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これから次世代シーケンス解析を検討されたい方に向けて、 具体的な解析事例を多数紹介した資料をダウンロードいただけます。 また実際の解析データや関連サービスを本資料内のリンクから閲覧する事も出来、 よりイメージしていただけ易い内容となっております。 ★下記「PDFダウンロード」ボタンより、資料をダウンロードいただけます。 〈掲載内容※一部抜粋〉 ■次世代シーケンス解析ってどんなメリットがあるの？ ■どんなサンプルを調べる事ができるの？ ■どういったデータが得られるの？ 当社ではお客様の目的に沿った各種プランを設けており、またご要望に応じたご提案を心がけております。 ご興味をお持ちいただけた方はお気軽にお問い合わせください。
『フルーツ検出用プライマー』は、“特定原材料に準ずるもの”として 指定されている「りんご」「もも」「キウイフルーツ」について、食品中の DNAをPCR法にて検出する試薬です。各種食品等の品質管理にご使用下さい。 また当社では、消費者庁通知法指定の検査試験法に従い、食品中の 特定原材料の検査を行います。 簡易検査から確認検査まで、幅広い検査メニューをご用意。 国際的検査制度評価試験から安定して高い検査制度を評価されています。 【特長】 ■「りんご」「もも」「キウイフルーツ」について、食品中のDNAを PCR法にて検出 ■各種食品等の品質管理に使用可能 ■お試し用の無償サンプルを承っている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当製品は、虫に由来する異物を同定するためのプライマーセットです。 現在主流の形態的特長を指標とした同定とは異なり、DNA塩基配列を 指標としているため、熟練技術を必要とすることなく、正確に虫種を 同定することが可能。御社の品質管理ツールの一つとしてお使い下さい。 また、近年、食の安全・安心に関する消費者の関心は高まっており、 特に食品に混入する異物は消費者が食品に対して マイナスイメージを抱く 大きな要因となっています。 お客様への信頼性確保と品質向上のために、当社ではより高品質な 異物同定検査をご提供します。 【特長】 ■cytochrome c oxidase subunit I遺伝子、16SリボソームRNA遺伝子中の 虫種の違いを反映する領域を増幅するようにプライマーを設計 ■短い塩基配列を指標とするため、加熱加工処理を受けた虫異物も同定可能 ■3つのプライマーセットを組み合わせることで、より正確な判定が可能 ■お試し用の無償サンプルを承っている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当製品は、植物に由来する異物を同定するためのプライマーセットです。 現在主流の形態的特長からの同定とは異なり、DNA塩基配列を用いた、 より客観性のある同定方法です。品質管理ツールの一つとしてお使い下さい。 また、近年、食の安全・安心に関する消費者の関心は高まっており、 特に食品に混入する異物は消費者が食品に対して マイナスイメージを抱く 大きな要因となっています。 お客様への信頼性確保と品質向上のために、当社ではより高品質な 異物同定検査をご提供します。 【特長】 ■植物種ごとに特異的な領域(ITS)を増幅するようにプライマーを設計 ■植物全般を増幅し、カビ・酵母は増幅しない ■PCR増幅産物が約350～400bpと短めなので、DNAが加熱等で 損傷していても増幅し易い ■お試し用の無償サンプルを承っている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
「PNA(ペプチド核酸)」は、DNA類似の構造をもつ非天然の化合物です。 その構造はDNAやRNAとは異なり、リン酸結合ではなくペプチド結合で 骨格を形成している事よりペプチド核酸と呼ばれています。 アンチセンスやプローブとして優れた特性を有します。 従来のDNAに見られたリン酸基による 負電荷の反発が解消されているために、 より強くハイブリダイズし、相補鎖認識力も向上しています。 また『PNA合成』は、韓国のpanagene社に委託しております。 正式なお見積りにつきましては、配列やご希望の収量等の情報をお送り いただきまして、panagene社での合成の可否を確認後となります。 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『フラグメント解析』は、お客様が蛍光プライマーを用いて増幅した PCR産物を送付していただき、シーケンサーによるキャピラリー電気泳動で フラグメント長を判定します。 当社では、DNA品種検査や技術開発にお役立てができるように、 キャピラリーシーケンサーを用いたフラグメント解析を実施。 また、お客様のニーズに応じたご提案ができればと思いますので、 まずはお気軽にお問合せ下さい。 【DNAシーケンスサービスの特長】 ■国内での解析のため、きめ細やかで迅速な対応が可能 ■専門のスタッフが全てのデータを目視で確認 ■シーケンサーはメーカーによる正規メンテナンス済 ■データの改善が見込まれるサンプルについて再泳動を実施 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『Cas9 タンパク質』は、CRISPR/Casによるゲノム編集で良く使用されている 2本鎖切断型です。 保存温度は-20℃以下。容量が100μgの「GE-005-S」と、100μg x3の 「GE-005-L」をラインアップしています。 当社では、CRISPR/CAS系のゲノム編集技術における高効率なノックイン/ ノックアウトを実現する好適なゲノム編集ツール「Genome Craftシリーズ」を ご提供いたしております。 【特長】 ■CRISPR/Casによるゲノム編集で良く使用されている2本鎖切断型 ■保存温度：-20℃以下(長期保管は-80℃推奨) ■保存バッファー：10mM Tris-HCl(PH7.5), 300mM NaCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 50％Glycerol ■タンパク質由来：Recombinant E. coli ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ゲノム編集ツールである『Genome Craft』の使用例をご紹介します。 Cas9蛋白質とsgRNA又はcrRNA+tracrRNA、基質DNA断片を混合し、 DNA切断実験を行いました。37℃にて1時間インキュベート後、 アガロースゲル電気泳動を実施。 バンドのシフトが確認されたことから、sgRNA、crRNA+tracrRNAとも 良好なDNA切断活性が確認されました。 この他に、「In vivo Genome Editing」や「ダブルノックアウト」や 「遺伝子ノックイン(マウス)」などの使用例もあります。 【使用例】 ■In vitro digestion assay ■In vivo Genome Editing ■ダブルノックアウト(ゼブラフィッシュ) ■遺伝子ノックイン(マウス) ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
〈株式会社ファスマックの強み・特長〉 ■世界水準の検査、製造技術 ISO17025認証、ISTA認証、ISO9001認証 ■研究開発への取り組み GM食品標準分析法、GM種子スクリーニング技術、他多数 ■充実したインフラ、販売ルート 各種DNA解析装置、技術者多数在籍 各種研究機関への販売ネットワーク構築済 〈研究開発の実績※一部〉 ■ゲノム編集技術 CRISPR/Cas法の改良 東京医科歯科大学、広島大学、慶応義塾大学との共同研究 ■ランダムインテグレーション解析 国立感染症研究所との共同研究 ■分子数担保DNA標準物質 株式会社リコーとの共同研究 ■DNAクロマトグラフィー方を用いた皮膚常在菌検出キットの開発 日本メナード株式会社との共同研究 ※お困りごとがあれば、ぜひ一度当社宛にお問い合わせください。 既存のプラットフォームに新しい付加価値を。是非皆さまと取り組めたらと考えております。
【特徴】 ■1ランあたり最大640Gのシーケンスデータのアウトプットを実現 ■イルミナ社のシーケンサーと変わらないデータクオリティ ■安価、データ増量、多検体解析を実現 イルミナ社製Next-seqとDNB-SEQの比較(RNA-seq)の比較データについてwebサイトで公開しております。
当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 アグロバクテリウム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い、サンガー法による挿入部位配列の確認、ならびに次世代シーケンス解析から得られた解読配列を元にゲノム配列へマッピングを行いました。 結果として、動物培養細胞、ならびに植物細胞への挿入位置決定として本手法が有効である事が確認出来ました。 【RAIS法によるランダムインテグレーション解析サービス 内容】 ■サンガーシーケンスプラン ■次世代シーケンス(NGS)プラン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 ※事例については下記のURLをご参照ください。
当資料では、JFS規格に取り組む目的や適合証明取得までの流れなどを 掲載しております。 HACCP制度化の施工スケジュールをはじめ、JFS規格の種類についてや、 JFS-A/B規格 適合証明取得までについて図やイラストを用いて詳しくご紹介。 是非HACCPに関する取り組みにご活用ください。 【掲載内容（一部）】 ■HACCP（ハサップ）について ・HACCP制度化の施工スケジュール ・HACCPのイメージ ・衛生管理のPDCAサイクル ■JFS規格について ・民間証明の活用 ・JFS規格の種類 ・JFS規格 適合証明・認証の組織数 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社では、DNA/RNA受託合成サービスを行っております。 架橋型の人工核酸(LNA)、2’F(フルオロ)化 RNA、2’MOE (2’-O-methoxyethyl) RNA、2’-OMe RNAなど幅広い核酸合成に対応。 アンチセンス研究用途、デュアルラベルプローブへの部分導入などに ご利用いただくことができ、DNA,RNAへの挿入、各種修飾品との組み合わせも 可能でございますのでご相談ください。 【概要】 ■核酸誘導体 ・人工核酸(LNA) ・2’F(フルオロ)化 RNA ・2’MOE (2’-O-methoxyethyl) RNA ・2’-OMe RNA ■ヌクレアーゼ耐性付加修飾 ・S-Oligo(Phosphorothiate） ・Inverted dT など ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
細菌や真菌の分類･同定は、従来は顕微鏡下による形態観察や 分離培養による方法などが行われています。しかし、培養法での同定は 経験によるところが大きいといわれています。 このような中、注目を集めているのが、遺伝子解析技術を利用した方法です。 高い識別能や再現性が期待できる解析結果を得られるという利点があります。 当社では、遺伝子解析技術を利用した微生物種の同定検査サービスを開始。 貴社の品質管理に是非お役立て下さい。 【特長】 ■シーケンス解析による高い識別能、再現性 ■高精度データベースによる高い信頼性 ※Applied Biosystems『MicroSeq ID システムデータベース』使用 ■細菌、真菌（カビ、酵母） どちらにも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
近年、食の安全・安心に関する消費者の関心は高まっており、 特に食品に混入する異物は消費者が食品に対して マイナスイメージを抱く 大きな要因となっています。 お客様への信頼性確保と品質向上のために、当社ではより高品質な 異物同定検査をご提供します。 【検査内容】 ■スクリーニング検査 ■植物異物DNA検査 ■虫異物DNA検査 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社では、消費者庁通知法指定の検査試験法に従い、食品中の 特定原材料の検査を行います。 簡易検査から確認検査まで、幅広い検査メニューをご用意。 国際的検査制度評価試験から安定して高い検査制度を評価されています。 また、お客様のご要望にお応えし、通知法に記載されていない 当社独自のオプション検査も取り揃えております。 お気軽にご相談ください。 【特長】 ■豊富な検査実績と高い技術力 ■簡易検査から確認検査まで、幅広い検査メニューをご用意 ■検査内容のご提案や英文報告書の作成など柔軟なサービスで対応 ■特定原材料に準ずる品目の多くにも対応 ■ISO/IEC 17025試験所認定を取得 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社の「種苗検査」は、国際機関の検査方法に則って実施しています。 病理検査では、ISTA、ISHI、IPPCに公示されている検査方法を採用。 植物防疫法において「検疫有害動植物」に指定されている植物病原微生物を 中心にラインアップをとりそろえています。 貴社の品質検査と併せて、外部検査・外部証明としてご利用下さい。 【特長】 ■ISTA、ISHI、IPPCに公示されている検査方法を採用 ■植物病原微生物を中心にラインアップ ■国際機関の検査方法に則って実施 ■品質検査と併せて、外部検査・外部証明として利用可能 ■ISTA国際種子検査証明書(Blue Certificates)の発行が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当製品は、植物病原体（TYLCV, Aac, MYSV）に対する抗体を用いた 金コロイド免疫イムノクロマト法により、感染の疑われる部位から 病原体を検査するキットです。 Aac検出キットでは、培養した菌株（コロニー）からの検定も可能。 検査試料と抽出液の摩砕液をテストストリップに滴下し、 判定までの所要時間は、TYLCVおよびMYSVで15～30分、Aacで10～15分です。 ★ご好評につきキャンペーン期間をさらに延長！ 2022年3月末日まで、10,000円/キット。 【ラインアップ】 ■トマト黄化葉巻ウイルス ■ウリ科野菜果実汚斑細菌病菌 ■メロン黄化えそウイルス ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『ナノトラップEasy』は、ふき取り液・すすぎ水専用 食物アレルゲン検査キットです。 個別アレルゲンを高感度に検出。タンパク残留検査からの 切り替え・併用で洗浄確認の信頼性が高まります。 また、抽出液・希釈液を使用しませんので、製造現場での検査にも ご使用いただけます。 【特長】 ■前処理不要で簡単・迅速 ■試薬不使用 ■取扱いやすい ■アレルゲンタンパク質を0.5ppmから検出 ■個包装&10本入り ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
【特徴】 ■加熱や加圧等の加工の有無によらず検査が可能 ■幅広い検体（製品、半製品、原料、ふき取り検体等）に適用 ■偽陽性反応が少ないため、より正しい検査結果が得られます ■粘性が高い検体も検査が可能 ■検査溶液滴下後15分で迅速に特定原材料の混入を判定できます （準備から判定まで30～60分） ■結果は目視判定可能、特別な機器を必要としません
『モリナガFASPEKエライザII』は、平成22年9月10日付消食表第286号 「アレルギー物質を含む食品の検査方法について」の基準を満たした 改良検査キットです。 従来キットと比べ、抽出液に毒物を使用しておらず、試薬管理と 環境負荷を低減。 また、簡易検査キット「ナノトラップII R」と抽出液が共通の為、 ナノトラップIIRで陽性になった検体の抽出液を、そのまま当製品で 数値化することが可能となり、 大幅な時間短縮が可能です。 【特長】 ■高効率にタンパク質を抽出 ■1ppm付近まで優れた再現性を示す ■反応時間は1時間50分と短い ■特定原料タンパク質として0.31ppmから定量可能 ■各社の通知準拠ELISAキットにも採用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社では「監査・コンサルティング（HACCP制度化へのサポート）」を 行っております。 HACCP対応への現状把握診断をはじめ、JFS規格取得支援や、JFS規格審査など お客様のご要望や現状に沿ったサポートをご提供。 "HACCP（ハサップ）制度化にどう対応したらよいか分からない" "現状の施設・設備ではHACCP制度化に対応できるか不安" この様なお悩みをお持ちの方は当社までお問い合わせください。 【HACCP制度化へのサポート内容】 ■HACCP制度化対応のお手伝い ・HACCP対応への現状把握診断 ・HACCPに関する従業員講習 ・HACCPプランの作成のお手伝い など ■JFS規格取得支援 ■JFS規格審査 ■食品衛生に関わる受託検査 ■検査キットの販売 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
本製品は、2×プレミックスタイプのPCR用試薬です。 PCRに必要なTaq DNA Polymerase、dNTPs、Mg2+等を含むため、 鋳型DNAとプライマー対を加えるだけでPCRを行うことが可能。 本製品に含まれるTaq DNA Polymeraseは、ホットスタートPCR用のもので、 PCRスタート時の温度上昇の過程において、ミスアニールした プライマーによって増幅産物が生じるのを防ぎます。 【特長】 ■最適化されたバッファー組成により、特異性の高いPCRが可能 ■プレミックスタイプのため、煩雑な試薬調製が不要 ■TdT活性を有するため、PCR産物をTAクローニングに用いることが可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
本製品は、血液、動物組織、植物、細菌、真菌、食品等の様々な試料から 簡便にDNA抽出するための試薬です。 およそ15分間という短い操作時間でDNAを抽出することが可能。 得られたDNA溶液は、PCRやリアルタイムPCR等に鋳型として用いることができます。 【特長】 ■ワンチューブで抽出が可能 ■作業は熱処理と遠心分離のみ ■操作時間は約15分間 ■抽出DNAは遺伝子検査の鋳型へ使用可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
本製品は、2×プレミックスタイプのリアルタイムPCR用試薬です。 リアルタイムPCR（蛍光プローブ法）に必要な耐熱性DNAポリメラーゼ、Mg2+、 Passive Reference Dye、至適化されたバッファー等を含んでいるため、 鋳型DNAとプライマー対、プローブを加えるだけで使用が可能。 本製品に含まれる耐熱性DNAポリメラーゼは、ホットスタートPCR用に 調製されており、95℃、10分間の熱処理を行うことにより活性化します。 【特長】 ■特異性の高いリアルタイムPCRが可能 ■煩雑な試薬調製は不要 ■各種リアルタイムPCR装置（プレートタイプ）に対応 ■パッシブリファレンス色素が予め添加 ■UNG（Uracil-N-Glycosylase）を別途添加することで キャリーオーバー防止処理が可能(本製品にUNG は含まれていません) ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
本製品は、土壌及び糞便サンプルから DNA を抽出するためのキットです。 抽出方法として界面活性剤による化学的な溶菌とBeads Beating による 物理的な菌体破砕を併用。 DNA回収用メンブレンを装着したスピンカラムを用いた遠心操作でDNAを 回収する方法を採用しており、簡便、迅速にDNA抽出を行うことが可能です。 【特長】 ■化学的な溶菌と物理的な菌体破砕を併用 ■Beads Beatingにより強固な細胞壁を持つ微生物からも DNA を抽出することが可能 ■エタノール沈殿による核酸調製は不要であり、簡便、迅速にDNA抽出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
【特長】 ■ 短納期・・・全国どこでも翌日納品 ■ 利便性・・・10nmol保証と希釈不要ですぐに使える濃度調整 ■ 高品質・・・逆相カラム精製が標準グレード 全国どこでもご注文いただいた翌日にお届けが可能です！ 全て国内ラボでの合成対応、1本のご注文から配送料金がかかりません。 5μMや10μMといったReady-to-Useな濃度に標準で対応しております。 納品後、いっさい希釈する事なくそのまま実験にご利用いただけますので大変便利です。 スタンダードな精製グレードに逆相カラム精製を採用しており、 全製品について「TOF-MASS」、もしくは「キャピラリー電気泳動」による品質検査を実施！ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
土壌サンプルの自社データをご紹介します。 当データは、4地点について各4サンプル解析した結果です。 MiSeqでの取得データについては各サンプルおよそ10万リード程度 得られています。 納品データはhtml形式のファイルが含まれており、グラフ等は webブラウザでの閲覧が可能なので、ぜひ関連リンクよりご覧ください。 【概要】 ■16SrRNAのV4領域のデータを用いた微生物群集構造解析の結果 （門レベルの分類） ■OTU heatmap ■主座標分析（PCoA） ※オプション ■レアファクションカーブ ※オプション ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
選択的膜透過性色素EMAを用いた群集構造解析(自社データ)をご紹介します。 大腸菌が優占した環境サンプルについて、熱処理して殺菌したサンプルと 処理しないサンプルを調整し、EMA処理を行いました。その後、各サンプルに 対してDNA抽出を行い、16Sr RNA遺伝子アンプリコン解析を実施。 その結果、群集構造解析では優占化した大腸菌が死滅したことによって 熱処理したサンプルでは大腸菌はほとんど検出されませんでした。 この他、関連リンクでは、RNAからの逆転写cDNAによる群集構造解析 (自社データ)もご紹介しているので、ぜひご覧ください。 【ワークフロー】 ■環境サンプル(熱処理、未処理)を用意 ■EMA処理 ■光照射 ■DNA抽出 ■EMA-PCRによるアダプターライブラリーの作成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
京都大学生態学研究センターでは、カエデ属を利用するハマキホソガの 多様化や種同士での共存に関わるプロセスを研究されております。 当社が一部解析を受注いたしましたのでご紹介します。 本解析ではハマキホソガ特異的なブロッキングプライマーを使うことで ホスト由来の遺伝子の増幅を抑えることを可能とし、ホストである ハマキホソガの同定及び体内の寄生者の網羅的な探索を効率的に実施。 ブロッキングプライマーを用いた解析手法が、外見から検出が困難な ホストと寄生者の関係を解明する上で有効な手段であることを見出しました。 【事例概要】 ■ブロッキングプライマー存在下/非存在下でPCRを実施 ■ハマキホソガ幼虫274検体についてCOIアンプリコン解析をMiseqにて実施 ■得られたリードから、ハマキホソガ10種と寄生蜂13種を同定し、 ホスト-寄生者の関係を解明 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
魚類のDNAメタバーコーディングに使用されるMiFishを用いて 解析した例をご紹介いたします。 相模川水系の複数地点にて採水を行い、ポリタンクにプールし、 DNAの劣化を防ぐため、採水直後にオスバン消毒液を1ml/L添加。 常温で持ち帰り、ラボにてフィルトレーション、DNA抽出などを行い、 得られたデータをMitoFishに供与してホモロジー検索を行いました。 その結果、検出される魚種数が増加していることが伺え、検出される 魚種数を増やすためにPCR反復が有効であることが示唆されました。 【事例概要】 ■ラボにてフィルトレーション、DNAを抽出 ■抽出したDNAを用いて、NGSライブラリ調製を行った ■ライブラリ調製は8反復実施 ■調整したライブラリはillumina社のMiseqでシーケンスを行った ■得られたデータをMitoFishに供与してホモロジー検索実施 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ゲノム編集技術は自由な遺伝子改変を可能にするパワフルなツールですが、 改変個体を選抜する上で、遺伝型解析(ジェノタイピング)は重要な工程です。 次世代シーケンスにより、F0世代でのアリル頻度を評価することで、 交配に用いるべき個体選抜を行うことが可能。 また、培養細胞のゲノム編集実験では1度の実験で多様な変異を持つ 細胞集団が得られ、実験条件によって変異の様子が異なります。 次世代シーケンスなら細胞集団の変異を詳細に評価することが出来ます。 【事例概要】 ■CrispRvariantを用いた培養細胞のジェノタイピング ■CRISPR/Casでゲノム編集した培養細胞株からDNA抽出後、 ターゲットアンプリコンシーケンスをMiseqにて実施 ■得られたデータをCrispRvariantにて解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社では、植物の葉に存在する微生物の群集構造解析を目的とした アンプリコンサンプルを調製する際に、植物のミトコンドリアおよび 葉緑体由来の増幅を抑制させる目的にPNAの添加を行い、良好な結果を 得ております。 PNAの添加を行わないと取得データの90％程度がホスト由来の増幅産物の データとなってしまいます。 PNA添加を行うことによって最大で10％程度に抑えることができ、 より解像度の高い餌生物の推定を行うことができています。 【4サンプル単位で条件検討した結果】 ■Ct1-Ct4：PNA添加無し ■Mt1-Mt4：ミトコンドリア用ブロックPNA添加 ■Pl1-Pl4：葉緑体用ブロックPNA添加 ■PM1-PM4：ミトコンドリア用と葉緑体用ブロックPNA添加 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
海洋研究開発機構 深海・地殻内生物圏研究分野の先生より、 新規海洋性プロテオバクテリアを提供いただき、解析した結果を ご紹介します。 次世代シーケンサー(MiSeq)を使用して、シーケンシング解析を行い、 paired-endリードを取得。 取得した生リードをクオリティフィルタリングした後、アセンブルを行い、 さらにドラフトゲノム配列から遺伝子を予測しました。 【事例概要】 ■生リード：7.3M paired-endリード(2x300bp) ■アノテーションデータ ・遺伝子数：2,417 ・rRNA：6 ・tRNA：49 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MLST(Multi locus sequencing typing)解析とは、複数の遺伝子領域 (通常7領域以上)の変異をパターン化して、菌のタイピングを行う方法です。 当解析事例(自社データ)は、単離株のゲノムと環境中の菌同定を想定した 試料(単離株のゲノムに環境DNAに混合したもの)を用意し、タイピングを実施。 用意した株はグラム陽性菌、グラム陰性菌で、これらのサンプルについて Miseqでゲノムシークエンス、タイピングを行いました。 その結果、本手法での解析により、環境DNAに混在した株を同定することが できました。 【事例概要】 ■単離株のゲノムと環境中の菌同定を想定した試料を用意し、 タイピングを行った ■用意した株はBacillus subtilis subsp.subtilis str. 168 (グラム陽性菌)、Pseudomonas protegens Pf-5(グラム陰性菌) ■これらのサンプルについてMiseqでゲノムシークエンス、 タイピングを行った ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『ターゲットアンプリコン解析』は、パッケージ化することによって リーズナブルにご利用できるサービスです。 解析対象領域は、16S V4／18S V9／ITS（gITS7-ITS4）／COI （mlCOIintF-HCO2198）／MiFish（12S V5）など。 解析対象領域を増幅ターゲットとしたサンプル調製用プライマーを 無償提供し、サンプルをお送りいただきます。 その後、当社でQIIME等を使用し、「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」 としてデータを可視化します。 【オプションサービス（抜粋）】 ■解析対象領域長の変更（400-500bp程度） ■Library Mix調製 ■レアファクションカーブと主座標分析（PCoA） ■OTUのBLAST解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』は、パッケージ化することによって リーズナブルにご利用できるサービスです。 受け入れサンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archaea）が可能。 オプションサービスとして、Prokkaを用いたオートアノテーション、 コンティグのBLAST解析、Sequence Typeのタイピングをご用意しております。 ご用命の際は、お気軽にお問い合わせください。 【解析概要】 （1）お客様：抽出したゲノムDNAを当社にご送付 （2）当社：受領サンプルのQC作業を行う （3）当社：MiSeq解析用のアダプターライブラリを調製 （4）当社：MiSeqで2×300 bpランを行う （5）当社：取得データのアセンブルおよびコンティグを作成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った 各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “野生生物の食性解析”の例では、MiSeqを用いた解析で腸内細菌叢の 解析と同様にPCR産物を直接解析。 具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコード オブライフ・イニシャチブで動物のバーコーディングに用いられている COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を行います。 【事例概要】 ■MiSeqを用いた解析では腸内細菌叢の解析と同様にPCR産物を直接解析 ■具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、 COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った 各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “細菌叢の解析”の例では、PCR産物を解析対象として直接塩基配列を 決定し、通常10,000程度はデータが得られます。 さらに、クローンライブラリー法では得ることが非常に難しかった マイナーなグループのデータを得ることができます。 【事例概要】 ■PCR産物を解析対象として直接塩基配列を決定 ■得られる塩基配列のデータは通常10,000を超える ■マイナーなグループのデータが得られる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ゲノム編集ツール『GenomeCraft』の使用事例をご紹介します。 “ダブルノックアウト(ゼブラフィッシュ)”への使用では、Cas9蛋白質と 2つの遺伝子に対するsgRNA又はGENOME CRAFT Type CTを混合し、 ゼブラフィッシュ胚にインジェクションして、発生の様子を観察。 受精1日後にGFPで染色された心臓の形成異常が、2日後には目の色素 形成異常が観察されました。 この他、 “In vitro digestion assay”や“In vivo Genome Editing” “遺伝子ノックイン(マウス)”での使用事例もございます。 【In vitro digestion assay 使用事例】 ■実験内容 ・Cas9蛋白質とsｇRNA又はcrRNA+tracrRNA、基質DNA断片を混合し、 DNA切断実験を行った ■結果：バンドのシフトが確認されたことから、sgRNA、 crRNA+tracrRNAとも良好なDNA切断活性を確認 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
当社が取り扱う、ゲノム編集ツール『GenomeCraft‐ドナーDNA』をご紹介します。 「ssODN(一本鎖オリゴドナーDNA)合成」では、塩基置換やloxPサイト等、 数十塩基までの配列をノックインするドナーDNAとしてご利用可能。 「ssDNA(一本鎖DNA)作製」では、オリゴDNA合成では対応できない長鎖の 一本鎖DNAを作製し、「ターゲティングベクター作製」では、遺伝子ノックアウトや ノックイン等、遺伝子ターゲティング用のドナーDNAを作製いたします。 ご用命の際は、お気軽にお問い合わせください。 【サービス内容】 ■ssODN(一本鎖オリゴドナーDNA)合成 ■ssDNA(一本鎖DNA)作製 ■ターゲティングベクター作製 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ファスマックでは、分子生物学的技術を利用して、2001年の設立以来、 農水省、厚労省関連機関と共同で遺伝子組換え食品や食物アレルゲンの 「日本標準分析法」の技術開発を進めてまいりました。 開発された検査技術は日本のみならず、米国、中国などでも皆様に ご利用いただいております。 また、当社では、設立以来、「分子生物学的技術を用いた食品検査法」の 国際標準化などの活動にも積極的に取り組んでおり、その技術力は国際的に 評価されております。 【事業内容】 ■食品の検査、各種受託サービス ■食品検査試薬の製造・販売、遺伝子工学用試薬の製造・販売 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『GenomeCraft Cas9』は、N末端とC末端の両方に核移行シグナルが 付いたStreptococcus pyogenes由来のCas9タンパク質です。 CRISPR/Casによるゲノム編集で良く使用されている2本鎖切断型 「Cas9タンパク質」と、ターゲット配列のアンチセンス鎖(PAM nGGの相補鎖) のみを切断する1本鎖切断型「Cas9 D10Aニッケース」をご用意。 マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、リポフェクション等で 細胞へ導入してのゲノム編集やin vitroでのDNA切断実験等にお使いいただけます。 【ラインアップ】 ■Cas9タンパク質 ・GE-005-S（容量：100μg） ・GE-005-L（容量：100μg x3） ■Cas9 D10Aニッケース ・GE-006-S（容量：100μg） ・GE-006-L（容量：100μg x3） ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ゲノム編集技術として急速に普及している CRISPR/Cas9 システムですが、 ターゲット配列ごとに特異的なRNAが必要です。 ファスマックの『GENOME CRAFT RNA』なら、お手持ちのCas9とミックスして 細胞に導入するだけで、簡単にゲノム編集が実現可能。 わずらわしい発現ベクター構築や気を遣うRNA調製作業はもう要りません。 ゲノム編集の作業効率化に是非ご活用ください。 【特長】 ■より簡単により多くのターゲットにアプローチできる ■発現ベクター構築や気を遣うRNA調製作業は不要 ■お手持ちのCas9とミックスして細胞に導入するだけで、 簡単にゲノム編集が実現可能 ■化学合成したcrRNAとtracrRNAを用いることで CRISPR/CasシステムのガイドRNAとして機能する ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
ファスマックでは、『STR分析(細胞認証用)』を承っております。 GenePrint24System(プロメガ社)を用いたSTR分析を実施。 キットを用いたMultiplex PCR後に、キャピラリー電気泳動を行い、 CODISやESSローカス、Y染色体ローカス等を含めた特定24か所の STR遺伝子型を判定します。 ご報告するalleleデータを、公共データベース等との照合に 用いることで細胞認証ができます。 【詳細】 ■納期：1週間 ■お送りいただくもの ・DNAサンプル(20ng以上) ※冷蔵便または冷凍便でお送りください ・印刷したオーダーシート ■納品物 ・alleleデータ(エクセル)、波形データ(PDF/fsaファイル) ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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