『ADF2017』は、30年以上の歴史を誇る密度汎関数法 (DFT) を用いた 量子化学計算ソフトウェア「ADF」の、2017年リリースバージョンです。 分子系では、通常の密度汎関数法（DFT）では記述の難しいd→dや、f→d遷移 の計算を可能にするLigand Field DFT法の搭載や、TDDFT法による第二超分 極率の計算、特に二光子吸収の計算ができるようになりました。 また、周期系では非平衡グリーン関数（NEGF）法を搭載により、二つの電極に はさまれた単一分子のバリスティック伝導の計算に対応しました。 【特長】 ■密度汎関数法 (DFT) を用いた量子化学計算ソフトウェア ■Ligand Field DFT法／非平衡グリーン関数（NEGF）法を搭載 ■TDDFT法による第二超分極率の計算が可能 ■二光子吸収の計算が可能 ■二つの電極にはさまれた単一分子のバリスティック伝導の計算に対応 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析を効率化します。 使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載しているため、 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の 同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【特長】 ■公共データベースの遺伝子発現データ ■専門家によるキュレート ■キュレーション済データベースと高速な検索エンジン ■強力で使いやすい解析ツール ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MedeA』は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の 物性評価を行うための統合支援環境です。 開発元であるMaterials Design社では、当製品を紹介するためのウェビナーを 開催しており、幅広い機能や最新の適用例を知るうえで有効な機会です。 過去のウェビナーは、ウェビナーオンデマンドにて動画配信されています。 下記のリンク先からご覧いただけます。 ウェビナーオンデマンド：http://www.materialsdesign.com/webinars 【過去に開催されたウェビナー】 ■UNCLEの基本理論とその適用例 ■空間・時間スケールの大きな現象を取り扱う技術として、古典力場計算 ■化学や触媒分野に焦点を当て、古典力場計算の技術 ■Liイオン電池電極材の相安定性や構造劣化現象の解析に焦点を当てた事例 ■第一原理計算プログラムVASPなどを利用して、解析、物性評価した例 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOEsaic』は、Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group解析などの SAR解析、分子設計、文書作成が行える「MOE 2016.08」のウェブアプリケーションです。 当アプリケーションを用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 指定した部分構造だけが異なる分子ペアの検索をはじめ、指定した構造変換に 対応する分子ペアを検索し、構造変換による特性値の変化確認や、母核と 置換基へのフラグメント化などを行うことが可能です。 【特長】 ■MMP検索 ■MMPプロファイル ■R-group分解 ■R-groupプロファイル ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析可能にします。 「乳がん特異的な発現パターンと逆相関を示す化合物」の解析では、 隣接正常組織と比較して乳がん組織で発現が有意に変動している遺伝子を検索。 疾患特異的な発現変動と逆相関を示す医薬品候補化合物を検索することで、 解析対象の疾患に有効性を示す可能性がある化合物を見出すことができます。 【特長】 ■遺伝子発現データをキュレート ■大量の実験結果を統合して解析可能 ■解析対象の疾患に有効性を示す可能性がある化合物を見出すことが可能に ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「Flow」は、次世代シーケンサー（以下、NGS）から出力されたリード配列を 読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータ解析が可能なシーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 2016年12月にリリースされた「Flow 6.0」では、『ChIP-seqのデータ解析』に対応。 リード配列の参照ゲノム配列へのアラインメント、アラインメント前後の QA/QC、ピーク検出、検出したピークのアノテーション、転写開始点からの 距離でのプロットなど、ChIP-seqのデータ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【ChIP-seqとは】 ■ChIPとNGSを組み合わせてゲノムワイドにエピゲノム情報を 　取得する手法 ■様々な生物で転写制御メカニズムの理解に大きく貢献 ■プローブ設計に依存した制限がない、ダイナミックレンジが広い ■ChIP on chipと比べてバイアスのない精確な解析が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「PSILO」は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報の データベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの 共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの分散するタンパク質 立体構造データを統合し、ウェブベースのインターフェースから容易に 活用可能です。 2016年末にリリースされた『PSILO 2016.10』では、タンパク質結晶構造解析 で利用されるCootを直接起動できるようになったほか、レコード表示に クオリティーサマリーを追加、構造因子(F)、σA 値(D)、fi gure of merit値(m) を利用した2mFo-DFcやmFo-DFcマップの計算が可能になるなどの機能が追加されました。 【新機能】 ■レコード表示（Cootの起動） ■クオリティーサマリー表示 ■電子密度マップ表示 ■検索（2Dスケッチャー、リガンド類似度ソート） ■3D構造検索結果の重ね合わせ ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「Gaussian」は、世界的に広く利用され、分子設計・構造解析・化学反応解析 などで、多大な成果をもたらしている量子化学計算ソフトウェアです。 メジャーバージョンアップ版『Gaussian16』では、励起状態の取り扱いや スペクトル計算における新機能や、計算速度向上を図る機能が追加されました。 時間依存密度汎関数法（TD-DFT）を用いた解析的振動計算により、IR・Raman スペクトル、遷移状態構造の最適化とIRC 計算が可能になったほか、 Hartree-FockおよびDFT計算におけるGPU計算へ対応しています。 【新機能】 ■時間依存密度汎関数法（TD-DFT)を用いた解析的振動計算 ■振動スペクトルの非調和項の考慮 ■分子振動準位を考慮した電子円偏光スペクトル、共鳴ラマンスペクトルの計算 ■EOM-CC法による構造最適化 ■新しいDFT汎関数（M08HX, MN15, MN15L） ■新しい半経験的手法（PM7） ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「FTrees」は、既知の活性化合物と類似した構造をデータベースの中から 検索する、独BioSolveIT社製創薬支援ツールです。 官能基の物理化学的特徴とその結合の繋がりからクエリー分子を木構造で 表現し、類似する構造を高速に見出します。トポロジーを保持した検索が行え、 合成研究者が経験的に類似していると判断する構造が探索できます。 バージョンアップした『FTrees 3』では、プログラム内部を根本的に見直し、 高速化を実現したほか、グラフィックスの向上により類似構造の差異が わかりやすくなりました。 【特長】 ■クエリー分子を木構造（Feature Tree）で表現 ■トポロジーを保持した検索が可能 ■計算の高速化 ■グラフィックスの向上 ■KNIMEノードを提供するすることで、FTrees利用の可能性が拡大 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『COSMOtherm』は、物性推算法COSMO-RS法を用いた熱力学物性推算ソフト ウェアです。任意の化合物や混合溶液の蒸気圧・分配係数など様々な平衡 物性を推算可能です。 使用するCOSMO-RS法は量子化学計算で得られる分子の表面電荷情報と 分子統計力学に基づき、溶液中の分子の化学ポテンシャルを算出し、得られた 化学ポテンシャルを用いて、様々な平衡熱力学物性を算出します。 オプションとして、種々の溶媒分子を含む4000種類以上の有機化合物の 電荷分布データを収めたデータベースCOSMObaseも用意されていますので、 量子化学計算の手間を省くことも可能です。 【特長（Ver. C30 Release 17.01）】 ■純物質および混合物の引火点予測 ■臨界定数予測、ならびに状態方程式（EOS）との連携機能 ■液液平衡（LLE）予測における熱的ゆらぎに対する理論的補正 ■既存機能の改善や改良が図られ、推算精度と計算速度が向上 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『SeeSAR 5.5』は、メディシナルケミストのために設計された、 独BioSolveIT社製リード化合物最適化ツールです。 当製品は、既知のリガンド結合部位内における原子や母核の置換による リガンド修飾や、リガンドの物性とADME特性の計算、受容体との結合親和性の 評価等を組み合わせてシームレスな分子設計を可能にします。 今回のバージョンアップでは、リガンドが結合する可能性のあるサイトの予測 が可能になったほか、リガンド構造とそのプロパティーを総合的に評価する ために、一覧表示が追加され、より迅速な解析が可能になりました。 【特長】 ■メディシナルケミストのために設計 ■シームレスな分子設計が可能 ■リガンドの結合サイト予測機能 ■受容体－リガンドの相互作用解析が可能 ■リガンドのタイル表示とプロパティーのレーダーチャートのサポート ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポート といった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できる ChemInnovation Software社製のウェブシステムです。 製剤研究においては、主剤や添加剤の配合成分に関連する情報をはじめ、 成分の混合比率、使用する機器情報、混合時の温度や時間といった処理条件、 製剤後の物性について、測定値、測定に使用した機器情報、測定条件などの 情報管理が可能です。 当製品は、柔軟なカスタマイズ性と優れたコストパフォーマンスで、 製剤研究の情報管理以外にも様々な分野の研究情報を管理することができます。 情報資産の有効活用をお考えの場合や管理にお困りのデータがありましたら、 お気軽にご相談ください。 【製剤研究における情報管理】 ■成分の管理 ■製薬情報の管理 ■物性情報の管理 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『CBIS』は、研究に使用する資材、研究で生じた実験データ、文献やレポート といった文書など、研究に関わる多様なデータを統合して管理できる ChemInnovation Software社製のウェブシステムです。 当製品は複数ユーザーが同時に使用することができ、研究情報の共有に メリットを発揮します。ログインするだけで、閲覧・情報登録・編集が可能。 台帳の編集待ちなどが発生せず、作業効率が向上します。 また、ユーザーやグループへの権限付与が可能で、無用な情報変更を避けられ ます。「承認者のみ変更できる入力欄」なども設定でき、承認までシステム内 で完結することができます。 【CBISを活用した情報共有のメリット】 ■複数ユーザーの同時使用が可能 ■ログインするだけで、管理されている情報を閲覧可能 ■回覧に時間をかけなくて済む ■閲覧済みかどうかのチェックが可能 ■台帳の編集待ちなどが発生しない ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『CoLibri』は、反応式をもとにフラグメントライブラリーを作成する、 独BioSolveIT社製の創薬支援ツールです。 ライブラリーは化学反応式をもとに作成されるため、より現実的なバーチャル 化合物を得ることができます。 「バージョン3.0」では、対応OSとしてWindowsが加わり、反応式の定義、 フラグメントライブラリーの出力、生成物のバーチャルライブラリーの出力 処理がWindows上のワークフローツールKNIMEでもできるようになり、 利便性が向上しました。 【特長】 ■Windowsに対応 ■反応式をもとにユーザー独自のフラグメントライブラリーを構築 ■より現実的なバーチャル化合物を得ることが可能に ■KNIMEと連携することでライトユーザーも利用可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

Scilligence社製『RegMol』は、分子情報およびアッセイデータ登録システムです。 RegMolでは低分子から高分子まで様々な種類の分子の情報を登録できます。 例えば、RegMolにペプチドを登録する場合、プロジェクトや構造式、CAS 番号などの外部ID、名前、純度やLogPなどの物性情報、治療領域や標的タンパク質、電子実験ノートのページ番号、( 購入試薬の場合は) メーカー名やカタログ番号および購入日、NMRやHPLCなどのスペクトル、添付ファイルなどを登録します。また、RegMolに既に登録された分子と関連付けてネットワークを登録することもできます。 【Scilligence 社製ソフトウェアの特長】 ■低分子からペプチドや核酸などの中分子、抗体や抗体薬物複合体(ADC)などの高分子まで1つのプラットフォームで扱える ■HELM (Hierarchical Editing Language forMacromolecules)表記に対応 ■居室や実験室などにあるどのパソコンからも利用可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOE（Molecular Operating Environment）』は、カナダCCG社が独自に開発したSVL（Scientific Vector Language）を搭載する統合計算化学 システムです。 使いやすいインターフェイス、ソースコード公開の豊富なアプリケーション、目的に応じて使い分けできる複数の使用モード、柔軟なライセンス形態により幅広い分野の研究者のニーズに答えることのできるソフトウェアです。 CoMFAに基づき自動的に3D-QSARモデルの構築を行うMOEのアドオンプログラム「AutoGPA」では、三次元記述子として、新たに水素結合のドナー／アクセプターや芳香環のファーマコフォア、部分電荷、LogP、モル屈折などの幅広い特性を用いたCoMSIA法をサポートします。 【特長（AutoGPAのCoMSIA法）】 ■多様な物理化学的特性を3D-QSAR式に含める ■3D-QSAR 式の各特性の係数の大きさと位置から、物理化学的な特性を予測 ■CoMFA法と比較して、より具体的な特性の予測が可能 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

量子化学計算ソフトウェアTURBOMOLEの新バージョン7.2がリリース。新バージョンに搭載された新機能や改善された機能について紹介します。 【バージョンアップ内容】 ■周期境界条件を用いた計算機能の拡張 ユニットセルの構造最適化が可能になったことで、セルサイズが不明なモデルが取り扱えるようになり、様々な計算対象に用いることが可能 ■Bethe-Salpeter方程式に基づく励起エネルギー GWとBSEを組み合わせた励起エネルギーの計算が可能 ■CC2法によるりん光寿命の計算 CC2法を用いることでDFTの問題点を回避すると共に計算コストを抑えたスピン軌道相互作用の考慮を実現 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、独BioSolveIT社のメディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツールについて掲載しています。 「SeeSAR」は、既知のリガンド結合部位内における原子や母核の置換による リガンド修飾や、リガンドの物性とADME特性の計算、受容体との 結合親和性の評価等を組み合わせてシームレスな分子設計を可能にします。 最近実施されたバージョンアップでは、既存機能の強化がなされ、 ユーザーインターフェースが刷新されました。 ヘルプマニュアルが充実し、使いやすさがより向上しました。 【掲載内容】 ■ヘルプマニュアルの充実、ユーザーインターフェースの刷新 ■複数のタンパク質構造の取り扱い ■ファーマコフォアの設定 ■原子間結合の回転と二面角のラベル ■その他の機能増強 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、統合計算化学システム「MOE 2017.11」の主な新機能や 機能強化を掲載しています。 新機能として抗原の抗体結合部位を精度よく予測するエピトープマッピング、 低分子の結合のねじれ角を回転させた際のエネルギープロファイルを 予測するTorsion Profileの機能が追加されます。 さらに、新しいデータコンテンツとして、TCR-MHC複合体データベースが 追加されます。 【掲載内容】 ■エピトープマッピング ■VRディスプレイ「zSpace」のサポート ■Torsion Profile ■DNA/RNA 関連機能の強化 ■TCR-MHC 複合体データベース　他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、「COSMOperm」の予測方法と予測精度について掲載しています。 COSMOlogic社新製品として、低分子の分子膜透過性を予測する ソフトウェアがリリースされます。 本製品は、既存の分子膜・ミセル内分子分布シミュレーター「COSMOmic」で 算出される分子膜中の分配係数と新たに考案されたCOSMO－RS法に基づく 拡散係数予測式を用いて膜透過性を予測します。 【掲載内容】 ■COSMOpermの予測方法と予測精度 ■予測精度の検証事例 ・約40種の低分子の膜透過性が検討された ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、MedeA環境に統合された第一原理計算ソフトウェア 「MedeA-VASP」を用いた遷移金属酸化物表面のモデリング事例について 掲載しています。 酸化触媒としても使用される酸化鉄（ヘマタイトFe2O3）の(0001)面 についてさまざまな表面終端モデルの表面エネルギーを評価し、 触媒として活性な表面構造について解析します。 【掲載内容】 ■表面エネルギーによる酸化鉄表面の評価 ■表面エネルギーと構造の関係 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、新しく追加されたTCGAの遺伝子発現データについて 掲載しています。 「GENEVESTIGATOR」は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。 公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な 遺伝子発現データをキュレートすることで、さまざまな研究者により登録された 大量の実験結果を統合して解析可能にします。 また、使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載し、研究者が 標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や 発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【掲載内容】 ■TCGAについて ■GENEVESTIGATORに収載されたTCGAデータ ■RNA-seqのデータ解析パイプライン ■ご評価 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、タンパク質立体構造データベースシステム PSILO 2018の新機能について掲載しています。 「PSILO」は、生体高分子やタンパク質ーリガンド複合体構造情報の データベースシステムです。 タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、 データの共有を支援します。 公共データやインハウスデータなどの散在するタンパク質立体構造データを 統合し、ウェブベースのインターフェースから容易に活用することができます。 【掲載内容】 ■MOE Project データベース ■NGL 3D Visualizerのサポート ■ブラウザーベースのスケッチャー ■MMTF フォーマット出力 ■MOEからのファイルアクセス ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、バージョンアップされた創薬支援ツール SeeSAR 7.2について掲載しています。 独BioSolveIT社の「SeeSAR」は、メディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツールです。 今回のバージョンアップでは、フラグメントベースのリガンドデザイン機能が 強化され、従来の母核構造置換に加え、フラグメント付加、複数フラグメント の結合によって新規リガンド候補構造を設計できるようになりました。 【掲載内容】 ■追加されたFBDD機能の概要 ■フラグメント付加の解析例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOEフォーラム2017』では、開発元からMOEの最新技術の講演、5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して講演いただきました。 【開発元講演】 ■Prediction of Protein-Protein Binding Sites and Epitope Mapping ■Optimizing Protein Properties in the Cloud with MOE 【招待講演】 ■「創薬等研究推進に向けたタンパク質の大規模情報解析」 ■「Structure-based drug designの手法を活用した創薬シード創成」 ■「創薬研究におけるSupervised Molecular Dynamicsの有用性検証」 ■「タンパク質間相互作用を誘導する有機小分子とその相互作用の 　解析法の開発」 ■「Integratedi n silico Strategy for Drug Discovery」 当日の資料をご希望の方はご連絡ください。 ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MedeA』は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 本適用事例集は、当製品の開発元であるMaterials Design社にて配布している適用例をまとめたものです。 第一原理計算プログラムVASPを用いて、電子状態から物性評価した事例を紹介します。 【適用事例】 ■NiSi/Si間のショットキー障壁の評価 ■VO2のバンドギャップ評価と金属絶縁体遷移（ハイブリッド汎関数） ■InAsのハイブリッド汎関数による高精度なバンド構造評価 ■High-kゲートスタックにおける仕事関数の評価 ※詳しくはダウンロードよりPDFをご覧ください。

当資料では、2018年2月にリリースされました新版の4.1.1の 概要について掲載しています。 材料設計支援プラットフォームSciMAPSの各計算プログラムは、 計算プログラム本体とそれに対するインターフェースから構成される プラグインとして提供されます。 基本環境であるPlatformに各プラグインを追加することにより 研究に適した環境を取り揃えることができます。 【掲載内容】 ■新機能AtoMeso Converter ■構造構築機能の粗視化モデル対応 ■新製品とシミュレーションの粗視化対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、CDD VAULTの電子ノートブックモジュール 「CDD VAULT ELN」について掲載しています。 「CDD VAULT」は米国CDD社により開発された化合物情報とアッセイ情報を 共有するクラウド上のウェブシステムです。 ウェブブラウザーだけで創薬研究の一連のデータを管理でき 優れた可視化機能を持っています。 製薬企業やベンチャー企業、大学、公的研究機関などが共同研究を 進めるために適したプラットフォームになります。 【掲載内容】 ■CDD VAULT ELNとは ■特長 ・自由な記述 ・ファイルの添付 ・オートセーブ機能 ・エントリーの状態 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、MN-AM社製「CORINA Classic」および「CORINA Symphony」 について掲載しています。 各製品の概要をはじめ、分子構造標準化などの機能をご紹介しております。 【掲載内容】 ■CORINA Classic 概要 ■CORINA Symphony 概要 ■分子構造標準化 ・フラグメントの除去 ・水素原子の付加 ・分子構造の中性化 ・重複分子の削除　他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に 各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 開発元であるMaterials Design社では、ユーザー会を例年開催しており 昨年は9月にフランスで開催しました。 また、日本では11月にJFCC（ファインセラミックスセンター）にて セミナーを開催し、新開発動向や適用事例を紹介しました。 【概要】 ■MedeA ユーザー会 ・世界中から50名程のユーザーが参加 ・「ハンズオントレーニングセッション」では、モデリングや解析方法を演習 ・「サイエンティフィックプログラム」と称し、ユーザーからの研究報告や 　開発元からの新動向が発表 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、MedeAの新版としてリリースされたバージョン2.22について 掲載しています。 「MedeA」は、原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に 各種の物性評価を行うための統合支援環境です。 新版では、VASP等の計算プログラムがアップデートされ、 新しい計算機能を使用できるようになりました。 【掲載内容】 ■MedeA 2.22アップデート内容 ・MedeA-VASP ・MedeA-GIBBS ・MedeA-LAMMPS ・MedeA-MOPAC ・MedeA-Gaussian　他 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、ニューラルネットワーク手法に基づくデータ解析が可能な SONNIAについて掲載しています。 MN-AM社製「SONNIA」は、自己組織化ニューラルネットワーク手法に 基づいて低分子化合物のクラスター解析とQSA(P)R解析を行います。 データの入出力、計算の設定、結果の表示に対話的かつグラフィカルな インターフェースを提供し、化合物の物理化学的特性間あるいはそれらと 生物活性等の実験値との関係を可視化して解析することができます。 【掲載内容】 ■SONNIA 概要 ■SONNIAの主な機能 ■応用事例紹介 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、独BioSolveIT社のメディシナルケミストのために設計された リード化合物最適化ツール『SeeSAR 8.0リリース』について 掲載しています。 『SeeSAR』は、受容体の結合部位内において、リガンド原子の 結合自由エネルギーへの寄与、結合二面角の妥当性、リガンド物性 などを評価できます。 今回のリリースでは、バージョンアップによるFragment Based Ligand Designの ためのInspirator機能の強化およびタンパク質の構造アラインメントの 機能の強化と、配列表示機能の改良を行いました。 【掲載内容】 ■FBLDのためのInspirator機能の強化 ■タンパク質構造のアラインメント機能の強化 ■配列表示機能の改良 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MedeA-HT』は、信頼性の高い計算データの大量生成・解析のための ツールとして開発された材料設計支援統合システムです。 また、当システムは、原子・分子スケールのシミュレーション技術を 基に各種の物性評価を行うための統合支援環境「MedeA」に搭載されており、 マテリアルズインフォマティクスに不可欠なシミュレーションによる 大量データ生成を簡便に行うことが出来ます。 そして、固体の電子状態については「MedeAVASP」、分子が対象で あれば「Gaussian」や「MOPAC」、力場計算であれば「MedeA-LAMMPS」 や「MedeA-GIBBS」を選択することができます。 当資料では、機能と特長、事例も含めご紹介します。 【掲載内容】 ■マテリアルズインフォマティクス ■MedeA-HT LaunchpadとStructure list ■MedeA-HT Descriptors ■適用事例：融点の推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOEフォーラム2018』では、医薬、農薬、化学、バイオ関連の企業、 研究機関、大学などから多くの研究者にご参加いただき、様々な 意見交換がなされました。 4名の先生方からはMOEの活用事例のご講演と、開発元のCCG社からは 次バージョンに搭載予定の新機能の紹介を行いました。 当社からは、実験研究者のためのMOE/webアプリケーションと その活用事例を紹介しました。 【招待講演】 ■創薬支援研究におけるインシリコ技術の活用事例の紹介 ■構造生物学解析が拓く、特徴的PPARγアゴニストへの合理的構造転換 ■分子設計におけるAI活用の動向と将来展望 ■硝化抑制剤の構造ベース創農薬 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア「Flow」を用いた DNA-seqデータ解析について紹介します。 「Partek Flow(Flow)」は、次世代シーケンサー（NGS）から出力された リード配列を読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータを解析することが可能です。 検出した変異のアノテーションや絞り込みや染色体ビューアーでの変異の表示など、 データ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【掲載内容】 ■DNA-seqとは ■SNVおよびIndelの検出 ■融合遺伝子の検出 ■コピー数変異の検出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「SciMAPS」は、、外部プログラムとの連携を前提とした、拡張性の高い 設計思想を持つ材料設計支援プラットフォームです。 使いやすいモデル構築機能、データ解析機能が標準装備され、大学や研究機関で 開発された世界的に定評のある先進の計算プログラムを統一された操作で利用できます。 最新版リリースに先立ち、開発元の研究者を招聘して6月末に開催された MOLSIS特別セミナーの報告とSciMAPS最新版の4.2の概要についてご紹介します。 【掲載内容】 ■MOLSIS特別セミナー ■SciMAPS 4.2リリース情報 　・粗視化モデルのサポート強化 　・LAMMPSの物性計算と解析機能の追加 　・Crosslinkerの改良 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

MedeAは原子・分子スケールのシミュレーション技術を基に各種の物性評価を 行うための統合支援環境です。 第一原理計算が比較的容易に行える現在において、データ生成を目的とし 異なるモデル構造に対して、同じ計算を繰り返し実行する場面が増えています。 「MedeA-HT 機能」を活用することで、そうした大量の繰り返し計算を 簡単に自動化することができます。 当資料では『MedeA-HT』を用いたSlater-Pauling曲線の作成例を示します。 Slater-Pauling曲線とは、合金中の組成の違いによる磁気モーメントの変化を プロットした図のことです。 【掲載内容】 ■本稿の概要 ■フローチャートを用いた計算の設定 ■計算結果 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『CDD Vault』は、米国Collaborative Drug Discovery（CDD）社により 開発された化合物情報とアッセイ情報を共有するクラウドサービスです。 「CDD VaultとELNモジュールの連携強化」をはじめ、 「ELN へのアッセイアノテーション付与」や「生物製剤情報の管理」、 「数値計算時に不等号を適切に保持」等を2018年に実装。 当資料では、特に重要な機能強化である最初の2点について紹介しています。 【掲載内容】 ■CDD Vaultとは ■CDD VaultとELNモジュールの連携強化 ■ELNへのアッセイアノテーション付与 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『CORINA Symphony 1.1』は、CORINA Classicのアルゴリズムを利用して 分子構造の標準化と三次元化をGUIのワークフローから実行できるように 拡張したソフトウェアです。 当資料では、主な機能について紹介しています。 「分子構造標準化」をはじめ、「分子構造三次元化」や「記述子計算」 について掲載しています。 【掲載内容】 ■CORINA Symphony 1.1概要 ■分子構造標準化 ■分子構造三次元化 ■記述子計算 ■ToxPrint 計算 ■データセット管理機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、III-V族化合物半導体で電子・光学デバイスのバンド構造 エンジニアリングに必要となる、固体エネルギーバンド構造の詳細を 計算するため、Hartree-Fock-DFTハイブリッド汎関数であるHSE06を用いた 事例について報告します。 InAsのエネルギーバンド、特にその微細構造を例として、精度の高い 第一原理電子状態計算を用いることで、実験に匹敵する精度と信頼性を持つ 材料特性のデータが得られることを示しました。 【掲載内容】 ■結晶構造 ■バンド構造計算 ■まとめ ■参考文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『MOE 2019.01』は、さまざまな分子のモデリングとシミュレーションに 対応する統合計算化学システム「MOE」の新バージョンです。 当資料では、代表的な新機能や機能強化を紹介。 リガンドと受容体間の結合自由エネルギー計算、pHや構造変化を考慮した タンパク質物性推算、実験情報に基づく立体配座予測、柔軟な原子ラベル設定が 新機能として追加されます。 【掲載内容（抜粋）】 ■リガンドと受容体間の結合自由エネルギー計算 ■MOEsaicアップデート ■柔軟な原子ラベル表示 ■pHや構造変化を考慮したタンパク質物性推算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『Partek Flow（以下Flow）』は次世代シーケンサーデータ 解析ソフトウェアです。 リード配列からバーコードやUMIのトリミング、参照ゲノム配列への アラインメント、UMIのデデュプリケーション、バーコードの絞り込みなど、 Single Cell RNA-seqの前処理に必要な機能を搭載しています。 当資料ではFlowを用いたSingle Cell RNA-seqデータ解析について ご紹介しています。 【掲載内容】 ■Single Cell RNA-seqとは ■バーコードやUMIの除去 ■UMIデデュプリケーション ■バーコードの絞り込み ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『ChemTunes＆ToxGPS』は、化合物の安全性評価とリスク評価のための 毒性・安全性に関連するデータベース（ChemTunes）と、知識ベースの 予測・ワークフローシステム（ToxGPS）を統合したプラットフォームです。 QSARモデルとケモタイプ・アラートの両方の予測結果を証拠の重み付けにより 評価することで全体の不確実性を最小限に抑え、最終的な結果を予測します。 医薬品、化粧品、食品、工業用およびその周辺化合物を対象としており、 化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができます。 【特長】 ■「ChemTunes」と「ToxGPS」を統合したプラットフォーム ■化合物の毒性学研究・安全性研究全般で利用することができる ■予測結果を証拠の重み付けにより評価することで全体の不確実性を 　最小限に抑える ※詳しくはPDFをダウンロード頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

当資料では、QFSSの概要と新機能、構造検索事例について掲載しています。 「MOE-QFSS」は、複数の巨大な化合物データベースに対して高速かつ 横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 新バージョンでは、公共データベースへのアクセスと MOE/web SOAPサーバーでの検索に対応しました。 さらに、QFSSのMOE/webアプリケーションを提供。それによって目的や 計算資源に応じたQFSSの実行環境を構築できます。 【掲載内容】 ■QFSS概要 ■QFSSによる検索 ■バージョンアップ内容 ■QFSSを用いた応用事例 ■QFSSの入手方法 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。