償利用 ■プロットの作成 ■データのフィルタリング ■プロットの出力 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】DISGENET plus 取り扱い開始

正確な情報を提供!疾患関連遺伝子&変異データベースの特長や機能などについて掲載!

当社は、本年4月よりMedBioInformatics社製疾患関連遺伝子&変異データベース「DISGENET plus」の取り扱いを開始しました。 疾患に関連する遺伝子や変異のデータを専門家によりキュレート、統合することで、疾患の遺伝的要因や薬の副反応に関する正確な情報を提供。 また、アクセスにはウェブブラウザーやRパッケージなどが利用できます。 当資料では、データベースの特長や機能などについて紹介します。 【掲載内容】 ■はじめに ■DISGENET plusへのアクセス ■インターフェイス ■データベース ■解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】MOE: CLEの紹介

様々な特性に基づいて試薬と生成物を対話的にフィルタリング!新規アプリケーションのご紹介

MOE 2022.02には新規アプリケーションとして「Combinatorial Library Enumeration(以下、CLE)」が追加されました。 CLEは、化学反応に基づいてコンビナトリアルライブラリーを生成するとともに化合物の合成に必要な反応試薬の検索を行うことのできるウェブアプリケーションです。 分子記述子や化学基、保護基などの様々な特性に基づいて試薬と生成物を対話的にフィルタリングでき、 列挙された試薬や生成物の内容を動的に調整することが可能。 当資料では、CLEの機能の詳細を紹介します。 【掲載内容(一部)】 ■CLE概要 ■CLEのメイン画面 ■Reagent Catalogsペイン ■Reactionペイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】infiniSee 5 Artemisリリース

巨大ケミカルスペースからのフィンガープリントによる高速類似構造検索を実装!

当資料では、ケミカルスペースナビゲーションソフトウェアの 新バージョン「infiniSee 5 Artemis」について解説しています。 10^14分子を超える組み合わせに相当する巨大な ケミカルスペースの中から類似構造を高速検索する、従来のFeature Treeによる検索モード「Scaffold Hopperモード」の他、フィンガープリントによる検索モード「Analog Hunterモード」が追加。 また、ヒット分子の物性計算、フィルタリングのための 「Analyzerモード」の追加等、infiniSee 5の新機能について紹介。 【掲載内容(一部)】 ■infiniSee 概要 ■Scaffold Hopperモード ■Analog Hunterモード ■Analyzerモード ■検索対象のケミカルスペースの拡充 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】SVL Exchange:SVLプログラムの紹介

自身で作成したアドオンプログラムも公開可能!無償で利用できるプログラム

当資料では、SVLの概要を簡単に説明したうえで、 SVL Exchangeで公開されている中からプログラムを いくつかかピックアップして紹介しています。 リガンド結合部位の静電ポテンシャルマップや疎水性/親水性原子の 存在確率などを基に自動的にファーマコフォアモデルを作成する アドオンプログラムである「AutoPH4」などについて掲載。 公開されているプログラムについて、簡潔に説明されていますので、 導入の検討の際にご活用ください。 【掲載内容(一部)】 ■MOEの開発言語SVL概要 ■AutoPH4/Database AutoPH4 ■AlphaFold による予測構造の色分け ■Bio-MOE ■MOE Clustering ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】DNA-Seqデータ解析(変異遺伝子の検出)

6種類のプログラムを搭載!解析の目的やサンプルの状態に応じてプログラムを選択

当資料では、シーケンサーデータ解析ソフトウェアPartek Flowを 用いたDNA-Seqデータ解析について紹介しています。 DNA-Seqについての概要から始まり、変異や融合遺伝子の検出の プログラムについてご説明。 遺伝子のデータ解析ソフトウェアの選定の際にぜひご活用ください。 【掲載内容】 ■DNA-Seqとは ■変異の検出 ■融合遺伝子の検出 ■コピー数変異の検出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】SBDD統合ツール『SeeSAR 13』リリース

SeeSAR 13にフラグメント創薬のため新機能を追加、計算アルゴリズムが改良されました!BioSolveIT社製創薬支援ツール

当資料では、「SeeSAR 13」で更新された機能とDrugathon 2023の開催報告 を掲載しております。 「SeeSAR」は、メディシナルケミストのためのStructure-Based Drug Design (SBDD)統合ツール。新製品の「SeeSAR 13」 がリリースされ、新機能として リガンドの構造展開を支援する「MedChemesis」が追加。 そのほか、タンパク質表面描画機能の強化などの情報を 多数ご紹介しております。是非、ご一読ください。 【掲載内容(一部)】 ■SeeSAR 13の概要 ■新機能:MedChemesis ■タンパク質表面描画機能の強化 ■3Dモデルファイル出力機能の強化 ■フィルタリング機能の強化 ■Drugathon 2023開催報告 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【技術情報】MOE 分子糊開発用アプリケーション紹介

分子糊の開発を支援!統合計算化学システム MOE 上で分子糊とタンパク質との三元複合体構造のモデリングを容易に行うことが可能

当資料では、統合計算化学システムMOE上で動作させる「Molecular Glue Modeling Tool」 について ご紹介しております。 分子糊の開発を支援するMOEのカスタムアプリケーションであり、 2つのアプローチにより分子糊を介した三元複合体構造のモデリングを 容易に行うことが可能。 検証結果なども掲載しており、導入検討の際に参考にしやすい 一冊となっております。ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■分子糊とは ■Molecular Glue Modeling Tool ■モデリング手法の検証結果 ■プログラムの入手方法 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【新製品情報】Partek Flow 11.0リリース

解析アプリケーションに合ったデータの取込みをナビゲートすることでデータ解析をサポート!

当資料では、「Partek Flow」の新バージョンでの主な新機能や 変更点についてご紹介しております。 「Flow」は、ウェブブラウザーを介して利用するNGSデータ解析 ソフトウェア。新バージョンではインターフェイスが改良され、 空間トランスクリプトーム解析機能が強化。 各項目ごとに詳しく解説しておりますので、是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■Partek Flowの製品概要 ■インターフェイス ■空間トランスクリプトーム解析 ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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【製品紹介】infiniSee xREAL リリース

2024年秋、独BioSolveIT社からリリース!xREAL Spaceから構造探索を行うソフトウェアをご紹介

当資料では、ケミカルスペース高速探索ツール「infiniSee xREAL」について ご紹介しております。 「infiniSee」および「infiniSee xREAL」の特長をはじめ、関連する ウェビナー情報についても掲載。 「infiniSee xREAL」はxREAL Spaceからの構造探索に特化したソフトウェアで、 従来の「infiniSee」と同じく3つの探索モードが搭載されており、膨大な ケミカルスペースからの高速な構造探索を可能にします。 【掲載内容】 ■infiniSeeとは ■infiniSee xREAL ■infiniSee xREALのウェビナー  『infiniSee xREAL:Perspectives on the 2.4-Trillion-  Sized Compound Supercluster』 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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【技術情報】バイオベンチャーの研究データ管理への利用

バイオベンチャー企業のライフサイクルを通して研究業務を強力に支援! 研究情報共有システムCDD Vaultの利用メリットをご紹介

当資料では、創薬研究情報共有クラウドシステム「CDD Vault」の概要と、バイオベンチャー企業での利用メリットについてご紹介しております。 CDD Vaultは幅広い分野の研究データを一元管理してリアルタイムに共有することで、所属、所在地や専門分野などが異なる多数の研究者同士のコラボレーションを実現し、研究業務を効率化します。 企業設立時のデータインフラ構築から、新薬候補のライセンスアウトや大手企業による買収などに際してのデューデリジェンスまで、バイオベンチャー企業のライフサイクルを通してCDD Vaultは役立ちます。 【掲載内容】 ■CDD Vaultの概要 ■Part 1:データインフラの構築 ■Part 2:新たな知見の発見の支援 ■Part 3:コラボレーションの支援 ■Part 4:投資家やパートナーとの知的財産の安全な共有 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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BIOVIA COSMOtherm関連論文リストと応用事例

論文リストならびに論文にて報告されたBIOVIA COSMOthermの応用事例をご紹介!

当資料では、熱力学物性推算ソフトウェア「BIOVIA COSMOtherm」について ご紹介しております。 エアロゾル粒子の吸湿成長因子の予測や、Caco-2/MDCK細胞膜透過係数の 予測などの応用事例を掲載。 BIOVIA COSMOthermは、2001年に製品化されて以来、化学・化学工学を 中心に幅広い分野の研究・開発に使用されてきました。 【掲載内容】 ■BIOVIA COSMOtherm関連論文リスト ■応用事例:エアロゾル粒子の吸湿成長因子の予測 ■応用事例:Caco-2/MDCK 細胞膜透過係数の予測 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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【製品紹介】DISGENETアップデート

Version24.1より後に行われたデータベース登録データ数の更新や機能の追加を紹介!

当資料では、疾患関連遺伝子&変異データベース「DISGENET」のアップデート についてご紹介しております。 「DISGENET」のデータベースに登録されているスコアについての解説をはじめ、 v24.2より追加されたアプリケーションなどについて掲載。 「DISGENET」は、ヒトの疾患に関連する遺伝子や変異のデータを専門家により キュレートし統合することで、疾患の遺伝的要因や薬の反応に関する正確な情報を 提供します。 【掲載内容】 ■はじめに ■登録データ ■DISGENET Cytoscape App ■AI Assistant ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

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