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次世代シーケンス解析の基礎知識・メリットを解説！具体的な解析事例も多数ご紹介※解析事例集進呈中
これから次世代シーケンス解析を検討されたい方に向けて、 具体的な解析事例を多数紹介した資料をダウンロードいただけます。 また実際の解析データや関連サービスを本資料内のリンクから閲覧する事も出来、 よりイメージしていただけ易い内容となっております。 ★下記「PDFダウンロード」ボタンより、資料をダウンロードいただけます。 〈掲載内容※一部抜粋〉 ■次世代シーケンス解析ってどんなメリットがあるの？ ■どんなサンプルを調べる事ができるの？ ■どういったデータが得られるの？ 当社ではお客様の目的に沿った各種プランを設けており、またご要望に応じたご提案を心がけております。 ご興味をお持ちいただけた方はお気軽にお問い合わせください。
短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析
外来DNAが目的位置も含め、ランダムにホストゲノムへ挿入（ランダムインテグレーション）された位置を決定することが可能です。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定に利用できます。 Tail-PCRやLAM-PCR、サザンブロットなどの従来のトランスジーン挿入位置決定法に比べて、短時間、簡便、高感度、低コストでの解析を実現します。
マウスやゼブラフィッシュ等の組織片、培養細胞ペレット等からDNA抽出、PCR、変異検出を行います。
大規模スクリーニングや1検体ごとの詳細解析等、ご要望に合わせた解析が可能です。検体数や解析内容に合わせてお見積りいたします。
国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定を、短時間・高感度・低コストで実現。
『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。 少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、 創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、 ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、 外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。 【特長】 ■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能 ■一度の解析で複数の挿入部位を検出可能 ■独自技術により再現性の高い結果が得られる 【解析事例】 ◎HTLV-1（ヒトT細胞白血病ウイルス）クロナリティ解析 少ないDNA量で素早く検出できるRAISING法の特長を活かし、 プロウイルス量0.032％でも高い検出感度を実現しています。 ◎ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出 CRISPR/Casで作製したノックインマウスについて、NGSとの組み合わせにより ノックイン効率とオフターゲットサイトの検出を行いました。 ※事例やサービスの詳細は「ダウンロード」から資料をご覧ください。
PCR-電気泳動解析やPCR-NGS解析など！リアルタイムPCR、デジタルPCRによる検出も可能
「ジェノタイピングやらなきゃいけないけど時間が無い」とお悩みの皆様、 手間のかかる作業はファスマックにお任せください。 当社の『ジェノタイピング解析』では、DNA抽出、PCR、変異検出を行います。 マウスやゼブラフィッシュ等の組織片、培養細胞ペレット等をお送り ください。ご希望の検体数や解析内容に合わせてお見積りいたします。 また、リアルタイムPCR、デジタルPCRによる検出も可能です。 【ラインアップ】 ■PCR-電気泳動解析：大きめのindel検出やHMAによるスクリーニング ■PCR-サンガーSeq解析：小さなindelや1塩基置換の検出 ■PCR-NGS解析：モザイク変異を詳細に解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
アンプリコン解析やゲノムドラフト解析など！次世代シーケンス解析についてご紹介
ファスマックでは、『次世代シーケンス解析』を承っております。 サンガー法によるDNA解析は広く普及している技術であり、現在は 「遺伝子診断」といったかたちで一般の人にも少しずつ認知されつつあります。 当社は、イルミナ社のMiSeqでの受託サービスを行うことによって、 次世代シーケンサーでの解析をより多くの人達に利用していただき、 将来的にはサンガー法のような普及技術とすることを会社のミッションと 位置づけております。 【ラインアップ】 ■アンプリコン解析 ■ゲノムドラフト解析 ■カスタムサービス ・サンプル調製 ・Miseqでのrun ・データ解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られる！HTLV-1クロナリティ解析事例をご紹介
当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 HTLV-1(ヒトT細胞白血病ウイルス)は主にCD4陽性T細胞に感染し、 そのプロウイルスが宿主ゲノムにランダムに挿入します。 現在、成人T細胞白血病の診断にはサザンブロット法(HTLV-1クロナリティ解析)を 用いたHTLV-1感染細胞の白血病化(モノクローナル増殖)の検出が必須とされて おりますが、大量のDNA(血液)を要する、長時間で複雑な工程を必要とする、 検出感度は十分ではないなど種々の問題を抱えています。 RAIS法は、これらの問題を全て克服した方法であり、HTLV-1クロナリティ解析に おいては高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られております。 【RAIS法によるランダムインテグレーション解析サービス 内容】 ■サンガーシーケンスプラン ■次世代シーケンス(NGS)プラン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
小さなindelや1塩基置換の検出！当社のジェノタイピング解析をご紹介
ファスマックでは、『PCR-サンガーSeq解析』を承っております。 サンガー法による塩基配列解析で電気泳動解析では検出できない 1塩基置換の有無や数塩基の塩基欠損/挿入も確認可能。 検体は、マウス/ラット/ゼブラフィッシュ/メダカ 組織片、培養細胞 ペレット等で、納品物はシークエンス解析データとなります。 ご用命の際は、お気軽にお問い合わせください。 【解析詳細】 ■納期：1～2週間 ■検体：マウス/ラット/ゼブラフィッシュ/メダカ 組織片、培養細胞ペレット等 ■納品物：シークエンス解析データ ■解析装置：Applied Biosystems 3730xl DNAアナライザ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
モザイク変異を詳細に解析！Illumina MiSeqを使用したジェノタイピング解析をご紹介
ファスマックでは、『PCR-NGS解析』を承っております。 次世代シークエンサーを用いて変異の種類と頻度を詳細に解析。 解析装置は「Illumina MiSeq」を使用し、1つのターゲットサイト （16サンプルまで）をまとめて解析します。 価格、納期など詳細に関しては、お気軽にお問い合わせください。 【解析詳細】 ■1つのターゲットサイト16サンプルをまとめて解析 ■実施例：培養細胞でのノックアウト ■解析装置：Illumina MiSeq ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
通常10,000程度のデータと、マイナーなグループのデータが得られる事例をご紹介！
当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った 各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “細菌叢の解析”の例では、PCR産物を解析対象として直接塩基配列を 決定し、通常10,000程度はデータが得られます。 さらに、クローンライブラリー法では得ることが非常に難しかった マイナーなグループのデータを得ることができます。 【事例概要】 ■PCR産物を解析対象として直接塩基配列を決定 ■得られる塩基配列のデータは通常10,000を超える ■マイナーなグループのデータが得られる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施した事例をご紹介します！※解析事例集進呈中
当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った 各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “野生生物の食性解析”の例では、MiSeqを用いた解析で腸内細菌叢の 解析と同様にPCR産物を直接解析。 具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコード オブライフ・イニシャチブで動物のバーコーディングに用いられている COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を行います。 【事例概要】 ■MiSeqを用いた解析では腸内細菌叢の解析と同様にPCR産物を直接解析 ■具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、 COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
次世代シーケンスを利用することで、より高い解像度でジェノタイピングを行うことが可能！※解析事例集進呈中
ゲノム編集技術は自由な遺伝子改変を可能にするパワフルなツールですが、 改変個体を選抜する上で、遺伝型解析(ジェノタイピング)は重要な工程です。 次世代シーケンスにより、F0世代でのアリル頻度を評価することで、 交配に用いるべき個体選抜を行うことが可能。 また、培養細胞のゲノム編集実験では1度の実験で多様な変異を持つ 細胞集団が得られ、実験条件によって変異の様子が異なります。 次世代シーケンスなら細胞集団の変異を詳細に評価することが出来ます。 【事例概要】 ■CrispRvariantを用いた培養細胞のジェノタイピング ■CRISPR/Casでゲノム編集した培養細胞株からDNA抽出後、 ターゲットアンプリコンシーケンスをMiseqにて実施 ■得られたデータをCrispRvariantにて解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
微生物群集構造解析の結果や、主座標分析、レアファクションカーブなどをご紹介！※解析事例集進呈中
土壌サンプルの自社データをご紹介します。 当データは、4地点について各4サンプル解析した結果です。 MiSeqでの取得データについては各サンプルおよそ10万リード程度 得られています。 納品データはhtml形式のファイルが含まれており、グラフ等は webブラウザでの閲覧が可能なので、ぜひ関連リンクよりご覧ください。 【概要】 ■16SrRNAのV4領域のデータを用いた微生物群集構造解析の結果 （門レベルの分類） ■OTU heatmap ■主座標分析（PCoA） ※オプション ■レアファクションカーブ ※オプション ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
様々な研究支援アプリケーションを取り揃え、研究ステージに応じたアプローチが可能。ぜひ一度当社へお問い合わせください。
〈株式会社ファスマックの強み・特長〉 ■世界水準の検査、製造技術 ISO17025認証、ISTA認証、ISO9001認証 ■研究開発への取り組み GM食品標準分析法、GM種子スクリーニング技術、他多数 ■充実したインフラ、販売ルート 各種DNA解析装置、技術者多数在籍 各種研究機関への販売ネットワーク構築済 〈研究開発の実績※一部〉 ■ゲノム編集技術 CRISPR/Cas法の改良 東京医科歯科大学、広島大学、慶応義塾大学との共同研究 ■ランダムインテグレーション解析 国立感染症研究所との共同研究 ■分子数担保DNA標準物質 株式会社リコーとの共同研究 ■DNAクロマトグラフィー方を用いた皮膚常在菌検出キットの開発 日本メナード株式会社との共同研究 ※お困りごとがあれば、ぜひ一度当社宛にお問い合わせください。 既存のプラットフォームに新しい付加価値を。是非皆さまと取り組めたらと考えております。
現在開発されているDNA鑑定法やDNA品種識別法として多数使用されています！
『フラグメント解析』は、お客様が蛍光プライマーを用いて増幅した PCR産物を送付していただき、シーケンサーによるキャピラリー電気泳動で フラグメント長を判定します。 当社では、DNA品種検査や技術開発にお役立てができるように、 キャピラリーシーケンサーを用いたフラグメント解析を実施。 また、お客様のニーズに応じたご提案ができればと思いますので、 まずはお気軽にお問合せ下さい。 【DNAシーケンスサービスの特長】 ■国内での解析のため、きめ細やかで迅速な対応が可能 ■専門のスタッフが全てのデータを目視で確認 ■シーケンサーはメーカーによる正規メンテナンス済 ■データの改善が見込まれるサンプルについて再泳動を実施 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
