更新日： 集計期間:2025年11月26日～2025年12月23日
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自己組織化構造予測/分子膜透過性推算ソフトウェアの概要などを詳しく解説！
新製品「COSMOplex」「COSMOperm」が正式リリースされました。 両製品は、これまで分子膜・ミセル内分子分布シミュレーターとして 提供されていたCOSMOmicを改良・発展させた製品です 当資料では、両製品の概要と応用事例を紹介しています。 【掲載内容】 ■COSMOmicとCOSMOplex ■COSMOperm ■応用事例：ミセル構造予測とミセル内の分布予測 ■応用事例：低分子の上皮透過性予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
熱力学物性推算ソフトウェアの新機能などを詳しく解説！
熱力学物性推算ソフトウェア「COSMOtherm」の新バージョン19が リリースされました。 当資料では、新バージョンに搭載された新機能や改良された機能を 紹介しています。 【掲載内容】 ■新バージョンのトピックス ■状態方程式(EoS)を用いた物性推算機能の追加 ■液液平衡探索と共晶点探索機能 ■BP-TZVPD-FINEレベルの物性推算精度の向上 ■活量係数モデルへのフィッティング機能の強化 ■COSMO-RS-DARE機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
6月にリリースされました『SciMAPS 4.3』の概要について紹介します
材料設計支援プラットフォーム『SciMAPS』の各計算プログラムは、 計算プログラム本体とそれに対するインターフェースから構成される プラグインとして提供されます。 基本環境である「Platform」に各プラグインを追加することにより研究に 適した環境を取り揃えることができます。 当資料では、6月にリリースされました4.3 の概要について紹介します。 【掲載概要】 ■リリース概要 ■SAFT-γ Mie力場 ■MesoAtom converter ■Size distribution ■VOTCA Plug-in ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
類似の官能基を同じ色で表現することで、研究者によるヒット構造からの適切な選択を支援します
『infiniSee』は、既存の化合物ライブラリーあるいは、10^20個を超える バーチャル化合物群の中より類似構造を高速に探索するソフトウェアです。 新規構造、SAR展開、特許を回避した構造など、目的に応じた候補構造を 簡単な操作で発見できます。 創薬における加速化と低コスト化を実現します。 【特長】 ■超高速ケミカルスペースナビゲーション 分単位で10^20構造を探索 ■容易なスキャフォールドホッピング FTreesFSアルゴリズムを用いた構造構築 ■構造類似性の可視化 分かりやすい表示による候補構造の決定 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ！
『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 （水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。 得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。 【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成 ■相互作用しているアミノ酸の種類や原子などを分かりやすく2次元で表示 ■操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ ■作成された図は、Protein Data Bankの公式の相互作用図として採用されている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
110億化合物の中からリガンド候補を超高速検索できるツールをご紹介
『REAL Space Navigator』は、Enamine社における110億構造におよぶ バーチャル化合物群の中からクエリー化合物に類似の構造を 高速に探索するツールです。 ヒットした構造は同社により実際に合成できる可能性が高く、ユーザーは スキャフォールドホッピングされた新規化合物をオンデマンドに入手可能。 当製品による検索は、BioSolveIT社のFTrees-FSの類似構造構築手法に 基づいて行われます。 【特長】 ■110億通りのバーチャル化合物の中から、まだ発見されていない 新規リガンド候補を超高速に探索 ■クエリー化合物が持つ化学的な特長とその2次元的な位置が類似する 構造を簡単かつ効率的に得ることができる ■ヒット構造をEnamine社に合成依頼が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
固体表面への原子団の継続的な堆積を自動的に実行することができます
当資料では、『MedeA Deposition』の力場計算によるシミュレーションを ご紹介します。 『MedeA Deposition』は固体表面への原子・分子の堆積、吸着といった 現象を力場計算によってシミュレートするためのツールです。 工業的に重要なさまざまなプロセスに関する知見を得るための有益な手段 となります。 【掲載概要】 ■概要 ■機能 ■適用範囲 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
【新製品情報】今回のバージョンアップでソフトウェア全体のコードが見直されています
MedeA のメジャーバージョンアップは、2.0 がリリースされて以来、 実に15年ぶりとなります。 今回のバージョンアップではソフトウェア全体のコードが見直され、 現在の使用環境に適した改善が数多く実施されております。 バージョン 3.0 においてMedeA は、さらに使いやすい環境へと進化しました。 【特長】 ■VASP 5.4.4をサポート ■アイコンの図柄やウィンドウの色等を含めユーザーインターフェースが刷新 ■ソースコードの見直しを行ったことでモデル構造の表示機能が大幅改善 ■新しいモジュールとしてMedeA-QT、MedeA-HT-Descriptors がリリース ■ReaxFFポテンシャルがサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Direct Force Fieldの力場パラメーターアサインから分子動力学計算までの力場計算機能をご紹介
Aeon Technology 社は高精度分子シミュレーション支援ソフトウェア 「Direct Force Field」を通じ、力場データベースから力場開発ツールまで 力場計算に関するさまざまなツールを提供しています。 当資料では、Direct Force Field (DFF) の力場パラメーターアサインから 分子動力学計算までの力場計算機能についてご紹介いたします。 【掲載内容】 ■はじめに ■分子構造の作成 ■形式電荷のアサイン ■モデル分子へのパラメーターアサイン ■分子動力学計算用入力ファイルの生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MedeA-Deformation:分子動力学計算による塑性変形の取り扱いについて掲載！
『MedeA』は、第一原理計算や力場計算を基に材料の様々な物性を 算出することができる材料設計支援統合システムです。 当資料では、塑性領域における物性予測のため、応力ひずみ曲線を 算出するツール「MedeA-Deformation」について、カーボンナノチューブへの 適用事例を交えてご紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■MedeA-Deformation ■CNTの引張変形 ■弾性領域の取り扱い ■まとめ ■謝辞 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
NMRスピン-スピン結合定数の計算やPBC計算におけるハイブリッド汎関数への対応などを掲載！
高速量子化学計算ソフトウェア『BIOVIA TURBOMOLE』の新バージョン7.5と グラフィカルユーザーインターフェース（GUI）TmoleX 4.6が リリースされました。 当資料では、新バージョンに搭載された新機能や改善された機能について 紹介します。 ぜひ、ご一読ください。 【掲載内容】 ■バージョンアップのトピックス ■NMRスピン-スピン結合定数の計算 ■PBC計算におけるハイブリッド汎関数への対応 ■Damped response法による吸収スペクトル、および周波数依存分極率計算 ■光学スペクトル情報に基づく色予測ツール ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
研究開発における知識の共有を促進！より簡単にデータの管理を行えるようになりました
Scilligence社では、電子実験ノートを中心にプロジェクト管理や在庫管理など、 研究情報を一元管理できるウェブベースの研究情報管理統合プラットフォームを 提供しています。 電子実験ノート「ELN」、分子情報・アッセイデータ登録システム「RegMol」、 在庫管理システム「Inventory」の各製品では低分子化合物から核酸・ ペプチド・タンパク質・抗体などの生体高分子、細胞株や生体組織まで、 多様なモダリティのデータを一元的に取り扱えます。 当資料では、version 6.5およびversion 6.6で実装された新機能について ご紹介しています。 【掲載内容（抜粋）】 ■Scilligence社製統合プラットフォームの特長 ■プロジェクトメンバーの追加 ■一括編集機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
格子振動に起因するエントロピーの値の算出が可能！生成エネルギー自動計算機能について解説
「MedeA」は、第一原理計算や力場計算を基に材料の様々な物性を 算出することができます。 当資料では、新しいバージョン『MedeA 3.2』で「MedeA-VASP」 インターフェースに搭載された生成エネルギー自動計算機能について 解説しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■MedeA-VASPと生成エネルギー自動計算機能 ■生成エネルギーと標準生成エンタルピーの比較 ■格子振動効果の考慮 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
PESの自動探索機能の他、AMSの各計算エンジンなどについてご紹介！
『AMS』は、量子化学計算プログラムのADFをはじめとする計算化学統合 パッケージです。 AMSの新バージョン2021では、各計算エンジンに対して構造最適化やMDなどを 統一的に行うためのツール“AMS driver”に新たに反応経路自動探索機能が 追加されました。 当資料では、今回追加されたPESの自動探索機能の他、AMSの各計算エンジン （ADF・BAND・DFTB・ReaxFF・COSMO-RS）、その他ツールの主な新機能に ついて紹介しています。 【掲載内容】 ■AMS driverによる反応経路の自動探索 ■AMSの各計算エンジン・ツールの主な新機能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
電解液などのイオンを含む系に対応することが可能！COSMO-RS-ES法をご紹介します
熱力学物性推算ソフトウェアBIOVIA COSMOthermの新バージョン2021に 搭載されたCOSMO-RS-ES（ES：Electrolyte System）法を紹介します。 COSMO-RS-ES法は、COSMO-RS法とPizter-Debye-Huckel モデルを 組み合わせた方法で、COSMO-RS法では考慮が難しい電解液などの イオンを含む系に対応することが可能になります。 “COSMO-RS-ES法の推算事例”などを掲載しておりますので、 ぜひご一読ください。 【掲載内容】 ■COSMO-RS-ES法 ■COSMO-RS-ES 法の推算事例： 酢酸カリウムを添加した酢酸メチル―メタノールの定圧気液平衡 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
